Biografia Figlio di Massimiliano II Emanuele di Baviera e di Teresa Cunegonda di Polonia. Vista la sua condizione di fratello minore, giovanissimo, intraprese la carriera ecclesiastica ed il 12 marzo 1719, al posto del fratello Clemente Augusto, ottenne il vescovato di Frisinga.

Poco dopo acquisì anche il vescovato di Ratisbona. Con questi vescovati in suo possesso assunse una posizione favorevole alla Francia e a Carlo Alberto di Baviera, sostenuto nella sua ascesa al trono imperiale di Borbone. Luigi XV, nel 1732, sostenne la candidatura di Giovanni Teodoro a Gran Maestro dell'Ordine Teutonico, ruolo che invece venne poi affidato al fratello, Clemente Augusto.

Nel 1743 venne nominato cardinale e nel 1744 vescovo di Liegi, dove morì il 27 gennaio 1763.

È annoverato in quella generazione dei Wittelsbach che ebbe molti membri appartenenti al clero.

Genealogia episcopale e successione apostolica La genealogia episcopale è: Cardinale Scipione Rebiba Cardinale Giulio Antonio Santori Cardinale Girolamo Bernerio, O.P. Arcivescovo Galeazzo Sanvitale Cardinale Ludovico Ludovisi Cardinale Luigi Caetani Cardinale Ulderico Carpegna Cardinale Paluzzo Paluzzi Altieri degli Albertoni Papa Benedetto XIII Arcivescovo Clemente Augusto di Baviera Cardinale Giovanni Teodoro di Baviera

La successione apostolica è: Vescovo Johann Ferdinand Joseph von Boedigkeim (1730) Vescovo Franz Ignaz Albert von Werdenstein (1756)

Ascendenza

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