O motivo de recoñecemento do ARN (RRM), tamén chamado dominio de unión ao ARN (RBD) ou dominio de ribonucleoproteína (RNP), é un dominio proteico para a unión ao ARN duns 80-90 aminoácidos que se une ao ARN monocatenario, que foi atopado en moitas proteínas eucariotas.
O grupo máis grande de proteínas que se unen ao ARN monocatenario é a familia do motivo de recoñecemento do ARN (RRM) eucariótico que contén unha secuencia consenso RNP-1 de oito aminoácidos, principalmente aromáticos e de con carga positiva.
As proteínas RRM teñen varias preferencias de unión ao ARN e funcións, e inclúen ribonucleoproteínas nucleares heteroxéneas (RNPnhs), proteínas implicadas na regulación do splicing alternativo (SR, U2AF2, Sxl), compoñentes proteicos das ribonucleoproteínas nucleares pequenas (as snRNPs U1 e U2), e proteínas que regulan a estabilidade do ARN e a tradución (PABP, La, Hu). O factor de splicing heterodimérico U2AF1 parece ter dous dominios similares ao RRM con características especializadas para o recoñecemento de proteínas. O motivo tamén aparece nunhas poucas proteínas de unión ao ADN monocatenario.
O RRM típico consta de catro febras beta antiparalelas e dúas hélices alfa dispostas nun pregamento beta-alfa-beta-beta-alfa-beta con cadeas laterais que se amorean coas bases do ARN. Durante a unión ao ARN está presente unha terceira hélice nalgúns casos. O que se coñece sobre o dominio RRM é resumido nalgunhas publicacións.
Proteínas humanas que conteñen este dominio A2BP1; ACF; BOLL; BRUNOL4; BRUNOL5; BRUNOL6; CCBL2; CGI-96; CIRBP; CNOT4; CPEB2; CPEB3; CPEB4; CPSF7; CSTF2; CSTF2T; CUGBP1; CUGBP2; D10S102; DAZ1; DAZ2; DAZ3; DAZ4; DAZAP1; DAZL; DNAJC17; DND1; EIF3S4; EIF3S9; EIF4B; EIF4H; ELAVL1; ELAVL2; ELAVL3; ELAVL4; ENOX1; ENOX2; EWSR1; FUS; FUSIP1; G3BP; G3BP1; G3BP2; GRSF1; HNRNPL; HNRPA0; HNRPA1; HNRPA2B1; HNRPA3; HNRPAB; HNRPC; HNRPCL1; HNRPD; HNRPDL; HNRPF; HNRPH1; HNRPH2; HNRPH3; HNRPL; HNRPLL; HNRPM; HNRPR; HRNBP1; HSU53209; HTATSF1; IGF2BP1; IGF2BP2; IGF2BP3; LARP7; MKI67IP; MSI1; MSI2; MSSP-2; MTHFSD; MYEF2; NCBP2; NCL; NOL8; NONO; P14; PABPC1; PABPC1L; PABPC3; PABPC4; PABPC5; PABPN1; POLDIP3; PPARGC1; PPARGC1A; PPARGC1B; PPIE; PPIL4; PPRC1; PSPC1; PTBP1; PTBP2; PUF60; RALY; RALYL; RAVER1; RAVER2; RBM10; RBM11; RBM12; RBM12B; RBM14; RBM15; RBM15B; RBM16; RBM17; RBM18; RBM19; RBM22; RBM23; RBM24; RBM25; RBM26; RBM27; RBM28; RBM3; RBM32B; RBM33; RBM34; RBM35A; RBM35B; RBM38; RBM39; RBM4; RBM41; RBM42; RBM44; RBM45; RBM46; RBM47; RBM4B; RBM5; RBM7; RBM8A; RBM9; RBMS1; RBMS2; RBMS3; RBMX; RBMX2; RBMXL2; RBMY1A1; RBMY1B; RBMY1E; RBMY1F; RBMY2FP; RBPMS; RBPMS2; RDBP; RNPC3; RNPC4; RNPS1; ROD1; SAFB; SAFB2; SART3; SETD1A; SF3B14; SF3B4; SFPQ; SFRS1; SFRS10; SFRS11; SFRS12; SFRS15; SFRS2; SFRS2B; SFRS3; SFRS4; SFRS5; SFRS6; SFRS7; SFRS9; SLIRP; SLTM; SNRP70; SNRPA; SNRPB2; SPEN; SR140; SRRP35; SSB; SYNCRIP; TAF15; TARDBP; THOC4; TIA1; TIAL1; TNRC4; TNRC6C; TRA2A; TRSPAP1; TUT1; U1SNRNPBP; U2AF1; U2AF2; UHMK1; ZCRB1; ZNF638; ZRSR1; ZRSR2;
Notas
Véxase tamén Ligazóns externas
Categoría:Dominios proteicos