Il motivo RNA asd è una catena di RNA a struttura conservata che si trova in alcuni batteri dell'acido lattico. Il motivo asd è stato rilevato sia in vitro, con valutazioni bioinformatiche, che in vivo: un singolo motivo RNA asd è stato rilevato nello Streptococcus pyogenes da esperimenti di microarray e di Northern blot come una molecola di 170 nucleotidi chiamata "SR914400". È stato determinato che il sito di inizio della trascrizione per SR914400 corrisponde all'estremità 5′ della molecola mostrata nel diagramma di consenso.
Alcuni RNA asd sono collegati a geni associati a una funzione di regolazione cis. Tuttavia, diversi indizi indicano che questo non sia il ruolo biologico degli RNA asd:
In alcuni casi il motivo RNA asd è assente dall'estremità 5' non tradotta dei geni annotati. In Streptococcus mutans, immediatamente a valle del terminatore della trascrizione che segue l'RNA asd, c'è un forte promotore di un gene. Questa disposizione suggerisce che il gene viene trascritto successivamente al termine della trascrizione dell'RNA asd. Nonostante il gene asd codifichi per l'enzima aspartato-semialdeide deidrogenasi, che partecipa alla sintesi di metionina, lisina e treonina, i livelli di trascrizione del gene asd rimangono costanti anche al variare delle concentrazioni di questi amminoacidi.
Note
Categoria:RNA non codificante