Si unì ai rivoltosi durante la guerra d'indipendenza del Messico.González Cosío, Bertha (1992). "José Manuel de Herrera". En Galeana, Patricia. Cancilleres de México. Tomo I. 1821–1911 (1a. edición). Ministry of Foreign Affairs of Mexico. pp. 10–35.
Nel 1815, Morelos lo nominò plenipotenziario per negoziare con il governo degli Stati Uniti a Washington il rifornimento di armi e munizioni. Per questo viaggio, Morelos gli affidò la custodia di suo figlio Juan Nepomuceno Almonte, tuttavia riuscirono solo a raggiungere New Orleans. Dopo la morte di Morelos, Herrera tornò a Puebla, dove accettò il perdono offerto dal viceré Juan Ruiz de Apodaca.
Fu il presidente della Camera dei deputati nel 1828 e nel 1829.
Note