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La quarta stagione della serie televisiva Bones è stata trasmessa in prima visione negli Stati Uniti d'America da Fox dal 3 settembre 2008 al 14 maggio 2009.

In Italia è stata trasmessa in prima visione da Rete 4 dal 16 gennaio al 17 aprile 2010.

nº Titolo originale Titolo italiano Prima TV USA Prima TV Italia 1 Yanks in the U.K. (Part 1 & 2) Due americani a Londra (prima e seconda parte) 3 settembre 2008 16 gennaio 2010 2 3 The Man in the Outhouse Poligamia 10 settembre 2008 23 gennaio 2010 4 The Finger in the Nest Il dito nel nido 17 settembre 2008 5 The Perfect Pieces in the Purple Pond Perdere la testa 24 settembre 2008 30 gennaio 2010 6 The Crank in the Shaft Un capo troppo esigente 1º ottobre 2008 7 The He in the She Non fermarsi alle apparenze 8 ottobre 2008 6 febbraio 2010 8 The Skull in the Sculpture Morte in scatola 5 novembre 2008 9 The Con Man in the Meth Lab Scambio d'identità 12 novembre 2008 13 febbraio 2010 10 The Passenger in the Oven Un passeggero nel forno 19 novembre 2008 11 The Bone That Blew Genitori e figli 26 novembre 2008 20 febbraio 2010 12 Double Trouble in the Panhandle Ossa siamesi 22 gennaio 2009 13 Fire in the Ice Scontro sul ghiaccio 29 gennaio 2009 27 febbraio 2010 14 The Hero in the Hold Il fantasma del passato 5 febbraio 2009 15 The Princess and the Pear Cavaliere misterioso 19 febbraio 2009 6 marzo 2010 16 The Bones That Foam Schiuma 12 marzo 2009 17 The Salt in the Wounds Amiche per la pelle 19 marzo 2009 13 marzo 2010 18 The Doctor in the Den Una donna coraggiosa 26 marzo 2009 19 The Science in the Physicist La banda dei cervelli 2 aprile 2009 20 marzo 2010 20 The Cinderella in the Cardboard La Cenerentola nel cartone 9 aprile 2009 21 Mayhem on the Cross L'aquila di sangue 15 aprile 2009 27 marzo 2010 22 The Double Death of the Dearly Depart La doppia morte del caro estinto 16 aprile 2009 23 The Girl in the Mask La maschera della morte 23 aprile 2009 10 aprile 2010 24 The Beaver in the Otter Morte di una mascotte 30 aprile 2009 25 The Critic in the Cabernet Desiderio di maternitàIn questo episodio è avvenuto un particolare crossover con la serie televisiva animata I Griffin: Seeley Booth, vittima di allucinazioni, si ritrova a conversare con Stewie Griffin. 6 maggio 2009 17 aprile 2010 26 The End In The Beginning Sogno e realtà 14 maggio 2009

Due americani a Londra (prima e seconda parte) Titolo originale: Yanks in the U.K. (Part 1 & 2) Diretto da: Ian Toynton Scritto da: Hart Hanson e Karine Rosenthal (prima parte), Stephen Nathan e Scott Williams (seconda parte) Trama Bones sta tenendo una conferenza all'università di Oxford in Inghilterra insieme a Booth. Il suo collega inglese Ian Wexler coinvolto in un caso di omicidio chiede a Bones e a Booth di unirsi a lui e all'ispettore Pritchard di Scotland Yard per risolvere l'omicidio. Una macchina appartenente a Portia Frampton, figlia di un magnate americano emigrato in Inghilterra è stata tirata fuori dal Tamigi con il suo cadavere dentro. Dopo che i resti sono stati mandati al Jeffersonian tocca a Booth e a Bones risolvere l'omicidio grazie al contributo da parte del Jeffersonian. Intanto il marito di Angela arriva al Jeffersonian e crea caos fra Angela e Hodgins. Ma, mentre Bones e Booth stanno per partire, Pritchard li chiama perché Ian Wexler è stato trovato morto, e i due decidono di risolvere il caso prima possibile. Al Jeffersonian l'ex marito di Angela e Cam finiscono a letto insieme e Angela e Hodgins non prendono bene la cosa.

Ascolti USA: telespettatori (prima parte) e (seconda parte) Ascolti Italia: telespettatori (prima parte) e (seconda parte)- share 5,09%

Poligamia Titolo originale: The Man in the Outhouse Diretto da: Steven DePaul Scritto da: Carla Kettner e Mark Lisson Trama Viene ritrovato un cadavere in un gabinetto pubblico, si scopre poi che la vittima è il presentatore di un noto show in cui si scoprono i mariti infedeli. Nel frattempo Bones ha due relazioni, una con un passionale saldatore subacqueo, più "fisica", ed una con un biologo, che lei definisce più stimolante intellettualmente e con cui esce soltanto, senza arrivare alla camera da letto; per questa sua posizione Bones difende la poligamia come una condizione naturale nella società dell'uomo, anche se alla fine dovrà ammettere che Booth aveva ragione e che la poligamia non porta nulla di buono. Inoltre da adesso cominceranno a lavorare, come assistenti della dottoressa, vari tirocinanti per ricoprire il ruolo lasciato da Zack.

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Il dito nel nido Titolo originale: The Finger in the Nest Diretto da: Jeff Woolnough Scritto da: Lyla Oliver Trama Booth e suo figlio giocano nel parco e scoprono un nido di uccelli su un albero, allora Booth solleva Parker per fargli vedere se ci sono degli uccellini dentro, ma invece il ragazzo ci trova un dito umano.

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Perdere la testa Titolo originale: The Perfect Pieces in the Purple Pond Diretto da: Jeannot Szwarc Scritto da: Josh Berman Trama Vengono ritrovati i resti di un ragazzo diviso in dodici pezzi e senza la testa, in una vasca di una fabbrica abbandonata e la cui acqua diventa viola. Il ragazzo viene identificato come uno scrittore di fantascienza con una fissazione maniacale per i germi. La vittima però stava cercando di guarire e aveva anche trovato l'amore; Bones e Booth continuano ad indagare ma non riescono ad arrivare alla soluzione finché non si vedono spuntare Zack dell'ingresso del laboratorio con in mano i dati del caso, che gli erano stati lasciati al centro di igiene mentale da Hodgins, e la scoperta del colpevole. Infatti dalle foto della casa della vittima, in cui viveva con la madre, si vede che di ogni oggetto si trovano dodici pezzi tranne che di una fontana nel giardino, sotto cui è seppellita la testa del figlio della donna con sindrome ossessiva-compulsiva, che era stata terrorizzata di perdere il suo equilibrio lasciando che suo figlio guarisse e si sposasse. Alla fine nel riportare Zack al manicomio Sweets scoprirà la verità su di lui ma sarà costretto a non rivelarlo a causa del segreto tra dottore e paziente.

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Un capo troppo esigente Titolo originale: The Crank in the Shaft Diretto da: Steven DePaul Scritto da: Elizabeth Benjamin Trama I resti di una donna vengono scoperti in un vano ascensore e Booth e Brennan devono capire a chi appartengono. Si scopre che era il capo ufficio detestato da molti e scoprire da quale collega sia stata uccisa sarà difficile. Nel frattempo, Angela e Hodgins cercano di fare la pace in laboratorio dopo la loro rottura. Alla fine si scoprirà il colpevole nella centralinista, che ha ucciso senza volere la capo ufficio tirandole una banale cucitrice ed aiutata da un collega aveva simulato la caduta nell'ascensore dal 16º piano.

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Non fermarsi alle apparenze Titolo originale: The He in the She Diretto da: Craig Ross Jr. Scritto da: Karina Csolty Trama In una cittadina sulla costa viene ritrovata la metà superiore di un cadavere di donna, in mare, si tratta del pastore della comunità che accettava chiunque volesse farvi parte. Quando viene ritrovata la metà inferiore però si scopre che lei era una transessuale, in precedenza un uomo che faceva il pastore in televisione prendendo molti soldi dai credenti. La vittima dunque aveva cambiato aspetto e sesso per cambiare vita, lasciando sua moglie e suo figlio nell'agiatezza ma andando a fare qualcosa che la rendeva felice, cioè aiutare gli altri. Alla fine si scopre che l'assassina era l'ex moglie di un uomo della comunità della vittima che si era innamorato di lei. Durante l'indagine si scopre che dopo la scomparsa della vittima (quando ha cambiato sesso e finto la sua morte), anche il figlio era scomparso, ma lui invece viene ritrovato da Sweets in un centro di recupero per criminali perché anche lui aveva capito che la cosa giusta da fare era aiutare gli altri e non predicare per ottenere soldi. Il figlio prenderà quindi il suo posto nella comunità e con il suo primo sermone farà riflettere sul non fermarsi alle apparenze.

Nota. A partire da questo episodio, la musica dei titoli di coda viene cambiata.

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Morte in scatola Titolo originale: The Skull in the Sculpture Diretto da: Allan Kroeker Scritto da: Janet Lin Trama Viene ritrovato un cadavere in un blocco di macchine compresse e spedito al Jeffersonian. Quando stanno per aprire la scatola vengono fermati perché la manager di un famoso artista sostiene che quella sia la sua ultima opera d'arte, la più sublime in cui l'artista si sia inglobato; in realtà Angela scoprirà, grazie ad un suo software che l'artista è stato ucciso e che quindi l'opera d'arte deve essere aperta per poter trovare l'assassino. Inizialmente i sospetti ricadono sulla sua assistente Roxie Lyon, una vecchia fiamma di Angela, che eredita tutte le proprietà dell'artista, comprese le sue opere di vari milioni di dollari, poi di un altro artista che aveva avuto meno successo ma era rimasto più fedele alla sua arte (e si scopre che aveva anche realizzato alcune opere della vittima per necessità di denaro), ma poi si scopre che l'assassina è la stessa manager: la donna infatti aveva bisogno di molti soldi per farsi ricoverare in una clinica messicana in cui provare una cura sperimentale per il suo tumore, allo stadio terminale, anche se poi Bones la avverte che sarebbe morta in ogni caso, perché il posto in cui la donna sperava di essere curata in realtà è una truffa. Nel corso del caso comunque, Angela e Roxie si riavvicinano e decidono di rimettersi assieme.

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Scambio di identità Titolo originale: The Con Man in the Meth Lab Diretto da: Allison Liddi-Brown Scritto da: Karine Rosenthal Trama Booth e Brennan indagano la scena in cui un corpo è stato scoperto nel corso di un esercizio di addestramento della polizia. Il team identifica il corpo come il padre di un inventore che si era da poco ritrovato col figlio. Ma quando viene ritrovato un secondo corpo, il team segue un sentiero di inganni per scoprire chi era il truffatore nella vita reale. Clark Edison ritorna al laboratorio e lui e Hodgins lavorano mettendo ad uno dei progetti di una delle invenzioni potenzialmente preziose dell'inventore. Nel frattempo, il fratello minore di Booth Jared (Brendan Fehr) si sposta a Washington per accettare un lavoro al Pentagono e Brennan, colpita da Jared, accetta di andare ad un appuntamento con lui a una funzione della Casa Bianca. Il suo appuntamento con Jared la porta a conoscere dettagli sul passato di Booth e darle una comprensione migliore sulle motivazioni del suo partner.

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Un passeggero nel forno Titolo originale: The Passenger in the Oven Diretto da: Steven DePaul Scritto da: Carla Kettner Trama Bones e Booth sono su un aereo in viaggio verso la Cina per un'importante conferenza di Bones, quando viene ritrovato un cadavere nel forno dell'aereo. Quando però atterreranno il caso diventerà della polizia, quindi Bones deve improvvisare un laboratorio nella cabina delle hostess. Bones e Booth si tengono in contatto audio e video con Cam e Angela al Jeffersonian per lavorare sul caso. Quando mancano ormai pochi minuti all'atterraggio riescono a scoprire l'assassino e Booth, in contatto con il procuratore a Washington, si fa fare un mandato per il giovane figlio di una coppia che stava andando in Cina per fare vedere alla moglie, malata terminale, la Grande Muraglia. Il marito aveva un legame sentimentale con la vittima.

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