Biografia Monaco agostiniano, Miniscalchi fu un compositore stimato, soprattutto nell'ambiente musicale veneto. Nel 1616 pubblicò Coelum armonicum seu concentus a una, due e tre voci (ora perduto). Nel 1622 divenne maestro di cappella della chiesa di S. Stefano a Venezia e pubblicò il salmo Miserere mei Deus concertato a tre voci con sinfonia ... et in fine doi motetti a duo voci. Divenne molto popolare per le sue canzoni profane a voce sola contenute principalmente in tre libri di Arie pubblicati a Venezia nel 1625, 1627 e 1630. La produzione più rilevante di Miniscalchi sembra essere quella relativa al suo primo libro di arie.
Opere Libro di Salmi e mottetti concertati, 1622. Arie per cantarsi nella spinetta, chitarrone e simile istromento in tre libri, pubblicati rispettivamente nel 1625, 1627, 1630. Il Vicenti, che li pubblicò, testimonia come la riedizione del secondo libro ebbe un particolare successo. Due arie in Quarto scherzo delle ariose vaghezze di Carlo Milanuzzi (1624) Bibliografia Larousse de la musique, 1957;
Roark Miller, The Composers of San Marco and Santo Stefano and the Development of Venetian Monody (to 1630) (dissertazione, Università del Michigan, 1993);
Nigel Fortune, Roark Miller, voce Miniscalchi, Guglielmo, in New Grove Dictionary.