La Llei de l'estat espanyol 42/2007, de 13 de desembre, del patrimoni natural i de la biodiversitat, estableix que les comunitats autònomes poden establir catàlegs d'espècies amenaçades i determinar les prohibicions i actuacions suplementàries que es considerin necessàries per a la seva preservació.

A l'empara d'aquesta llei es va aprovar el Decret 172/2008, de 26 d'agost, mitjançant el qual es va crear el Catàleg de flora amenaçada de Catalunya.

Aquests catàlegs necessàriament han d'anar evolucionant en el temps per adaptar-se al nou coneixement que es va obtenint sobre l'estat de la biodiversitat a Catalunya. Per això és va aprovar la RESOLUCIÓ AAM/732/2015, i posteriorment la RESOLUCIÓ ACC/3929/2023 de 20 de novembre, per la qual s'aprova la catalogació, descatalogació i canvi de categoria d'espècies i subespècies del Catàleg de flora amenaçada de Catalunya.

A la següent llista, primer hi ha les plantes vasculars (pteridòfits i plantes amb flors) tal com consten al Catàleg de flora amenaçada de Catalunya aprovat l'any 2023 i les indicacions dels canvis de categoria que hi ha hagut entre una i altres resolució.

S'han mantingut aquells taxons que havien estat en el catàleg fins a l'any 2023, encara que ja no hi siguin (indicant-ho amb una nota), en el benentès que aquestes espècies segueixen tenint un cert interès per a la seva conservació en els indrets en els que es troben. En els taxons que han canviat de nom a la resolució del 2023 també s'ha indicat el nom antic que sortia publicat a la resolució del 2015.

A continuació, s'inclouen també les espècies de plantes no vasculars (briòfits en sentit ampli i algues), fongs i líquens separades pel seu grup principal, encara que de vegades aquest no tingui valor taxonòmic.

Els taxons que consten a l'annex 1 són considerades com a espècies i subespècies en perill d'extinció. L'annex 2 inclou a les espècies i subespècies catalogades com a vulnerables:RESOLUCIÓ AAM/732/2015, de 9 d'abril, per la qual s'aprova la catalogació, descatalogació i canvi de categoria d'espècies i subespècies del Catàleg de flora amenaçada de Catalunya.

Plantes vasculars (traqueobionts) Annex 1: Achillea maritima (L.) Ehrendorfer & Y.P. Guo subsp. maritima (Asteràcies)(citada anteriorment com Otanthus maritimus) Annex 2: Aira praecox L. protegides les poblacions fora de la Val d'Aran (Poàcies) Annex 2: Airopsis tenella (Cav.) Coss. & Durieu (Poàcies) Annex 2: Alchemilla pentaphyllea L. (Rosàcies) Annex 2: Allium pyrenaicum Costa & Vayreda (Amarilidàcies) Annex 1: Anacamptis palustris (Jacq.) R.M. Bateman, Pridgeon & M.W. Chase subsp. palustris (Orquidàcies)(citada anteriorment com Orchis laxiflora subsp. palustris) Annex 2: Anemone palmata L. (Ranunculàcies) Annex 2: Anthemis alpestris (Hoffmanns. & Link) R. Fern. (Asteràcies) Annex 1: Anthericum ramosum L. (Antericàcies) Annex 2: Antirrhinum pertegasii Rothm. (Plantaginàcies) Annex 1: Aquilegia paui Font Quer (Ranunculàcies) Annex 2: Arabis nova Vill. subsp. iberica Rivas-Mart. ex Talavera (Brassicàcies) Annex 2: Arabis soyeri Reut. & A. Huet subsp. soyeri (Brassicàcies) Annex 2: Arenaria conimbricensis Brot. subsp. viridis (Font Quer) Font Quer (Cariofil·làcies) Annex 2: Arenaria fontqueri Cardona & J.M. Monts. subsp. cavanillesiana (Font Quer) Cardona & J.M. Monts. (Cariofil·làcies) Annex 2: Arenaria marschlinsii W.D.J. Koch (Cariofil·làcies) Annex 2: Arisarum simorrhinum Durieu (Aràcies) Annex 2: Armeria fontqueri Pau (Plumbaginàcies) Annex 2: Asphodelus ramosus L. subsp. ramosus (Asfodelàcies) Annex 2: Asplenium majoricum Litard. (Aspleniàcies)(citada anteriorment com Asplenium petrarchae subsp. majoricum) Annex 1: Asplenium marinum L. (Aspleniàcies) Annex 2: Asplenium obovatum Viv. subsp. obovatum (Aspleniàcies) Annex 1: Asplenium sagittatum (DC.) Bange (Aspleniàcies) Annex 2: Asplenium seelosii Leybold subsp. catalaunicum (O. Bolòs & Vigo) P. Monts. (Aspleniàcies) Annex 1: Asplenium inexpectans Lovis (Aspleniàcies) (citada anteriorment com Asplenium trichomanes ssp. inexpectans) Annex 2: Astragalus austriacus Jacq. (Fabàcies) Annex 2: Astragalus penduliflorus Lam. (Fabàcies) Annex 1: Atropa baetica Willk. (Solanàcies) Annex 2: Berberis garciae Pau (Berberidàcies)(citada anteriorment com Berberis vulgaris subsp. seroi) Annex 1: Bidens cernuus L. (Asteràcies) Annex 2: Blitum petiolare Link (Amarantàcies) (=Chenopodium exsuccum) Annex 1: Botrychium matricariifolium A. Braun ex W.D.J. Koch (Botriquiàcies) Annex 2: Bunium bulbocastanum L. (Apiàcies) Annex 1: Butomus umbellatus L. (Butomàcies) Annex 2: Callipeltis cucullaris (L.) DC. (Rubiàcies) Annex 2: Callitriche platycarpa Kütz ex Rchb. (Cal·litricàcies) Annex 2: Cardamine parviflora L. (Brassicàcies) Annex 2: Carex brachystachys Schrank (Ciperàcies) Annex 2: Carex brevicollis DC. (Ciperàcies) Annex 1: Carex diandra Schrank (Ciperàcies) Annex 2: Carex elata All. subsp. elata (Ciperàcies) Annex 2: Carex lachenalii Schkuhr subsp. lachenalii (Ciperàcies) Annex 2: Carex lasiocarpa Ehrh. (Ciperàcies) Annex 2: Carex limosa L. (Ciperàcies) Annex 2: Centaurea loscosii Willk. (Asteràcies) Annex 2: Centaurea podospermifolia Loscos & J. Pardo (Asteràcies) Annex 2: Centaurea seridis L. (Asteràcies) Annex 1: Centaurea tripontina López-Alvarado, L. Sáez, Filigheddu, Guardiola & Susanna (Asteràcies) Annex 2: Centaurium quadrifolium subsp. parviflorum (Willk.) Pedrol (Gencianàcies)(citada anteriorment com Centaurium favargeri) Annex 1: Ceratophyllum submersum L. (Ceratofil·làcies) Annex 1: Cerinthe glabra Mill. subsp. glabra(Boraginàcies) Annex 2: Chaenorhinum reyesii (C. Vicioso & Pau) Benedí (Plantaginàcies) Annex 1: Chrysosplenium alternifolium L. (Saxifragàcies) Annex 2: Cicendia filiformis (L.) Delarbre (Gencianàcies) Annex 2: Cistus halimifolius L. (Cistàcies)(citada anteriorment com Halimium halimifolium) Annex 2: Cistus populifolius L. subsp. populifolius (Cistàcies) Annex 2: Cneorum tricoccon L. (Cneoràcies) Annex 2: Cochlearia pyrenaica DC. (Brassicàcies) Annex 2: Convolvulus siculus L. subsp. siculus(Convolvulàcies) Annex 1: Corallorhiza trifida Châtel. (Orquidàcies) Annex 2: Cosentinia vellea (Aiton) Tod. subsp. vellea Hemionitidàcies) Annex 1: Cypripedium calceolus L. (Orquidàcies) Annex 1: Daphne alpina L. (Timeleàcies) Annex 1: Delphinium bolosii C. Blanché & Molero (Ranunculàcies) Annex 2: Delphinium montanum DC. (Ranunculàcies) Annex 1: Dichoropetalum schottii (DC.) Pimenov & Kljuykov (citada anteriorment com Peucedanum schotii) Annex 2: Draba fladnizensis Wulfen (Brassicàcies) Annex 1: Dracocephalum austriacum L. (Lamiàcies) Annex 2: Dracocephalum ruyschiana L. (Lamiàcies) Annex 2: Drosera intermedia Hayne (Droseràcies) Annex 2: Drosera anglica Huds. (Droseràcies)(citada anteriorment com Drosera longifolia) Annex 2: Dryopteris mindshelkensis Pavlov (Driopteridàcies) Annex 2: Dryopteris remota (A. Braun ex Dôll) Druce (Driopteridàcies) Annex 1: Echium arenarium Guss. (Boraginàcies) Annex 1: Elatine alsinastrum L. (Elatinàcies) Annex 2: Elatine brochonii Clavaud (Elatinàcies) Annex 1: Elatine gussonei (Sommier) Brullo, Lanfr., Pavone & Ronsisv. (Elatinàcies) Annex 2: Elatine macropoda Guss. (Elatinàcies) Annex 2: Epilobium alpestre (Jacq.) Krock. (Onagràcies) Annex 2: Epipactis leptochila (Godfery) Godfery (Orquidàcies) Annex 1: Epipogium aphyllum Sw. (Orquidàcies) Annex 2: Equisetum fluviatile L. (Equisetàcies) Annex 2: Erica tetralix L. (Ericàcies) Annex 1: Erica vagans L. (Ericàcies) Annex 2: Erodium foetidum subsp. celtibericum (Pau) O. Bolòs & Vigo(Geraniàcies)(citada anteriorment com Erodium celtibericum) Annex 1: Erodium foetidum (L.) L'Hér. subsp. foetidum (Geraniàcies)(citada anteriorment com Erodium foetidum subsp. crispum) Annex 2: Erodium lucidum Lapeyr. (Geraniàcies) Annex 2: Erodium neuradifolium Delile (Geraniàcies) Annex 1: Erodium sanguis-christi Sennen (Geraniàcies) Annex 2: Euphorbia duvalii Lecoq & Lamotte (Euforbiàcies) Annex 2: Euphorbia palustris L. (Euforbiàcies) Annex 2: Ferula loscosii (Lange) Willk. (Apiàcies) Annex 1: Festuca paucispicula Fuente & Sánchez-Mata (Poàcies) Annex 2: Filago carpetana (Lange) Chrtek & Holub (Asteràcies) Annex 2: Filago lusitanica (Samp.) P. Silva (Asteràcies) Annex 2: Fumaria bicolor Nicotra (Papaveràcies) Annex 1: Gagea pratensis (Pers.) Dumort. (Liliàcies) Annex 2: Gagea reverchonii Degen(Liliàcies) Annex 2: Galatella aragonensis (Asso) Nees (Asteràcies) Annex 2: Galium scabrum L. (Rubiàcies) Annex 1: Gentiana angustifolia Vill.(Gencianàcies) (citada anteriorment com Gentiana acaulis subsp. angustifolia) Annex 1: Gentiana pneumonanthe L. (Gencianàcies) Annex 1: Geranium divaricatum Ehrh. (Geraniàcies) Annex 2: Geranium lanuginosum Lam. (Geraniàcies) Annex 2: Glandora oleifolia (Lapeyr.) Thomas. (Boraginàcies)(citada anteriorment com Lithospermum oleifolium) Annex 1: Gymnadenia odoratissima (L.) Rich. (Orquidàcies) Annex 1: Gypsophila tomentosa L. (Cariofil·làcies) Annex 1: Hackelia deflexa (Wahlenb.) Opiz (Boraginàcies)(citada anteriorment com Lappula deflexa) Annex 2: Herniaria alpina Chaix (Cariofil·làcies) Annex 2: Hesperis laciniata All. subsp. laciniata(Brassicàcies) Annex 2: Hieracium queraltense de Retz (Asteràcies) Annex 2: Hieracium recoderi de Retz (Asteràcies) Annex 1: Hieracium pii-fontii Mateo, L. Sáez, Egido & Gómiz (Asteràcies)(incl. Hieracium vinyasianum Font Quer) Annex 1: Hippuris vulgaris L. (Hippuridàcies) Annex 1: Holandrea schottii (Besser ex DC.) Reduron, Charpin & Pimenov (Apiàcies) Annex 1: Hydrocharis morsus-ranae L. (Hidrocaritàcies) Annex 1: Hydrocotyle vulgaris L. (Apiàcies) Annex 1: Hypericum elodes L. (Gutíferes) Annex 2: Hypericum linariifolium Vahl (Gutíferes) Annex 2: Isoetes durieui Bory (Isoetàcies) Annex 2: Isoetes delilei Rothm. (Isoetàcies)(citada anteriorment com Isoetes setaceum) Annex 2: Isoetes longissima Bory subsp. velatum (Isoetàcies)(citada anteriorment com Isoetes velatum) Annex 2: Jacobaea auricula (Coss.) Pelser (Asteràcies)(citada anteriorment com Senecio auricula var. sicoricus) Annex 1: Jacobaea erratica (Bertol.) Fourr. (citada anteriorment com Senecio aquaticus subsp. erraticus) Annex 1: Jasione crispa Boiss. & Reut. (Campanulàcies) protegida als Ports i muntanyes de Prades (citada anteriorment com Jasione sessiliflora) Annex 2: Juncus heterophyllus Dufour (Juncàcies) Annex 2: Juncus balticus Willd. subsp. pyrenaeus (Jeanb. & Timb.-Lagr.) P. Fourn (Juncàcies)(citada anteriorment com Juncus pyrenaeus ) Annex 1: Juncus littoralis C.A. Mey. (Juncàcies) Annex 2: Juniperus turbinata Guss. (Cupressàcies)(citada anteriorment com Juniperus phoenicea subsp. turbinata) Annex 2: Juniperus thurifera L. (Cupressàcies) Annex 2: Kosteletzkya pentacarpa (L.) Ledeb. (Malvàcies) Annex 1: Lappula deflexa (Wahlenb.) Cesati (Boraginàcies) Annex 2: Lathyrus bauhinii Genty (Fabàcies) Annex 1: Lemna trisulca L. (Aràcies) Annex 2: Leontodon crispus Vill. subsp. crispus (Asteràcies) Annex 2: Leontopodium nivale subsp. alpinum (Cass.) Greuter (Asteràcies)(citada anteriorment com Leontopodium alpinum) Annex 1: Lepidium hirtum (L.) Sm. subsp. calycotrichum (Kunze) Thell. (Brassicàcies) Annex 2: Limoniastrum monopetalum (L.) Boiss. (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium auriculae-ursifolium (Pourr.) Druce (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium bellidifolium (Gouan) Dumort. (Plumbaginàcies) Annex 1: Limonium catalaunicum (Willk. & Costa) Pignatti (Plumbaginàcies) Annex 1: Limonium costae (Willk.) Pignatti (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium densissimum (Pignatti) Pignatti (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium geronense Erben (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium gibertii (Sennen) Sennen (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium girardianum (Guss.) Fourr. (Plumbaginàcies) Annex 1: Limonium ilergabonum López-Alvarado, I. Cobacho, V.J. Arán & L. Sáez (Plumbaginàcies) Annex 2: Limonium latebracteatum Erben (Plumbaginàcies)