Carriera Calciatore Centrocampista, dal 1988 al 1992 vestì la maglia dell', di cui fu capitano. Si ritirò precocemente, all'età di 30 anni, per concentrarsi sulla carriera di allenatore.
Allenatore Intraprese la carriera di allenatore già nei primi anni '90, guidando Atlético de Rafaela e . Poi guidò il e sedette ancora sulla panchina dell'Atlético de Rafaela. Nel 2001 assunse la guida dell', guidandolo alla vittoria del campionato di Primera B Nacional Apertura 2001 e alla conseguente promozione in Primera División.
Nel 2003 guidò alla promozione il Quilmes, dove rimase anche nella stagione seguente (2003-2004), raggiungendo il quarto posto e poi il sesto, qualificando così la squadra alla Coppa Libertadores 2005 e alla Coppa Sudamericana 2004. Nel 2005 visse un'esperienza molto negativa sulla panchina del , per poi passare ad allenare l' verso la fine del 2006. Alfaro aiutò l'Arsenal a concludere per due volte al quinto posto il campionato, qualificando la compagine di Sarandí alla Coppa Libertadores per la prima volta nella storia del club. La squadra si qualificò anche alla Coppa Sudamericana 2007, dove batté i campioni d'Argentina del San Lorenzo nel turno preliminare, guadagnando un posto negli ottavi di finale, dove contro i brasiliani del vinse per 3-2 in Brasile e pareggiò per 1-1 al ritorno, superando il turno. Fu la prima vittoria contro un club estero in partite ufficiali per l'Arsenal, che raggiunse poi la finale della competizione, provocando l'esonero di vari tecnici delle squadre affrontate, tra cui quello di Daniel Passarella, dimessosi dalla guida tecnica del dopo l'eliminazione contro l'Arsenal in semifinale. Nella finale della Coppa Sudamericana la squadra pareggiò per 4-4 contro i messicani dell', vincendo il titolo per la regola dei gol fuori casa.
Nella stagione 2007-2008 Alfaro fu sostituito da Daniel Garnero. Nell'ottobre 2008 fu nominato allenatore del . Nel 2009 allenò i sauditi dell'Al-Ahli, alla cui guida rimase per quattro mesi, prima delle dimissioni rassegnate il 20 novembre per ragioni personali.
Il 17 maggio 2010 fu ufficializzato il suo ritorno all'Arsenal Sarandí. Alfaro fu ingaggiato per la stagione seguente insieme agli assistenti Sergio Chiarelli, Carlos González e Claudio Cristofanelli. Il 24 giugno 2012 vinse il primo titolo nazionale della propria carriera di allenatore e nella storia del club, il Clausura 2012.
Nel 2014, malgrado le ottime premesse e il prestigioso palcoscenico della Coppa Libertadores, la squadra ottenne risultati negativi fino ad aprile e Alfaro annunciò che si sarebbe dimesso alla fine di giugno. Il tecnico fu tuttavia esonerato dall’incarico meno di dodici ore dopo queste dichiarazioni e sostituito con Martín Palermo.
Nel settembre 2014 si accordò con il , che allenò fino al 2016, quando fu ingaggiato dal . Nel 2017 si accasò all', che nella prima stagione guidò al quarto posto in campionato, assicurandosi la partecipazione alla fase a gironi della Coppa Libertadores 2019.
Nel dicembre 2018 si svincolò dall'Huracán e il 2 gennaio 2019 firmò per il , con cui vinse la Supercopa Argentina 2018, disputata nel maggio 2019. Alla fine di dicembre del 2019, scaduto il suo contratto con il Boca, lasciò il club di Buenos Aires.
Il 26 agosto 2020 divenne il commissario tecnico della nazionale ecuadoriana, che guida alla qualificazione al , dove la squadra viene eliminata al primo turno, avendo ottenuto una vittoria e un pari e subito una sconfitta.
Statistiche Statistiche da allenatore Nazionale ecuadoriana
SquadraNazdalalRecordGVNPGFGSDR% Vittorie20 agosto 202012 gennaio 2023
Nazionale ecuadoriana nel dettaglio
StagioneSquadraCompetizionePiazzamentoAndamentoRetiGiocate VittoriePareggiSconfitte % VittorieGFGSDR 2020 Qual. Mondiali 2022 4° nel gruppo sudamericano CONMEBOL, Qualificato || 13 || 6 || +7 2021 10 7 +3 gen./mar. 2022 4 6 -2 giu./lug. 2021 Copa América 2021 Quarti di Finale || 5 || 9 || -4 nov.-dic. 2022 Mondiale 2022 Fase a Gironi (3° nel gruppo A) || 4 || 3 || +1 Dal 2020 Amichevoli || 8 || 4 || +4 Totale Ecuador || 44 || 33 || +11
Panchine da commissario tecnico della nazionale ecuadoriana
Nazionale costaricana
SquadraNazdalalRecordGVNPGFGSDR% Vittorie2 novembre 20239 agosto 2024
Nazionale costaricana nel dettaglio
StagioneSquadraCompetizionePiazzamentoAndamentoRetiGiocate VittoriePareggiSconfitte % VittorieGFGSDR 2023 CONCACAF Nations League 2023-2024 sub, Quarti di finale || 1 || 6 || -5 mar. 2024 (Play-Off Copa America 2024) 3 1 +2 2024 Qual.Mondiali 2026 Esonerato durante la fase || 7 || 0 || +7 giu.-lug. 2024 Copa América 2024 3° nel gruppo D || 2 || 4 || -2 Dal 2023 Amichevoli || 3 || 3 || +0 Totale Costa Rica || 16 || 14 || +2
Panchine da commissario tecnico della nazionale costaricana
Nazionale paraguaiana
SquadraNazdalalRecordGVNPGFGSDR% Vittorie16 agosto 2024in carica
Nazionale paraguaiana nel dettaglio
StagioneSquadraCompetizionePiazzamentoAndamentoRetiGiocate VittoriePareggiSconfitte % VittorieGFGSDR 2024 Qual. Mondiale 2026 Sub., 6° nel gruppo sudamericano, qualificato || 7 || 4 || +3 2025 6 3 +3 giu.-lug. 2026 Mondiali 2026 Ottavi di finale || 3 || 6 || -3 Dal 2024 Amichevoli || 11 || 9 || +2 Totale Paraguay || 27 || 22 || +5
Panchine da commissario tecnico della nazionale paraguaiana
Palmarès Allenatore Competizioni nazionali Primera B Nacional: 1 Olimpo: 2001 (A)
Arsenal Sarandí: 2011-2012 (C)
Arsenal Sarandí: 2012 Boca Juniors: 2018
Arsenal Sarandí: 2012-2013
Competizioni internazionali
Arsenal Sarandí: 2007
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