La sua fama è principalmente dovuta agli scavi presso l'isola di Thera, l'attuale Santorini, durante i quali riportò alla luce i resti di una città Minoica, Akrotiri, distrutta e contemporaneamente conservata da un'imponente eruzione vulcanica. Marinatos sostenne, inoltre, che il mito di Atlantide non sarebbe altro che la memoria, deformata e ingigantita, dell'antica civiltà minoica, teoria supportata e analizzata da molti altri studiosi nel corso dello scorso secolo.
Marinatos è stato Ministro della Cultura durante la Dittatura dei colonnelli. Ha scritto, inoltre, vari libri sul tema della civiltà minoica.
Nel 1967 vinse il Premio Herder.
Bibliografia Kunst und Religion im alten Thera, di Nanno Marinatos, Mathioulakis & Co. KG, Athen, 1987 Kreta, Thera und das mykenische Hellas, di Spyridon Marinatos, Hirmer, München, 1986 Some Words about the Legend of Atlantis, di Spyridon Marinatos, Chrys Papachrysanthou, Atene, 1971 L'uomo di Atlantide - Mario La Ferla (sulla strana morte di Marinatos) http://www.lostinn.com/lworld/marinatos.htm Quel maledetto imbroglio di via Telniches - (sulla strana morte di Marinatos) http://www.antikitera.net/articoli.asp?ID=37 Alla ricerca della tomba perduta - (sulla sparizione della tomba di Marinatos) http://www.antikitera.net/articoli.asp?ID=60 Il ritrovamento della vera Atlantide - Charles Pellegrino (Thera: nascita, esplosione, scoperta, scavi di Akrotiri, frammenti biografici dei personaggi coinvolti)
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