La glycyl-ARNt synthétase, ou GlyRS, est une ligase qui catalyse la réaction :
ATP + L-glycine + ARNtGly AMP + pyrophosphate + L-glycyl-ARNtGly.
Cette enzyme assure la fixation de la glycine, l'un des aminés protéinogènes, sur son ARN de transfert, noté ARNtGly, pour former l'aminoacyl-ARNt correspondant, ici le glycyl-ARNtGly.
Structure Contrairement aux autres aminoacyl-ARNt synthétases, GlyRS existe sous deux formes distinctes provenant d'ancêtres différents.: homodimère pour les eukaryotes, archées et certaines bactéries hétérotétramère pour la plupart des bactéries, dont notamment Escherichia coli ainsi que dans les plastes.
La forme hétérotétramérique, notée (αβ)2, est composée de deux sous-unités α et deux sous-unités β. Bien que plus petite, la sous-unité α contient les trois motifs typiques des aminoacyl-ARNt synthétase de classe II et le site d'aminoacylation. Les sous-unités β sont quant à elles responsables de la liaison à l'ARN de transfert. Parmi les autres synthétases, seule la phénylalanyl-ARNt synthétase possède également une forme hétérotétramérique. vignette|Structure en forme de "X" de la GlyRS de E. coli (PDB 7EIV). Les deux sous-unités α sont en rouge et orange. Les deux sous-unités β sont en bleu et vert.
Notes et références
Catégorie:EC 6.1.1