La seconda edizione di Produce 101 è stata trasmessa su Mnet dal 7 aprile al 16 giugno 2017. Gli undici concorrenti vincitori (Kang Daniel, Park Ji-hoon, Lee Dae-hwi, Kim Jae-hwan, Ong Sung-woo, Park Woo-jin, Lai Kuan-lin, Yoon Ji-seong, Hwang Min-hyun, Bae Jin-young e Ha Seng-un) sono state scelti tra 101 candidati provenienti da cinquantasei agenzie di spettacolo e hanno debuttato il 7 agosto 2017 con il nome di Wanna One () sotto la YMC Entertainment.
Produzione Per preparare i ragazzi, furono riuniti diversi artisti. I cantanti Lee Seok-hoon e Shin Yoo-mi si occuparono delle lezioni di canto, i rapper Cheetah e Don Mills del rap, mentre Kahi e Kwon Jae-seung del ballo. BoA sostituì Jang Keun-suk nel ruolo di presentatrice del programma, mentore dei concorrenti e rappresentante dei telespettatori.
I ragazzi furono trasferiti nei dormitori il 26 febbraio 2017 e le riprese cominciarono poco dopo. Furono svelati per la prima volta durante l'episodio 514 di M Countdown il 9 marzo seguente. Il gruppo fu presentato da BoA ed eseguì la canzone dello show, "It's Me (Pick Me)". Il 31 marzo si esibirono con lo stesso brano al Gocheok Sky Dome prima della partita di baseball tra LG Twins e Nexen Heroes. Inoltre, il concorrente Lee Dae-hwi fece il primo lancio cerimoniale, con Kim Samuel della Brave Entertainment alla battuta.
Controversie Secondo quanto riportato da Ilgan Sports al termine di marzo 2017, un concorrente aveva parlato ai media della discriminazione operata sui partecipanti; in particolare, pasti e permessi per andare al bagno erano gestiti in base al voto ricevuto durante la prima esibizione, e si verificavano episodi di bullismo e plagio delle coreografie.
Han Jong-youn della Maroo Entertainment lasciò il programma a causa di un grave scandalo per bullismo e molestie sessuali. Un suo presunto ex-compagno di classe lo accusò di averlo fatto masturbare davanti ai suoi amici, di averlo costretto a combattere con loro e di averlo rinchiuso a chiave nello sgabuzzino delle pulizie. Anche Ha Min-ho della The Vibe Label abbandonò show e agenzia quando trapelò che presumibilmente aveva cercato di intrattenere relazioni sessuali con una fan minorenne, e fu accusato di molestie sessuali e bullismo nei confronti della sua ragazza durante le scuole medie.
Kwon Hyun-bin della YGKPLUS cancellò tutti i suoi post di Instagram a causa di ripetuti commenti negativi giunti in risposta al quarto episodio, in cui fu visto immotivato e duramente ripreso per non essersi esercitato. Dopo l'esibizione grazie alla quale la sua squadra vinse la sfida ed egli ottenne il punteggio più alto, affermò di voler veramente debuttare come cantante e di aver messo a rischio tutto, ma i netizen lo criticarono per la "mancanza di sincerità".
In occasione del round tenutosi nell'episodio 8, quattro concorrenti furono accusati di aver barato cercando di manipolare la votazione online che avrebbe deciso l'assegnazione dei brani. Fu riferito che Kang Daniel della MMO Entertainment aveva indicato quale canzone preferisse alterando il numero di emoji a forma di gatto nella sua biografia di Instagram rispondendo alla richiesta dei suoi fan. Lee Ki-won della 2Y Entertainment pubblicò su Instagram la frase "O Ki-won > Sa Ki-won Sam Ki-won I Ki-won", con la quale suggeriva che il quinto brano fosse da preferire (cinque, in coreano, si dice "o"); la sua agenzia gli proibì di utilizzare i social network fino al termine dello show, ma in seguito rivelò che il post in questione era stato un tentativo del suo staff di aumentarne la popolarità e che egli ne era all'oscuro. Anche Kim Dong-bin della Kiwi Media Group rimase coinvolto a causa di alcune screenshot di messaggi su KakaoTalk nei quali suo padre indicava al presidente del fanclub le canzoni da votare; lo stesso valse per Lim Young-min della Brand New Music, che fece sapere ai fan cosa scegliere tramite suo fratello. I quattro furono penalizzati venendo banditi dalle canzoni in questione, tranne Im, che fu punito alla valutazione seguente perché fu scoperto soltanto dopo la registrazione della puntata.
Episodi Episodio 1 (7 aprile 2017) Uno dopo l'altro, i concorrenti di ogni agenzia entrano in studio, dove i posti a sedere sono disposti a piramide e numerati da 1 a 101. Ciascuno sceglie la sedia che preferisce, ed è Jang Moon-vok della ONO Entertainment ad accomodarsi definitivamente sulla numero 1 in cima alla piramide. Dopodiché entrano BoA e gli insegnanti, che procedono a valutare le esibizioni preparate in anticipo, grazie alle quali i ragazzi vengono giudicati in base a capacità e talento e ricevono un voto da A, il più alto, a F, il più basso, escludendo la lettera E. Divisi per lettera, i concorrenti formano delle classi temporanee con cui svolgere gli allenamenti. Alla fine dell'episodio viene mostrata la classifica popolare, con Park Ji-hoon della Maroo Entertainment al primo posto.
Episodio 2 (14 aprile 2017) Le valutazioni terminano e i ragazzi vengono smistati nei dormitori in base al voto ricevuto. BoA annuncia che si esibiranno a M! Countdown con il brano "It's Me (Pick Me)", del quale dovranno imparare testo e coreografia nei giorni successivi, dopodiché saranno valutati nuovamente. La distribuzione delle parti e la partecipazione complessiva all'esibizione saranno determinate dal voto finale, con i membri del gruppo A che avranno maggior risalto e i membri del gruppo F che faranno da ballerini sullo sfondo. Dopo tre giorni di pratica, ciascun concorrente si filma mentre esegue "It's Me (Pick Me)" ed è destinato alla classe definitiva. Ciascuno riceve dai mentori una scheda recante il nuovo voto, poi lo staff chiede ai ragazzi di spostarsi nelle nuove aule. L'episodio termina con un membro non identificato del gruppo F che entra a far parte nel gruppo A.
Episodio 3 (21 aprile 2017) I ragazzi si spostano nei nuovi gruppi dopo essere stati rivalutati. Tre appartenenti al gruppo F salgono alla classe superiore: Yoon Hee-seok della Jellyfish Entertainment e Jeong Won-cheol della HF Music Company si spostano nella B, mentre Kim Tae-dong della The Vibe Label nella A. Iniziano a provare "It's Me (Pick Me)", poi gli appartenenti alla classe A eseguono delle performance singole preparate in un'ora: agli altri ragazzi viene chiesto di scegliere quello che preferiscono, e il più votato sarà il centro dell'esibizione. Il prescelto è Lee Dae-hwi della Brand New Music Entertainment. Dopo la performance a M! Countdown, BoA annuncia che alla prova successiva verranno eliminati i 40 concorrenti risultanti agli ultimi posti della classifica popolare (da 61 a 101). La missione prevede un'esibizione a gruppi al cospetto di un pubblico, eseguendo il brano di un gruppo maschile. Essendo il centro di "It's Me (Pick Me)", Lee Dae-hwi sceglie per primo i componenti della propria squadra (da cinque a sette), mentre gli altri quindici capigruppo vengono stabiliti estraendo a sorte dei bussolotti. I capigruppo competono poi in una gara di corsa per l'assegnazione delle canzoni, ma soltanto i primi otto arrivati ricevono il brano prescelto e possono scegliere una squadra da sfidare. Ogni brano viene così eseguito dal vivo da due gruppi e ciascun membro viene valutato singolarmente dal pubblico presente; i voti di ognuno vengono poi sommati per determinare il punteggio totale del gruppo e la squadra vincitrice tra le due. I componenti delle squadre vincenti riceveranno 3000 punti in più a testa. Il punteggio totale di ogni ragazzo, valido per la compilazione della classifica definitiva, verrà determinato sommando in seguito i voti pervenuti tramite Internet. Il gruppo con più voti ottiene anche la possibilità di esibirsi nuovamente a M! Countdown.
In questo episodio vengono mostrate le prove e le esibizioni dei seguenti gruppi: 10 Out of 10 dei 2PM Squadra 1: Yoon Ji-seong (leader, centro, controcanto), Lee Hoo-lim (controcanto), Kim Hyeon-woo (controcanto), Yoon Jae-chan (voce principale), Kim Tae-woo (rapper), Kim Tae-min (rapper) Squadra 2: Park Woo-jin (leader, rapper), Roh Tae-hyun (voce principale), Yoo Yong-bin (controcanto), Hong Eun-ki (centro, controcanto), Byun Hyun-min (controcanto), Ahn Hyeong-seop (controcanto), Yoon Yong-bin (rapper) Vincitore: Squadra 2 Call Me Baby degli EXO Squadra 1: Jeong Won-cheol (leader, controcanto), Yoon Hee-seok (controcanto), Kim Dong-han (centro, controcanto), Kim Seong-lee (voce principale), Jang Moon-vok (rapper), Seong Hyun-woo (rapper) Squadra 2: Joo Jin-woo (leader, voce principale), Ha Min-ho (centro, rapper), Jang Dae-hyeon (rapper), Lee Seo-kyu (controcanto), Jeong Si-hyun (controcanto), Kim Dong-bin (controcanto) Vincitore: Squadra 1
Episodio 4 (28 aprile 2017) Salgono sul palco uno dopo l'altro i dodici gruppi restanti, così composti: Replay degli SHINee Squadra 1: Yeo Hwan-ung (leader, controcanto), Choi Min-gi (controcanto), Justin (centro, controcanto), Lee Gwang-hyun (controcanto), Zhu Zhengting (controcanto), Lee Keon-hee (voce principale) Squadra 2: Yu Jin-won (controcanto), Choi Tae-woong (controcanto), Kim Sang-kyun (centro, controcanto), Kim Jae-han (voce principale), Ryu Ho-yeon (controcanto), Joo Jin-woo (controcanto) Vincitore: Squadra 1
Mansae dei Seventeen Squadra 1: Kim Tae-dong (leader, centro, rapper), Park Woo-dam (voce principale), Ju Won-tak (controcanto), Kim Yeon-kuk (controcanto), Woo Jin-young (rapper). Nam Yoon-sung si ritira durante le prove per motivi di salute. Squadra 2: Cho Gyu-min (leader, centro, rapper), Kim Yong-jin (voce principale), Kim Chan-yul (controcanto), Jo Seong-wook (controcanto), Jeong Joong-ji (controcanto), Choi Ha-don (rapper) Vincitore: Squadra 1
Sorry, Sorry dei Super Junior Squadra 1: Ha Min-ho (leader, controcanto), Kwon Hyub (centro, controcanto), Yu Seon-ho (controcanto), Jo Yong-geun (controcanto), Kim Nam-hyung (controcanto), Choi Dong-ha (voce principale) Squadra 2: Kim Jong-hyeon (leader, controcanto), Ong Sung-woo (centro, controcanto), Hwang Min-hyun (controcanto), Kang Daniel (controcanto), Kwon Hyun-bin (controcanto), Kim Jae-hwan (voce principale) Vincitore: Squadra 2
Shock dei Beast Squadra 1: Kim Do-hyun (leader, rapper), Choi Seung-hyeok (centro, controcanto), Seo Seong-hyuk (controcanto), Son Dong-myeong (controcanto), Jung Hyo-jun (rapper), Wang Min-hyeok (voce principale) Squadra 2: Park Hee-seok (leader, controcanto), Yoo Kyoung-mok (centro, controcanto), Lee Ki-won (controcanto), Im Woo-hyeok (rapper), Jung Dong-su (rapper), Choi Jin-hyung (voce principale) Vincitore: Squadra 2
Be Mine degli Infinite Squadra 1: Lee Ji-han (centro, controcanto), Yoo Hoe-seung (leader, voce principale), Kim Chan (controcanto), Choi Hee-soo (controcanto), Choi Jae-woo (rapper), Kim Ye-hyeon (rapper) Squadra 2: Takada Kenta (centro, rapper), Lee You-jin (leader, rapper), Kim Dong-hyun (controcanto), Jung Se-woon (controcanto), Park Sung-woo (controcanto), Lim Young-min (rapper), Lee Woo-jin (voce principale) Vincitore: Squadra 2
Boy In Luv dei BTS Squadra 1: Lee Eui-woong (rapper principale), Kim Samuel (rapper), Joo Hak-nyeon (rapper), Ha Seng-un (leader, canto), Lee Dae-hwi (canto), Bae Jin-young (canto), Park Ji-hoon (centro, canto) Squadra 2: Kim Sang-been (leader, rapper principale), Lai Kuan-lin (rapper), Lee In-soo (centro, rapper), Kang Dong-ho (canto), Jin Longguo (canto), Lee Gun-min (canto) Vincitore: Squadra 1
Dopo l'ultima esibizione, ai ragazzi viene mostrata la classifica individuale basata solamente sui voti ricevuti dalla platea, sommati ai 3000 punti aggiuntivi per i concorrenti delle squadre vincitrici. Park Woo-dam della HF Music Company prende il primo posto della classifica individuale e la sua squadra (la prima di Mansae) della classifica dei gruppi; può così esibirsi nuovamente a M! Countdown.
Episodio 5 (5 maggio 2017)