Protein regije klasterske prelomne tačke'" (BCR), znan I kao antigen bubrežnog karcinoma NY-REN-26 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom BCR' sa hromosoma 22.BCR je jedan od dva gena u kompleksu BCR-ABL'', koji je povezan sa filadelfija hromosomom. Za ovaj gen su pronađene dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.271 aminokiselina, a molekulska težina 142.819 Da.
1020304050 MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVN QERFRMIYLQTLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPA PADGADPPPAEEPEARPDGEGSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPAS VAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNVEFHHERGLVKVNDKEVSDRI SSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSCGVDGDYEDAE LNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQS SRVSPSPTTYRMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVS EATIVGVRKTGQIWPNDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQ DGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRK WVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKV PELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRV TRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMT VKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQ YDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKNDIQR EKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISS DYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVY RDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGK GQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTG VFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQA LKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAE GIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFL QLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
Struktura
thumb|300px| Shema formiranja BCR-ABL putem hromozomske translokacije.
Domen oligomerizacije onkoproteina BCR-ABL koji se nalazi na N-terminalu BCR je od suštinskog značaja za onkogenost fuzijskog protein BCR-ABL. Domen oligomerizacije onkoproteina BCR-ABL sastoji se od kratkog N-terminalnog alfa-heliksa (alfa-1), fleksibilne petlje i dugog C-terminalnog heliksa (alfa-2). Oni zajedno formiraju strukturu u obliku slova N, sa petljom koja omogućava da dva heliksa zauzmu paralelnu orijentaciju. Monomerni domeni povezuju se u dimer, m antiparalelne upredene zavojnice između alfa-heliksa -2 i domena zamjena dva alfa-1 heliksa, pri čemu se jedan alfa-1 heliks okreće unazad i nabije na alfa-2 heliks iz drugog monomera. Dva dimera se zatim povezuju u tetramer.
Funkcija
Iako je BCR-ABL fuzijski protein proučavan bezbroj puta, funkcija normalnog BCR genskog proizvoda još uvijek nije jasna. Protein ima aktivnost serin/treonin kinaza i faktora izmjene gvanin-nukleotida za porodicu Rho GTPaza, uključujući RhoA.
Klinički značaj
Recipročna translokacija između hromosoma 22 i 9 proizvodi filadelfija hromosom, koji se često nalazi kod pacijenata sa hroničnom mijelogenom leukemijom. Prelomna tačka hromosoma 22 za ovu translokaciju nalazi se unutar gena "BCR". Translokacija proizvodi fuzijski protein koji je kodiran sekvencom iz "BCR" i "ABL", gena na tački prekida hromosoma 9.
Interakcije
Pokazalo se da BCR protein u interakciji sa:
Abl gen, CD117, CRKL FES, Grb2, GRB10, HCK, MLLT4, PXN, PIK3CG, PTPN6, PTPRT(PTPrho) SOS1, i XPB.
Također pogledajte Gen Abl
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorijka:Protein kinaze
Kategorija:Geni na hromosomu 22 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika