Název Novodvorský potok má více vodních toků:
Novodvorský potok (přítok Chumavy) – pravostranný přítok Chumavy v okrese Beroun Novodvorský potok (přítok Kejtovského potoka) – pravostranný přítok Kejtovského potoka v okrese Pelhřimov Novodvorský potok (přítok Lišanského potoka) – pravostranný přítok Lišanského potoka v okrese Rakovník Novodvorský potok (přítok Loděnice) – pravostranný přítok Loděnice v okresech Rakovník a Kladno Novodvorský potok (přítok Luhy) – pravostranný přítok Luhy v okrese Blansko Novodvorský potok (přítok Sedleckého potoka) – levostranný přítok Sedleckého potoka v okresech Tábor a Příbram Novodvorský potok (přítok Ronovky) – pravostranný přítok Ronovky v okrese Nymburk Novodvorský potok (přítok Vlašimské Blanice) – pravostranný přítok Vlašimské Blanice v okrese Tábor Novodvorský potok (přítok Úpy) – levostranný přítok Úpy v okrese Trutnov Novodvorský potok (přítok Výrovského potoka) – pravostranný přítok Výrovského potoka v okrese Tachov