Katolická církev prošla perzekucí jak za nacismu, tak komunismu. V obou obdobích se samozřejmě našly také případy duchovních, kteří kolaborovali. Nacismus již v roce 1937 odsoudil encyklikou Mit brennender Sorge papež Pius XI. Přehled perzekvovaných duchovních za nacistické éry se pokusil v obsáhlé knize "A kdo vás zabije ..." podat již v roce 1946 český kněz, P. Bedřich Hofmann. Níže uvedený seznam zahrnuje české katolické kněze a řeholníky, kteří byli nacismem pronásledováni, není však zcela kompletní.

Seznam perzekvovaných katolických kněží a řeholníků

A Josef Absolon, kněz olomoucké arcidiecéze, v letech 1941–1945 vězněn Jan Absolon, kněz olomoucké arcidiecéze, vězněn 1938 (zabrané Sudety), mladší bratr Josefa Absolona Josef Adamecki, zatčen 16. dubna 1943 a zavražděn 26. května 1944 v Osvětimi. Sebastian Aigner, karlovarský redemptorista. Byl vězněn v káznici. Robert Albrecht. Jezuita německé národnosti, scholastik 3. ročníku. Poprava byla vykonána 17. září 1942 v Berlíně-Brandenburgu Eduard Allebrod. Kněz německé národnosti, pallotin v Kunštátu u Orlického Záhoří. Na svobodu propuštěn z Dachau 4. dubna 1945 Josef Aranauskas, jezuita-bohoslovec litevské národnosti. Internován v lednu 1944, v Zásmukách a v Terezíně Josef August, kněz německé národnosti. Administrátor v Řehlovicích (d. Litoměřická) vězněn v Dachau do 4. dubna 1945

B Josef Baránek, kněz a katecheta ve Valašských Kloboukách, zemřel 7. července 1941 na infarkt po návratu z výslechu na gestapu Vojtěch Bartoš, SJ, jezuita působící v Praze u sv. Ignáce na Karlově náměstí, v letech 1944–1945 vězněn Gilbert Jan Bednář, O.Praem., novoříšský premonstrát, v letech 1942–1945 vězněn Josef Beneš, kněz, katecheta na gymnáziu v Jičíně, vězněn v Dachau ThDr. Josef Beran, rektor kněžského semináře v Praze, pozdější arcibiskup pražský a kardinál, v letech 1942–1945 vězněn Maxmilián Beran, kněz a katecheta v Praze, vyvezen z Dachau na smrt transportem invalidů Antonín Blažek, SJ, scholastik jezuitského řádu, v letech 1944–1945 vězněn, po roce 1948 perzekvován i komunisty Engelbert Blöchl, O.Cist., vyšebrodský cisterciák rakouského původu, kaplan v Přídolí, zemřel v Dachau Antonín Bořek-Dohalský, kanovník, zemřel v Osvětimi Aleš Bouz, OP, zatčen v roce 1942, dne 3. dubna 1943 ubit v Osvětimi Evermod Karel Burda, O.Praem., želivský premonstrát, v letech 1943-1945 na nucených pracích v Německu

C Mons. Jan Cais, kapitulní vikář českobudějovické diecéze, v letech 1944-1945 vězněn Josef Cukr, SJ, jezuita, v letech 1944–1945 vězněn v Terezíně a v Praze na Pankráci

Č Alois Čáp, kněz olomoucké arcidiecéze, v letech 1939–1945 vězněn Jiří Čech, bohoslovec, v letech 1944–1945 vězněn za urážku Hitlera Vladimír Čermák, kněz olomoucké arcidiecéze, farář ve Vlachovicích, zemřel v Dachau František Černý, kněz olomoucké arcidiecéze, v letech 1939–1945 vězněn Jan Černý, probošt katedrální kapituly v Hradci Králové, v roce 1941 zatčen, 11. února 1944 zemřel na následky věznění František Antonín Červenka, OSB, rajhradský benediktin, vězněn v Praze na Pankráci, zemřel na následky mučení 20. listopadu 1944 Jan Číhal, kněz brněnské diecéze, kaplan v Bučovicích, zemřel v Osvětimi Polykarp Čížek, OH, Milosrdný bratr, vězněn od roku 1941

D Bernard Václav David, O.Praem., želivský premonstrát, zemřel v Terezíně Ignác Dragoun, kněz olomoucké arcidiecéze, farář v Prostějově, v letech 1939-1941 vězněn v Buchenwaldu Karel Dřímal, kněz olomoucké arcidiecéze, farář v Bludově, zemřel v Terezíně Rudolf Dušek, SJ, v době zatčení scholastik jezuitského řádu, v letech 1944-1945 vězněn v Terezíně, po roce 1948 vězněn též komunisty

F Ignác Karel Fanfrdla, brněnský augustinián, Dachau Vavřinec Miloslav Filip, OSB, emauzský benediktin, zemřel v Dachau Eduard Fischer, kněz pražské arcidiecéze, arciděkan ve Falknově nad Ohří, v letech 1943–1945 vězněn Alois Frait (uváděn častěji jako Frajt), kněz litoměřické diecéze, farář v městě Terezíně, v letech 1940–1945 vězněn Robert Franze, kněz litoměřické diecéze, v letech 1941–1942 vězněn

G Antonín Gebert, kanovník, zemřel v Dachau Emil Gehr, kněz olomoucké arcidiecéze, vězněn v Dachau, osvobozen Američany z pochodu smrti 3. května 1945 Josef Glogar, kněz olomoucké arcidiecéze, dómský vikář v Olomouci, v letech 1939–1945 vězněn

H František Hadamčík, v letech 1938-1939 několikrát uvězněn a opět propuštěn, podroben brutálním výslechům dr. Josef Hájek, kaplan v Praze na Smíchově, zemřel v Dachau Emanuel Hanuš, Podplukovník duchovní služby ve výslužbě, vyvezen z Dachau na smrt transportem invalidů Josef Hejl, kněz českobudějovické diecéze, v letech 1943–1945 vězněn Marcel Higi, OSB, emauzský benediktin, zemřel v Terezíně Bedřich Hofmann, kněz olomoucké arcidiecéze, farář v Horní Bečvě, v letech 1940–1945 vězněn Alois Homola, kněz královéhradecké diecéze, vězněn v Dachau pro odepření vojenské služby v nacistické armádě ThDr. Josef Holubníček, vězněn v Dachau Josef Horký, kněz litoměřické diecéze, farář v Třebenicích, zemřel v Dachau na naočkovanou malárii Karel Horký, O.Melit., Maltézský rytíř, farář u Panny Marie Vítězné v Praze na Malé Straně, v letech 1942–1945 vězněn dr. Norbert František Hrachovský, O.Praem., novoříšský premonstrát, zemřel v Osvětimi po aplikování injekce s fenolem Benedikt František Hronek, OP, dominikán, zemřel v Terezíně Rudolf Hubert, kněz litoměřické diecéze, farář v Kryrech u Podbořan, zatčen pro pobuřování proti nacismu, od roku 1944 vězněn v Dachau, 3. května 1945 osvobozen americkou armádou z pochodu smrti Josef Hulva, farář v Lipníku nad Bečvou, vězněn v Buchenwaldu

Ch Ferdinand Chýlek, kněz olomoucké arcidiecéze, zemřel v Buchenwaldu

J Albert Jadrníček, kněz olomoucké arcidiecéze, farář v Hulíně, v letech 1944-1945 vězněn Tecellin Josef Jaksch, O.Cist., český cisterciák rakouského původu, opat ve Vyšším Brodě, v r. 1939 půl roku vězněn, pak do r. 1945 v internaci Fulgenc Florián Jančík, augustinian Brno, V roce 1943 byl zatčen gestapem a odsouzen na 18 měsíců do vězení, protože věděl o ukrývání zbraní a také poslouchal zahraniční rozhlas. Josef Ježek, děkan v Říčanech u Prahy, v letech 1943–1945 vězněn Josef Jílek, kněz českobudějovické diecéze, od roku 1943 vězněn za odbojovou činnost, v dubnu roku 1945 popraven

K Adolf Kajpr, SJ, jezuita, v letech 1941–1945 vězněn Marian Kalynec, OSBM, kněz basiliánskéno řádu, ředitel řeckokatolického kněžského semináře v Olomouci, nějaký čas vězněn, krátce po propuštění zemřel na následky věznění Josef Klouček, arciděkan na Kladně, v roce 1939 krátce vězněn, po válce se podílel na zřízení památníku Lidic Emanuel Kohout, kněz pražské arcidiecéze, farář v Lobkovicích u Neratovic, zatčen gestapem, zemřel na následky mučení Alois Koláček, SJ, jezuita, v letech 1940–1945 vězněn František Konáš, kněz pražské arcidiecéze, farář v Hobšovicích, v letech 1942–1945 vězněn Josef Kos, kněz pražské arcidiecéze, administrátor v Kolíně, zemřel v Dachau na nákazu skvrnitým tyfem (nakazil se při ošetřování spoluvězňů) Václav Kostiha, kněz brněnské diecéze, v roce 1942 popraven za ukrývání parašutisty Oldřicha Pechala Jaroslav Kouřil, kněz olomoucké arcidiecéze, v letech 1939–1945 vězněn Benedikt Bohumil Kovařík, OSB, emauzský benediktin, v letech 1941–1945 vězněn Karel Kratina, kněz pražské arcidiecéze, katecheta, popraven gilotinou na Pankraci v Praze 15. února 1945 Kvirin Josef Kratochvíl, O.Praem., želivský premonstrát, v únoru 1945 zatčen a vězněn v Terezíně, zde zemřel 10. května 1945 na následky předchozích útrap Adauktus Josef Krebs, CFSsS, generální představený kongregace Petrínů, zemřel v Dachau Metoděj Kubáň, generální vikář československé branné moci, zemřel v Dachau František Kučera, SJ, jezuitský scholastik, od r. 1944 vězněn v Praze na Pankráci a v Terezíně, v roce 1945 osvobozen, krátce poté vysvěcen na kněze Oldřich Kučera, farář v Trhové Kamenici, umučen na své faře 8. května 1945 ustupujícími nacistickými vojáky, jeho tělo bylo po smrti zohaveno Josef Kusin, OFMCap., kněz kapucínského řádu, v letech 1943–1945 vězněn Patrik Kužela, OP, jáhen dominikánského řádu, zemřel v Osvětimi František Kvapil , kněz olomoucké arcidiecéze, farář v Nezamyslicích u Přerova a děkan, roku 1942 popraven v Kounicových kolejích v Brně

L Svatopluk Láb, bohoslovec pražské arcidiecéze, v letech 1943–1945 vězněn postupně v Praze, Terezíně a Dachau Antonín Lacina, O.Praem., provizor kláštera v Praze na Strahově, zemřel v Dachau Augustin Lang, kněz litoměřické diecéze, kritizoval nacistický režim, a 30. května 1941 byl v důsledku toho zavražděn Bohumil Liber, kněz olomoucké arcidiecéze, bývalý salesián, zahynul na nucených pracích v Německu či Norsku Jan Nepomuk Stanislav Lochman, kněz olomoucké arcidiecéze, v roce 1939 krátce vězněn

M Augustin Antonín Machalka, O.Praem., provizor kláštera v Nové Říši na Moravě, v letech 1942–1945 vězněn ThDr. Jan Martinů, generální vikář olomoucké arcidiecéze, zemřel v roce 1940, krátce po propuštění z koncentračního tábora na následky věznění ThDr. Jan Merell, profesor bohoslovecké fakulty, v letech 1943–1945 vězněn ThDr. Metoděj Jaroslav Mičola, SDS, salvatorián, 3. července 1942 popraven v Kounicových kolejích v Brně Petr Karel Miketta, OP, dominikán, internován v Zásmukách u Prahy Leopold Muris, SDB, v letech 1941-1945 vězněn v Dachau, 3. května 1945 osvobozen americkou armádou z pochodu smrti František Münster, kněz pražské arcidiecéze, kaplan ve Velvarech, zatčen za to, že na Velký pátek nevypustil z liturgických textů modlitbu za Židy, vězněn pak až do konce války v Dachau

N Jan Nedbálek , kněz olomoucké arcidiecéze, farář v Kateřinkách u Opavy, v letech 1943–1945 vězněn dr. František Němec, SJ, jezuita, profesor filosofie, v letech 1940–1945 vězněn Jan Němec, kněz českobudějovické diecéze, administrátor v Kvašňovicích, v letech 1943–1945 vězněn Josef Němec, kněz brněnské diecéze, farář ve Velké Bíteši, v letech 1943-1945 vězněn Siard František Nevrkla, O.Praem., novoříšský premonstrát, ubit v pobočním táboře Osvětimi Vojtěch Ivan Novák, OSB, emauzský benediktin, novic, zastřelen v koncentračním táboře v Oranienburgu Vavřinec Novotný, O.Praem., převor kláštera v Nové Říši na Moravě, zemřel v pobočním táboře Osvětimi Engelbert Matěj Nožina, OH, člen řádu Milosrdných bratří, zemřel v Dachau

O Alois Olšovský, farář v Ostravě-Vítkovicích, v roce 1939 krátce vězněn Antonín Olšovský, farář v Chlebovicích, krátce vězněn na přelomu let 1941/1942 Henryk Olszak, farář v Třinci, v roce 1939, dne 1. dubna 1940 zemřel na následky celkového vyčerpání při otrocké práci v kamenolomu v Mauthausenu Václav Otáhal, kněz olomoucké arcidiecéze, kaplan v Drahotuších, zemřel v Dachau

P František Pánek, kněz pražské arcidiecéze, katecheta ve Velvarech, zemřel v Dachau 14. ledna 1941 Josef Pašek, kněz českobudějovické diecéze, vyvezen z Dachau na smrt transportem invalidů Mons. Jan Pauly, kněz pražské arcidiecéze, arciděkan v Praze na Smíchově, zemřel v internaci v Zásmukách Ladislav Pecháč, kněz pražské arcidiecéze, kaplan u sv. Ludmily v Praze na Vinohradech, v letech 1943–1945 vězněn Jan Nepomuk Václav Pikl, O.Praem., želivský premonstrát, počátkem roku 1945 krátce vězněn Josef Pikora, kněz pražské arcidiecéze, kaplan v Roudnici nad Labem, v letech 1943–1945 vězněn v Buchenwaldu a Dachau za finanční podporování odboje a šíření "nelegálních tiskovin" Josef Plojhar, kněz českobudějovické diecéze, kaplan v Rudolfově, v letech 1939–1945 vězněn v Buchenwaldu a Dachau Ferdinand Pokorný, kněz olomoucké arcidiecéze, katecheta v Bzenci, v letech 1941–1945 vězněn Anselm Leo Polák, OT, zemřel 17. října 1942 v koncentračním táboře Jasenovac v Chorvatsku Jaroslav Popelka, SJ, jezuita, v letech 1944–1945 vězněn v Terezíně Jan Pour, kněz českobudějovické diecéze, v letech 1942–1945 vězněn Jan Procházka, kněz královéhradecké diecéze, zemřel ve věznici v Bruchsale v Německu