La llista d'abats de Sant Esteve de Banyoles comença el 812 amb l'abat Bonit i acaba el 1835 amb Lluís de Fluvià, per bé que segons la llegenda, el primer abat i fundador del monestir fou Emeri de Banyoles.
Bonit 812-822 Mercoral 822 Elies 844 Pere 854-866 Ansemon 870-880 Sunifred 889 Acfred 916 Luns 928 Acfred 935-957 Bonfill 979 Gademir 999-1099 Bonfill 1017 Andreu 1047-1050 Benet 1078-1097 Pere 1121-1124 Ramon Guillem 1125?-1130 Berenguer 1140-1149? Ricard 1154 Hug 1172 Ramon de Cabanyes 1172-1175 Pere Benet 1190-1196 Ramon 1196-1207 Bernat 1226 Guillem de Cartellà i de Creixell 1226-1252 Ramon de Corsavell (1252) Pere 1252-1253 Guilem Ramon de Navarro 1257-1263 Guillem 1263-1265 Benet 1267 Arnau de Vallespirans1268-1300 Bernat de Vallespirans 1300-1333 Ramon del Coll 1333-1340 Arnau de Samasó 1340-1356 Bernat Cavaller 1356-1361 Ponç de Canadal 1362-1370 Joan Desprat 1370-1401 Bernat Estruç 1401-1409 Guillem de Pau i Amorós 1409-1443 Dalmau de Canadal 1443-1459 Francesc de Xetmar i de Juià 1461-1503 Juan de Vera 1503-1507 Martirià Prats 1507-1510 Miquel Sampsó 1510-1544 Rafael Ubach 1544-1556 Bernat de Cardona 1556-1558 Bernat de Marlès i de Malla 1558-1562 Lluís d'Argençola 1562-1570 Antich Vilalba 1572-1583 Bartomeu de Montagut de Vallgornera i de Setantí 1596-1610 Lluís d'Alentorn i de Serrateix 1611-1617 Antoni de Cartellà i d'Alemany Descatllar 1618-1622 Antonio Mantilla 1622-1640 Francesc de Montpalau i de Solanell 1642-1674 Antoni de Planella i de Cruïlles 1675-1688. 113è President de la Generalitat de Catalunya Dimes de Malla i Gualbes 1688-1702 Joan Baptista de Descatllar i Tord 1703-1744 Ramon de Padró i Serrals 1745-1758 Antoni Salvador de Otamendi 1757-1758 Ignasi de Francolí i Sabater 1761-1780 Josep Gregori de Montero i d'Alòs 1781-1789. Passa a ser abat del Monestir de Sant Cugat. Ignasi de Gras de Taberner 1789-1792 Joaquim de Laplana i de Natota 1792-1803 Josep de Guanter 1805-1810 Benet d'Olmera 1816-1831 Lluís de Fluvià i de Berart 1833-1835
Bibliografia Francesc Montsalvatge, Notícias Históricas, vol XVI, Olot 1904, pàg. 48-59
Sant Esteve de Banyoles