Liste d'espèces archéennes dont le génome est séquencé

Cet article présente une liste (qui peut ne pas être à jour) d'espèces d'Archées dont le génome a été séquencé.

Liste

+ Espèces archéennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheNombre de paires de basesNombre de gènesBase de données de dépôtNuméro d'entréeAeropyrum pernixK11,669,6952,694EMBL/GenBank/DDBJAP000058-AP000064Archaeoglobus fulgidusDSM43042,178,4002,436GenBankAE000782Haloarcula marismortuiATCC43049 (total)4,274,642 (total)4242 (total)GenBankAY596290–AY596298 Chromosome I3,131,724AY596298Chromosome II288,050AY5962907réplicon pNG700410,554AY596296réplicon pNG600155,300AY596295réplicon pNG500155,300AY596294réplicon pNG400155,300AY596293réplicon pNG300155,300AY596292réplicon pNG20033,452AY596291réplicon pNG10033,303AY596290Halobacterium speciesNRC-1 (chromosome)2,014,2392,111GenBankAE004437NRC-1 (réplicon pNRC100)191,346197AF016485NRC-1 (réplicon pNRC200)365,425374AE004438Methanobacterium thermoautotrophicumdelta-H1,751,3771,855GenBankAE000666Methanocaldococcus jannaschiiDSM2661 (1 chromosome circulaire + 1 grand ECE circulaire + 1 petit ECE circulaire)1,664,976+58,407+16,5501,738=1682+44+12Genome Sequence DatabaseL77117, L77118, L77119Methanococcoides burtonii DSM 62422,575,0322,273GenBank (autres ?)CP000300Methanococcus maripaludis S21,661,1371,722EMBL/GenBank/DDBJ/ORNLBX950229 Methanopyrus kandleriAV191,694,9691,692GenBankAE009439Methanosarcina acetivoransC2A5,751,4924,524GenBankAE010299Methanosarcina barkeri Fusaro (Chromosome)4,837,4083,680GenBank/JGI IMGGenBank:NC_007355 JGI:623520000Fusaro (Plasmide)36,35818GenBank:NC_007349 JGI: 623520000 Methanosarcina mazeiGoe14,096,3453,371ERGO/GenBank/G2LGenBank: AE008384Methanosphaera stadtmanaeDSM30911,767,4031,534EMBL/GenBank/DDBJCP000102Methanospirillum hungatei (pas de publication)JF-13,544,7383,304GenBankNC_007796Nanoarchaeum equitansKin4M490,885552EMBL/GenBank/DDBJAACL01000000Natronomonas pharaonisDSM 2160 (chromosome)2,595,2212,675EMBLCR936257DSM 2160 (réplicon PL131)130,989132CR936258DSM 2160 (réplicon PL23)23,48636CR936259Picrophilus torridus DSM97901,545,9001,535GenBankAE017261Pyrobaculum aerophilumIM22,222,4302,587GenBankAE009441Pyrococcus abyssi (pas de publication)GE51,765,1181,788 EMBLAL096836Pyrococcus furiosusDSM36381,908,2562228GenBankAE009950Pyrococcus horikoshiiOT31,738,5052,061EMBL/GenBank/DDBJAP000001-AP000007Sulfolobus acidocaldariusDSM6392,225,9592,292EMBL/GenBank/Sulfolobus databaseGenBank/EMBL:CP000077Sulfolobus solfataricus P22,992,2452,995EMBL/GenBankAE006641Sulfolobus tokodaii72,694,7562,826EMBL/GenBank/DDBJAP000981–AP000990Thermococcus kodakaraensis KOD12,088,7372,306EMBL/GenBank/DDBJAP006878Thermoplasma acidophilumDSM17281,564,9051,509EMBLAL139299Thermoplasma volcaniumGSS11,584,7995,321 (mais voir discussion dans l'article source)GenBankAP000991–AP000996

Notes et références

Annexes

Articles connexes Séquençage de l'ADN Projet de séquençage de génome Projet microbiote humain Liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé Liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé Liste d'espèces eucaryotes dont le génome est séquencé Liste d'espèces d'algues dont le génome est séquencé Liste d'espèces de plantes dont le génome est séquencé

Liens externes Genome Atlas Database SUPERFAMILY Base de données de génomique comparative. Comprend les génomes complètement séquencés de procaryotes, ainsi qu'un outil performant d'exploration et de visualisation des données pour l'analyse.

Bibliographie

* Archées dont le génome est séquencé