Carriera Yaikel Pérez inizia la carriera giocando per le giovanili del Ciudad de La Habana. Dal 2005 fa parte della nazionale cubana, centrando la qualificazione alla CONCACAF Gold Cup 2005, per cui viene convocato per la fase finale disputatasi negli Stati Uniti. Durante la manifestazione diserta insieme a diversi suoi compagni, firmando successivamente un contratto da professionista con il Miami FC nel 2006.
Dopo aver giocato per diverse squadre tra i campionati statunitense, portoricano, honduregno e vietnamita, termina la sua carriera nel 2017 nell'Harrisburg Heat, squadra iscritta alla MASL, il campionato statunitense di calcio indoor.
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