Filozofie biologie je součást filozofie vědy, která se zabývá gnozeologickými, metafyzickými a etickými problémy v biologii a medicíně. Přestože filozofové vědy a filozofové obecně se často zabývali životem (včetně např. Aristotela, Descarta a Kanta), o filozofii biologie se mluví většinou až od 60. a 70. let 20. století. Filozofové vědy se tehdy začali biologií zabývat po moderní syntéze a vývoji moderní genetiky. Někteří filozofové se také domnívají, že klíčový zde byl vývoj neurologie a redukování vědomí na materiální termíny.
Přehled Filozofii biologie lze vidět jako pokračovatele empirické tradice a naturalismu. Mnoho současných filozofů biologie se vymezuje ústřední otázce rozdílu mezi živým a neživým. Mezi hlavní otázky, kterými se dnes filozofie biologie zabývá patří: „Co je to druh?“ „Jak se evolučně vyvinula racionalita?“ „Jak organismy koordinují své společné chování?“ „Jakou roli hraje v biologické evoluci evolučně vývojová biologie?“ „Jaké sociální hodnoty odráží naše biologické porozumění rasám, sexualitě nebo pohlaví?“ „Jak působí přirozený výběr mimo vlastní evoluci organizmů?“ O filozofii biologie se také mluví jako o bioetice: Filozofické disciplíně, která by měla pomoci rozklíčovat základní lidské hodnoty a vyřešit etické otázky kolem nových technologií. Mezi takové otázky lze zařadit: „Co je to život?“Maturana, H. R., & Varela, F. J. (1980). „Čím je člověk jedinečný?“; „Jaké jsou evoluční základy morálního myšlení?“; „Jaké biologické faktory ovlivňují naše estetické soudy?“; „Jak je evoluce slučitelná s křesťanstvím a dalšími náboženskými systémy?“
Redukcionismus, holismus, a vitalismus Velkou část diskuze filozofie biologie tvoří analýza různých současných i historických pohledů, které biologové zastávají a jaké kulturní či sociální sounáležitosti tyto pohledy doprovázely. Mezi ně patří: Vědecký redukcionismus je názor, že veškeré biologické procesy je možné zredukovat na mikroskopické chemické reakce a fyzické interakce Holismus znamená v biologii pohled na makroskopická působení živých organismů. Například evoluce je dobrým příkladem pozorování děje s velkým měřítkem tím, že aplikujeme statistické výpočty na pravděpodobnosti přežití jednotlivce. Vitalismus je pohled biology od 19. století povětšinou odmítaný, že existuje jakási životní energie (nazývaná vis-viva)
Reference
Literatura Amundson, R., 2005, The Changing Role of the Embryo in Evolutionary Thought, Cambridge, Cambridge University Press. Ayala, F. & Arp, R. (eds.), 2009, Contemporary Debates in Philosophy of Biology, Oxford, Wiley-Blackwell. Barberousse, A., Morange, M. & Pradeu, T. (2009), Mapping the Future of Biology. Evolving Concepts and Theories, Boston Studies in the Philosophy and History of Science, 266, Dordrecht, Springer. Bechtel, W., 2005, Discovering Cell Mechanisms, Cambridge, Cambridge University Press. Bedau, M. & Humphreys, P., 2008, Emergence: Contemporary Readings in Philosophy and Science, Cambridge, MA, MIT Press. Brandon, R., 1988, "The Levels of Selection: A Hierarchy of Interactors", in H. Plotkin, ed., The Role of Behavior in Evolution, Cambridge, MA, MIT Press, p. 51-71. Brandon, R., 1990, Adaptation and environment, Cambridge, Cambridge University Press. Brandon, R. & Burian, R. (eds), 1984, Genes, Organisms and Populations. Controversies Over the Units of Selection, Cambridge, MA, MIT Press. Burian, R., 1983, "Adaptation", in M. Greene, ed., Dimensions of Darwinism, New York & Cambridge, Cambridge University Press, p. 287-314. Bunge, M., & Mahner, M., 1997, Foundations of Biophilosophy, Berlín, Springer Buss, L., 1987, The Evolution of Individuality, Princeton, Princeton University Press. Byron, J. M., 2007, "Whence Philosophy of Biology ?", British Journal for the Philosophy of Science, 58(3), p. 409-422. Craver, C., 2007, Explaining the Brain : Mechanisms and the Mosaic Unity of Neuroscience, Oxford, Oxford University Press. Cummins, R., 1975, "Functional Analysis", The Journal of Philosophy, 72, p. 741-764. Darwin, C., 1859, The Origin of Species, Paris, GF, 1992. Dassow (von), G. & Munro, E., 1999, "Modularity in Animal Development and Evolution: Elements of a Conceptual Framework for EvoDevo", Journal of Experimental Zoology B (Mol Dev Evol), 285, p. 307-325. Dawkins, R., 1976, The Selfish Gene, Oxford, Oxford University Press. Dawkins, R., 1982, The Extended Phenotype, Oxford, Oxford University Press. Dawkins, R., 1986, The Blind Watchmaker, New York, Norton. Dennett, D., 1995, Darwin's Dangerous Idea, New York, Simon and Schuster. Dupré J., 2005, Darwin's Legacy: What Evolution Means Today. Oxford: Oxford University Press. Dupré J., 2002, Humans and Other Animals. Oxford: Clarendon Press. Dupré J., 1995, The Disorder of Things: Metaphysical Foundations of the Disunity of Science. Cambridge, MA: Harvard University Press. Eldredge, N., 1984, "Large-scale biological entities and the evolutionary process", Proceedings of the Biennial Meeting of the Philosophy of Science Association 1984, vol. 2, p. 551-566. Falk, R., 2000, "The gene : A concept in tension", in Beurton, P., Falk, R. & Rheinberger, H-J. (eds.), The Concept of the Gene in Development and Evolution. Historical and Epistemological Perspectives, Cambridge, Cambridge University Press, p. 317-348. Fisher, R.A., 1930, The Genetical Theory of Natural Selection, Oxford, Clarendon Press. Francis, R., 2003, Why Men Won't Ask for Directions: The Seductions of Sociobiology, Princeton, Princeton University Press. Gayon, J., 1998, Darwinism's Struggle for Survival : Heredity and the Hypothesis of Natural Selection. Cambridge: Cambridge University Press. Ghiselin, M., 1974, "A Radical Solution to the Species Problem", Systematic Zoology, 23, p. 536-44. Gilbert, S.F., 2001, "Ecological developmental biology : developmental biology meets the real world", Developmental Biology, 233, p. 1-12. Gilbert, S.F., 2002, "The genome in its ecological context", Annals of the New York Academy of Sciences, 981, p. 202-218. Gilbert, S.F. & Epel, D., 2009, Ecological Developmental Biology, Sunderland, MA, Sinauer Associates, Inc. Publishers. Gilbert, S.F., Opitz, J.M. & Raff, R. A., 1996, "Resynthesizing Evolutionary and Developmental Biology", Developmental Biology, 173, p. 357-372. Godfrey-Smith, P., 1993, "Functions : Consensus without unity", Pacific Philosophical Quarterly, 74, p. 196-208. Godfrey-Smith, P., 2000, "The Replicator in Retrospect", Biology and Philosophy, 15, p. 403-423. Godfrey-Smith, P., 2001, "Three kinds of adaptationism", in Orzack, S. & Sober, E., eds., 2001, Adaptationism and Optimality, Cambridge, Cambridge University Press. Godfrey-Smith, P., 2004, "Genes do not Encode Information for Phenotypic Traits", in Hitchcock, C., ed., Contemporary Debates in Philosophy of Science, Malden, Blackwell, p. 275-289. Godfrey-Smith, P., 2006, "The strategy of model-based science", Biology and Philosophy, 21, p. 725–740. Godfrey-Smith, P., 2007, "Conditions for evolution by natural selection", The Journal of Philosophy, 104, p. 489-516. Godfrey-Smith, P., 2008, "Varieties of Population Structure and the Levels of Selection", British Journal for the Philosophy of Science, 59, p. 25-50. Godfrey-Smith, P., 2009, Darwinian Populations and Natural Selection, Oxford, Oxford University Press. Godfrey-Smith, P. & Sterelny, K., 2007, "Biological Information", Stanford Encyclopedia of Philosophy (online). Gould, S. J., 1977, Ontogeny and Phylogeny, Cambridge, MA, Belknap Press. Gould, S. J., 1980, The Panda's Thumb, New York, Norton. Gould, S. J., 2002, The Structure of Evolutionary Theory, Cambridge, MA, Harvard University Press.. Gould, S. J. & Lewontin, R., 1979, "The Spandrels of San Marco and the Panglossian Paradigm : A Critique of the Adaptationist Programme", Proceedings of the Royal Society of London B 205, p. 581-98. Gould, S. J. & Lloyd, E., 1999, "Individuality and adaptation across levels of selection: How shall we name and generalize the unit of Darwinism?", PNAS USA 96(21), p. 11904-11909. Grafen, A. & Ridley, M. (eds.), 2006, Richard Dawkins: how a scientist changed the way we think, Oxford, Oxford University Press. Griffiths, P., 2001, "Genetic Information: A Metaphor In Search of a Theory", Philosophy of Science, 68(3), p. 394-412. Griffiths, P., 2006, "Function, Homology and Character Individuation", Philosophy of Science, 73(1), p. 1-25. Griffiths, P., 2007, "The Phenomena of Homology", Biology and Philosophy, 22(5), p. 643-658. Griffiths, P. & Gray, R., 1994, "Developmental Systems and Evolutionary Explanation", Journal of Philosophy, 91, p. 277-304. Griffiths, P. & Gray, R., 2004, "The Developmental Systems Perspective : Organism-environment systems as units of development and evolution", in Pigliucci, M. & Preston, K. (eds.), Phenotypic Integration: Studying the Ecology and Evolution of Complex Phenotypes, Oxford & New York, Oxford University Press, p. 409-430. Griffiths, P. & Stotz, K., 2007, "Gene", in Hull, D. & Ruse, M. (eds.) Hall, B. K., 1992, Evolutionary Developmental Biology, New York, Chapman and Hall. Hamburger, V., 1980, "Embryology and the Modern Synthesis in Evolutionary Theory", in Mayr, E. & Provine, W. B, eds., p. 97-112. Hempel, C. G. (1965), Aspects of Scientific Explanation, New York, The Free Press. Hull, D., 1969, "What philosophy of biology is not", Journal of the History of Biology, 2(1), p. 241-268. Hull, D., 1974, Philosophy of Biological Science, Englewood Cliffs, N.J., Prentice-Hall. Hull, D., 1976, "Are Species Really Individuals ?", Systematic Zoology, 25, p. 174-191. Hull, D., 1977, "A Logical Empiricist Looks at Biology", The British Journal for the Philosophy of Science, 28(2), p. 181-189. Hull, D., 1978, "A Matter of Individuality", Philosophy of Science, 45, p. 335-60. Hull, D., 1980, "Individuality and Selection", Annual Review of Ecology and Systematics, 11, p. 11-332. Hull, D., 1981, "Units of Evolution : A Metaphysical Essay", in Jensen, U.J. & Harré, R. eds., The Philosophy of Evolution, Brighton, England, The Harvester Press, p. 23-44. Hull, D., 1986, "On Human Nature", Proceedings of the Philosophy of Science Association, ii, p. 3-13. Hull, D., 1988, Science as a Process : An Evolutionary Account of the Social and Conceptual Development of Science, Chicago, Chicago University Press. Hull, D., 1989a, The Metaphysics of Evolution, Albany, State University of New York Press. Hull, D., 1989b, "A Function for Actual Examples in Philosophy of Science", in Ruse, M. (ed.) What the Philosophy of Biology Is : Essays dedicated to David Hull, Dordrecht, Holland, Kluwer Academic Publishing, p. 313-324. Hull, D., 2002, "Recent philosophy of biology : A review", Acta Biotheoretica, 50, 117-128. Hull, D. & Ruse, M., eds., 1998, The Philosophy of Biology, Oxford, Oxford University Press. Hull, D. & Ruse, M., eds., 2007, The Cambridge Companion to the Philosophy of Biology, Cambridge, Cambridge University Press. Jacob, F., 1970, La Logique du vivant. Une histoire de l'hérédité, Paris, Gallimard. Kauffman, S., 1993, The Origins of Order : Self-Organization and Selection in Evolution, Oxford, Oxford University Press. Kimura, M., 1983, The Neutral Theory of Molecular Evolution, Cambridge, Cambridge University Press. Kitcher, P. S., "1953 and all That. A Tale of Two Sciences", Philosophy of Science, 93(3), p. 335-373. Kitcher, P. S., 1993, "Function and Design", Midwest Studies in Philosophy, 18(1), p. 379-397. Krohs, U. & Kroes, P. (eds.) 2009, Functions in biological and artificial worlds. Comparative philosophical perspectives. Cambridge, MA & London/UK, MIT Press. Laubichler, M., 2007, "Evolutionary Developmental Biology", in Hull, D. & Ruse, M. (eds.), p. 342-360. Laubichler, M. & Maienschein, J., 2007, From Embryology to Evo-Devo, Cambridge, MA, MIT Press.