Une répétition ankyrine est une configuration particulière des protéines consistant en d'acides aminés formant deux hélices α séparées par des boucles. Ces domaines sont très répandus, un peu chez les bactéries et les archées, mais surtout chez les eucaryotes. Ils sont absents de la plupart des virus, à l'exception des Poxviridae. Ils sont définis par leur structure et non par leur séquence dans la mesure où aucune séquence particulière n'a été associée aux répétitions ankyrine. La plupart des protéines qui contiennent ce type de structures possèdent de quatre à six répétitions ankyrine, l'ankyrine elle-même en ayant 24, le record étant probablement les d'une protéine exprimée par Giardia lamblia.
Les répétitions ankyrine se replient généralement ensemble pour former une structure unique en forme de solénoïde linéaire appelée domaine de répétitions ankyrine. Ces domaines constituent l'une des plateformes les plus courantes assurant les interactions protéine-protéine. Elles interviennent dans un grand nombre de protéines aux fonctions diverses, principalement chez les eucaryotes. Les exemples provenant de procaryotes et de virus résultent peut-être de transferts horizontaux de gènes.
Cette structure a été observée dans des protéines assurant des fonctions très diverses, comme l'initiation de la transcription, la régulation du cycle cellulaire, le transport d'ions, la transduction de signal et les protéines du cytosquelette.
Liste de protéines à répétition ankyrine ProtéineGèneLocusOMIM10q23.31609599https://omim.org/entry/609599Ankyrin repeat domain 210q24.2 610734https://omim.org/entry/610734Ankyrin repeat domain 66q15610583https://omim.org/entry/610583Ankyrin repeat domain 77q31.31610731https://omim.org/entry/610731Ankyrin repeat domain 914q32.31618605https://omim.org/entry/618605Ankyrin repeat domain 1016q24.3611192https://omim.org/entry/611192Ankyrin repeat domain 1218p11.22610616https://omim.org/entry/610616Ankyrin repeat domain 13A12q24.11615123https://omim.org/entry/615123Ankyrin repeat domain 13B17q11.26151241p31.1615125https://omim.org/entry/615125Ankyrin repeat domain 13D12q24.11615126Ankyrin repeat domain 174q13.3615929Ankyrin repeat domain 18A9p13.1620259Ankyrin repeat domain 18BANKRD18B9p13.3618930https://omim.org/entry/618930Ankyrin repeat domain 20 family member A12q11.2610736https://omim.org/entry/610736Ankyrin repeat domain 2419p13.362023410p12.1610855https://omim.org/entry/610855Ankyrin repeat domain 2719q13.11618957Ankyrin repeat domain 283p25.1611122https://omim.org/entry/611122Ankyrin repeat domain 29Ankyrin repeat domain 30A10p11.21610856https://omim.org/entry/610856Ankyrin repeat domain 30B18p11.21616565https://omim.org/entry/616565Ankyrin repeat domain 30B likeANKRD30BL5q13.3618423https://omim.org/entry/61842312q13.13620857Ankyrin repeat domain 33BAnkyrin repeat domain 34A1q21.1617457https://omim.org/entry/617457Ankyrin repeat domain 34B5q14.1618581https://omim.org/entry/618581Ankyrin repeat domain 34C1q21.1621505https://omim.org/entry/621505Ankyrin repeat domain 362q11.2620262Ankyrin repeat domain 36BAnkyrin repeat domain 36CANKRD36CAnkyrin repeat domain 374q35.1619021https://omim.org/entry/619021Ankyrin repeat domain 39Ankyrin repeat domain 40Ankyrin repeat domain 4211q14.1619778https://omim.org/entry/619778Ankyrin repeat domain 442q33.1620861https://omim.org/entry/620861Ankyrin repeat domain 451q25.1618712https://omim.org/entry/618712Ankyrin repeat domain 46Ankyrin repeat domain 4911q21619571https://omim.org/entry/619571Ankyrin repeat domain 504q28.1619856https://omim.org/entry/619856Ankyrin repeat domain 5212q13.3620862Ankyrin repeat domain 532p13.3617009https://omim.org/entry/617009Ankyrin repeat domain 5422q13.1613383https://omim.org/entry/613383Ankyrin repeat domain 555q11.2615189https://omim.org/entry/615189Ankyrin repeat domain 60Ankyrin repeat domain 617p22.1621326Ankyrin repeat domain 62Ankyrin repeat domain 6315q15.1621291https://omim.org/entry/621291Ankyrin repeat domain 65Ankyrin repeat domain 66Ankyrin repeat and EF-hand domain containing 120p12.2621691https://omim.org/entry/621691
Notes et références
Catégorie:Motif structurel