Aquesta és una llista que conté les diferents banderes que s'utilitzen o s'han utilitzat a la República d'Estònia.

Bandera nacional Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera d'Estònia 1918-1940 i 1990-avui dia Bandera nacional Tres franges horitzontals de colors blau, negre i blanc. Proporcions de 7:11.

Propostes Dissenys proposats per a modificar l'actual bandera nacional. Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera del ducat Bàltic Unit 1918 Proposat de creació del Ducat Bàltic Unit Camp blanc amb una creu nòrdica en negre. 100px|border 1919 Proposta Sobre el disseny actual, una creu nòrdica negra fimbriada de blanc i negre. 100px|border 2019 Proposta Camp blau amb una creu blanca fimbriada de negre. 100px|border 2019 Proposta Variació de la proposta anterior. Camp blanc amb una creu blava fimbriada de negre.

Històriques Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera de l'RSS d'Estònia 1953-1990 República Socialista Soviètica d'Estònia Sobre un camp vermell, un estel buida de cinc puntes, una falç i un martell grocs al quarter, i al vol una banda d'ones de blau i blanc prop del marge inferior. 100px|border|Bandera de l'RSS d'Estònia (1940–1953) 1940–1953 República Socialista Soviètica d'Estònia Camp vermell carregat al quarter amb la falç i el martell sota les sigles ENSV per Eesti Nõukogude Sotsialistlik Vabariik en groc. 100px|border|Bandera de la Comuna dels Treballadors d'Estònia 1918–1919 Comuna dels Treballadors d'Estònia. Camp vermell amb el quarter groc que porta els noms Eesti Töörahva Kommuuna en estonià i ''Эстляндская трудовая коммуна" en rus. 100px|border|Bandera del Ducat Bàltic Unit 1918 Ducat Bàltic Unit o Gran Ducat de Livònia. Camp blanc amb una creu nòrdica en negre. símbol utilitzat per l'Orde Teutònic. 100px|border|Bandera de la República Soviètica de Soldats i Constructors de Fortaleses de Naissaar 1917-1918 República Soviètica de Soldats i Constructors de Fortaleses de Naissaar Bandera vista en una fotografia dels mariners russos del cuirassat Petropavlovsk de la Marina Imperial Russa a Hèlsinki durant l'estiu de 1917. La bandera mostra una llança i una dalla creuades l'una sobre l'altra, així com una calavera i dos ossos creuats per sobre i per sota de la llança i la dalla. La part superior conté el text "смерть буржуямъ" ("Mort als burgesos") 100px|border 1858–1896 Imperi Rus Tres franges horitzontals de colors negre, groc i blanc. 100px|border 1721–1917 Imperi Rus Tres franges horitzontals de colors blanc, blau i vermell. 100px|border|Bandera de la Governació d'Estònia 1721-1918 Governació d'Estònia Tres franges horitzontals de colors verd, morat i blanc. 100px 1561–1721 Ducat d'Estònia també conegut com a «Estònia sueca». Bandera naval sueca. 100px|border 1219–1645 Ducat d'Estònia, sota domini del regne de Dinamarca. Bandera del regne de Dinamarca. 100px|border|Bandera del ducat d'Estònia 1207-1561 Terra Mariana també coneguda com a «Confederació livoniana» o «Livònia medieval». Bandera de l'Orde Teutònic.

Comtats Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera del comtat de Harju 1939-avui dia Comtat de Harju Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Hiiu 1996-avui dia Comtat de Hiiu Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat d'Ida-Viru 1997-avui dia Comtat d'Ida-Viru Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Jõgeva 1996-avui dia Comtat de Jõgeva Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Järva 1939-avui dia Comtat de Järva Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Lääne 1939-avui dia Comtat de Lääne Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Lääne-Viru 1996-avui dia Comtat de Lääne-Viru Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Põlva 1996-avui dia Comtat de Põlva Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Pärnu 1939-avui dia Comtat de Pärnu Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Rapla 1996-avui dia Comtat de Rapla Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Saare 1939-avui dia Comtat de Saare Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Tartu 1939-avui dia Comtat de Tartu Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Valga 1939-avui dia Comtat de Valga Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Viljandi 1939-avui dia Comtat de Viljandi Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca. 100px|border|Bandera del comtat de Võru 1939-avui dia Comtat de Võru Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca.

Històrics Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera del comtat de Petseri 1939-1940 Antic comtat de Petseri Camp dividit horitzontalment en dues meitats, blanca la superior i verda la inferior, i l'escut del comtat al centre de la meitat blanca.

Municipals Relació de banderes de les capitals dels comtats estonians. Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera de Tallinn Tallinn (Comtat de Harju) Tres franges horitzontals blaves i blanques alternes. La relació de proporció és de 2:1 (també 3:1). Kärdla (Comtat de Hiiu) 100px|border|Bandera de Jõhvi Jõhvi (Comtat d'Ida-Viru) Camp blanc amb dues franges horitzontals verdes al centre. Proporcions 1:2. 100px|border|Bandera de Paide Paide (Comtat de Järva) Dividida en dues parts: la primera part (1/3 de la llargada) està dividida en tres franges horitzontals sent la del mig la meitat d'ample: verda, blanca i verda. La segona part (2/3) també dividida en tres franges horitzontals contracanviades de color. Proporcions 1:2. 100px|border|Bandera de Jõgeva Jõgeva (Comtat de Jõgeva) Quatre franges horitzontals grogues i verdes alternes. 100px|border|Bandera de Haapsalu 1930 Haapsalu (Comtat de Lääne) Dividida en dues parts: la primera part (1/3 de la llargada) està dividida en tres franges horitzontals d'igual mida: blava, blanca i blava; la segona part (2/3) també dividida en tres franges horitzontals contracanviades de color. Proporcions 1:2. 100px|border|Bandera de Rakvere 1994 Rakvere (Comtat de Lääne-Viru) Consta de dues franges blau cel de 3/7 d'amplada i una de groga d'1/7 d'amplada situada entre les blaves. 100px|border|Bandera de Pärnu 1993 Pärnu (Comtat de Pärnu) Camp blau amb una creu nòrdica blanca. Proporcions 1:2. 100px|border|Bandera de Põlva 1995 Põlva (Comtat de Põlva) Des de la part superior tres franges de la mateixa amplada de verd, blanc i blau marí fins al mig i després blau, blanc i verd fins a la part inferior. Com que dues franges blaves es troben al mig de la bandera, formen una franja més ampla, al centre de la qual hi ha l'escut de la ciutat de Põlva. Rapla (Comtat de Rapla) 100px|border|Bandera de Kuressaare 2010 Kuressaare (Comtat de Saare) Camp blau amb dues franges estretes blanques a la part superior i inferior. Al centre l'escut d'armes de la ciutat. Proporció 1:2. 100px|border|Bandera de Tartu 1992 Tartu (Comtat de Tartu) Dividida horitzontalment en dues meitats, sent blanca la superior i vermella la inferior. Al centre carrega l'escut de la ciutat. Proporció 1:2. 100px|border|Bandera de Valga 1997 Valga (Comtat de Valga) Tres franges horitzontals verda, blanca i verda; sent la blanca la meitat d'amplada que les de color verd. Proporció 7:11. 100px|border|Bandera de Viljandi 1992 Viljandi (Comtat de Viljandi) Dividida horitzontalment en dues meitats, sent blau cel la superior i blanca la inferior. Proporció 1:2. 100px|border|Bandera de Võru 1994 Võru (Comtat de Võru) Tres franges horitzontals groga, verda i groga, sent la verda el doble d'ampla que les grogues.

Minories Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera dels germanobàltics 1918–avui dia Germanobàltics Dividida horitzontalment en dues meitats, sent blau cel la superior i blanca la inferior. 100px|border|Bandera Mulgi 2013–avui dia Mulgi Dividida verticalment en dues parts, negra la de l'esquerra i blau cel la dreta; separant-les un patró vermell sobre fons blanc. El disseny es va triar per votació entre cinc opcions. 100px|border|Bandera dels Setos 2003 Setos Camp blanc amb una creu nòrdica formada per un patró típic d'aquest poble. Fou escollida d'entre quatre dissenys durant el VII Congrés Setos a Obinitsa el 2003. 100px|border|Bandera dels estonians suecs 1996–avui dia Suecs estonians Dividida horitzontalment en tres franges, blau la superior, negra la del mig i groga la inferior. Seria la bandera d'Estònia canviant la franja blanca per una de groga. 100px|border|Bandera Vòtica 2002 Vòtics Fou dissenyada pel poeta i artista Aleksandr Gurinov. Camp blanc calçat de blau cel i una creu vermella. 100px|border|Bandera Voros 2013 Võros Camp verd fosc carregat amb un antic emblema protector en blanc que simbolitza cadascuna de les vuit parròquies de l'antiga Võromaa.

Banderes personals Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Bandera del president d'Estònia 1927–19401911–avui dia Bandera personal del President de la República. Bandera nacional amb l'escut d'armes al centre. 100px|border|Bandera del Ministre de Defensa d'Estònia Bandera personal del Ministre de Defensa. Bandera nacional amb l'escut d'armes menor lleugerament descentrat cap al pal.

Militars Bandera Data Ús Descripció 100px|border|Estendard de les Forces de Defensa Estonianes 2008-avui dia Estendard Forces de Defensa Estonianes Bandera heràldica de l'escut d'armes d'Estònia. 100px|border|Bandera de l'Exèrcit de Terra estonià Exèrcit de Terra Bandera heràldica de l'escut d'armes de l'Exèrcit de terra. 100px|border|Ensenya naval d'Estònia 1926–19401991-avui dia Ensenya naval Bandera nacional amb l'escut d'armes menor. 100px|border|Bandera de proa d'Estònia 1926–19401991-avui dia Bandera de proa Camp blanc amb un sautor negre i sobreposada una creu blava amb els braços fins les vores. Els braços de la creu són el doble d'ample que els del sautor. Proporció 7:11. 100px|border|Bandera de la Força Aèria d'Estònia Força Aèria Camp blanc amb l'emblema de la Força Aèria, una àliga amb les ales desplegades que aguanta una espasa i l'escarapel·la aeronàutica.

Banderes polítiques