È primatista di presenze (14) con il Bolton nelle competizioni calcistiche europee.
Caratteristiche tecniche Era un esterno destro.
Carriera Club Figlio dell'ex calciatore Alekos Giannakopoulos, inizia la propria trafila nel settore giovanile dell'Ethnikos Asteras, dove arriva a sette anni di età. Trascorre una stagione al Doxa Vyrona, dove contribuisce alla promozione della squadra in seconda serie greca.
Tornato all'Ethnikos, esordisce giovanissimo nella terza divisione del campionato greco nell'autunno 1991, in una stagione che si conclude con la promozione del club in terza divisione. L'anno successivo, nella sua prima stagione da professionista, segna 6 gol.
Nel 1993 passa al Paniliakos, dove in tre anni segna 26 gol in 84 partite. In questo periodo si conquista un posto da titolare nell'Under-21 greca.
Nell'estate 1996 viene acquistato dall'Olympiakos. Qui si afferma come centrocampista, segnando diversi gol anche in Champions League. Giannakopoulos conquista la Nazionale maggiore, convocato prima da Vassilis Danil e poi da Otto Rehhagel.
Veste la maglia biancorossa per sette stagioni, durante le quali vince altrettanti campionati e una Coppa di Grecia nel 1999. In questo periodo entra a far parte stabilmente della Nazionale, a partire dal 1997.
Nell'estate del 2003 si trasferisce al Bolton a parametro zero, essendo scaduto il suo contratto con l'Olympiakos Pireo. Vestirà per molti anni la maglia numero 7 del club inglese, scegliendo di apporre proprio la scritta Stelios al posto del suo cognome. È schierato da Sam Allardyce prevalentemente come esterno destro di centrocampo. Il 28 gennaio 2006 una sua rete permette alla squadra di eliminare l'Arsenal dalla FA Cup nei sedicesimi di finale.
Al termine della stagione 2007-2008 il suo contratto scade e il 23 settembre 2008 è acquistato a parametro zero dalla compagine inglese dell'Hull City, squadra neopromossa in Premier League, con la quale ottiene due presenze nella prima parte della stagione. Il 22 gennaio 2009 torna in patria nelle file del Larissa. Nelle file del club ellenico ritrova Nikolaos Dabizas e Stylianos Venetidīs, suoi ex compagni di Nazionale al . Giannakopoulos contribuisce al quinto posto nel campionato greco e alla qualificazione per l'Europa League.
Nazionale Giannakopoulos è stato uno dei protagonisti della nazionale greca guidata da Otto Rehhagel alla vittoria del Campionato d'Europa del 2004 in Portogallo. Ha iniziato come titolare la finale disputata a Lisbona il 4 luglio contro i padroni di casa. Risultò peraltro importante, ai fini della partecipazione della squadra ellenica ai campionati europei, un gol siglato a Saragozza da Giannakopoulos, decisivo per la vittoria della Grecia di quella partita e conseguentemente anche del girone di qualificazione, proprio davanti alla Spagna, poi ritrovata dai greci nel girone portoghese.
Statistiche Cronologia presenze e reti in nazionale
Palmarès Club
Olympiakos: 1996-1997, 1997-1998, 1998-1999, 1999-2000, 2000-2001, 2001-2002, 2002-2003
Olympiakos: 1998-1999
Nazionale
Individuale Calciatore greco dell'anno: 1 2003
Note
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