NLRC5, skraćeno od NOD-liki receptor poreodice CARD domena sa proteinom 5, je unutarćelijski protein koji ima ulogu u imunskom sistemu. NLRC5 je receptor prepoznavanja uzoraka uključen u urođeni imunski sistem na viruse, potencijalno regulacijom aktivnosti interferona. To jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa q kraka hromosoma 16.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1 866 aminokiselina, a molekulska težina 204.595 Da.
1020304050 MDPVGLQLGNKNLWSCLVRLLTKDPEWLNAKMKFFLPNTDLDSRNETLDP EQRVILQLNKLHVQGSDTWQSFIHCVCMQLEVPLDLEVLLLSTFGYDDGF TSQLGAEGKSQPESQLHHGLKRPHQSCGSSPRRKQCKKQQLELAKKYLQL LRTSAQQRYRSQIPGSGQPHAFHQVYVPPILRRATASLDTPEGAIMGDVK VEDGADVSISDLFNTRVNKGPRVTVLLGKAGMGKTTLAHRLCQKWAEGHL NCFQALFLFEFRQLNLITRFLTPSELLFDLYLSPESDHDTVFQYLEKNAD QVLLIFDGLDEALQPMGPDGPGPVLTLFSHLCNGTLLPGCRVMATSRPGK LPACLPAEAAMVHMLGFDGPRVEEYVNHFFSAQPSREGALVELQTNGRLR SLCAVPALCQVACLCLHHLLPDHAPGQSVALLPNMTQLYMQMVLALSPPG HLPTSSLLDLGEVALRGLETGKVIFYAKDIAPPLIAFGATHSLLTSFCVC TGPGHQQTGYAFTHLSLQEFLAALHLMASPKVNKDTLTQYVTLHSRWVQR TKARLGLSDHLPTFLAGLASCTCRPFLSHLAQGNEDCVGAKQAAVVQVLK KLATRKLTGPKVVELCHCVDETQEPELASLTAQSLPYQLPFHNFPLTCTD LATLTNILEHREAPIHLDFDGCPLEPHCPEALVGCGQIENLSFKSRKCGD AFAEALSRSLPTMGRLQMLGLAGSKITARGISHLVKALPLCPQLKEVSFR DNQLSDQVVLNIVEVLPHLPRLRKLDLSSNSICVSTLLCLARVAVTCPTV RMLQAREADLIFLLSPPTETTAELQRAPDLQESDGQRKGAQSRSLTLRLQ KCQLQVHDAEALIALLQEGPHLEEVDLSGNQLEDEGCRLMAEAASQLHIA RKLDLSNNGLSVAGVHCVLRAVSACWTLAELHISLQHKTVIFMFAQEPEE QKGPQERAAFLDSLMLQMPSELPLSSRRMRLTHCGLQEKHLEQLCKALGG SCHLGHLHLDFSGNALGDEGAARLAQLLPGLGALQSLNLSENGLSLDAVL GLVRCFSTLQWLFRLDISFESQHILLRGDKTSRDMWATGSLPDFPAAAKF LGFRQRCIPRSLCLSECPLEPPSLTRLCATLKDCPGPLELQLSCEFLSDQ SLETLLDCLPQLPQLSLLQLSQTGLSPKSPFLLANTLSLCPRVKKVDLRS LHHATLHFRSNEEEEGVCCGRFTGCSLSQEHVESLCWLLSKCKDLSQVDL SANLLGDSGLRCLLECLPQVPISGLLDLSHNSISQESALYLLETLPSCPR VREASVNLGSEQSFRIHFSREDQAGKTLRLSECSFRPEHVSRLATGLSKS LQLTELTLTQCCLGQKQLAILLSLVGRPAGLFSLRVQEPWADRARVLSLL EVCAQASGSVTEISISETQQQLCVQLEFPRQEENPEAVALRLAHCDLGAH HSLLVGQLMETCARLQQLSLSQVNLCEDDDASSLLLQSLLLSLSELKTFR LTSSCVSTEGLAHLASGLGHCHHLEELDLSNNQFDEEGTKALMRALEGKW MLKRLDLSHLLLNSSTLALLTHRLSQMTCLQSLRLNRNSIGDVGCCHLSE ALRAATSLEELDLSHNQIGDAGVQHLATILPGLPELRKIDLSGNSISSAG GVQLAESLVLCRRLEELMLGCNALGDPTALGLAQELPQHLRVLHLPFSHL GPGGALSLAQALDGSPHLEEISLAENNLAGGVLRFCMELPLLRQIDLVSC KIDNQTAKLLTSSFTSCPALEVILLSWNLLGDEAAAELAQVLPQMGRLKR VDLEKNQITALGAWLLAEGLAQGSSIQVIRLWNNPIPCDMAQHLKSQEPR LDFAFFDNQPQAPWGT
Funkcija Nedavno je sugerisano da NLRC5 ima pozitivnu ulogu u regulaciji ekspresije molekula MHC klase I glavnog komleksa iistokompatibilnosti (MHCI). Ovaj aspekt funkcije NLRC5 dalje je istražen uz pomoć Nlrc5-deficitarnih miševa, koji je pokazao smanjenu ekspresiju MHCI u limfocitima (posebno T, NK i NKT limfocitima). U limfocitima, NLRC5 se nalazi u na jedru i pokreće ekspresiju gena MHCI, zauzimanjem H-2D i H-2K genskih promotora.
Kod ljudi, NLRC5 protein je kodiran "NLRC5" genom. Također je nazvan i kao NOD27, NOD4 i CLR16.1.
Reference
Kategorija:LRR proteini Kategorija:Receptori NOD Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika