Biografia Sudhoff insegnò per anni presso l'Università di Lipsia, dove fondò anche l'Istituto di storia della medicina (Institut für Geschichte der Medizin) ed esercitò un forte controllo sulla direzione della storia medica tedesca. Inoltre fondò la rivista Archiv für Geschichte der Medizin, successivamente denominata Sudhoffs Archiv e la serie monografica Studien zur Geschichte der Medizin. Inoltre, diffuse l'interesse per Paracelso e Costantino l'Africano.
Nel 1933 Sudhoff si unì al Partito Nazista (NSDAP), causando ai suoi colleghi un grande dispiacere, ma nessuno gli fece cambiare idea. Dopo la partenza del 1932 per l'Università Johns Hopkins, Sudhoff ha nuovamente diretto l'Istituto a Lipsia prima di rivolgersi a Walter von Brunn nel novembre del 1934.Kästner, Ingrid. The Leipzig Period, 1925-1932. In: Fee, Elizabeth and Brown, Theodore M. Making Medical History. The life and times of Henry E. Sigerist. Johns Hopkins University Press, Baltimore 1997, p. 57.Riha, Ortrun. Sudhoff, Karl Friedrich Jakob. In: Sächsische Biographie, hrsg. vom Institut für Sächsische Geschichte und Volkskunde e.V. Online Ausgabe 19.05.2015 Morì a Salzwedel l'8 ottobre 1938.
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