Si laureò presso l’Università di Mosca nel 1938. Partecipò nelle file dell’esercito sovietico alla Seconda guerra mondiale durante la quale fu ferito e guadagnandosi alcune onorificenze. Lavorò come ricercatore presso l’Osservatorio Kučinskaja di Mosca. Nel 1964 creò il Dipartimento di Fisica della Luna e dei Pianeti presso lo Sternberg Astronomical Institute dell’Università di Mosca.
Condusse ricerche nel campo della polarizzazione della luce della superficie lunare e della corona solare. Nel 1960 sviluppò un metodo per la decodifica delle immagini trasmesse dalla sonda Luna-3 portandolo ad elaborare un primo atlante della faccia nascosta della Luna successivamente ampliato con l’elaborazione delle immagini inviate dalla sonda Zond-3 nel 1965 e da altre missioni.
A Jurij Naumovič Lipskij la UAI ha intitolato il cratere lunare Lipskiy.
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