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Gli albi fuori serie di Martin Mystère sono pubblicazioni che esulano dalla serie regolare di Martin Mystère. Negli anni sono state edite molte collane dedicate al personaggio, attualmente ce ne sono 3 con uscite regolari (di cui solo una di Sergio Bonelli Editore) e 3 con periodicità non definita. Le serie sono qui esposte in ordine cronologico.
Pubblicazioni in corso Speciale Martin Mystère (dal 1984, indicato anche come Martin Mystère Special), albi annuali estivi di formato consueto bonellide, ma con un numero diverso di pagine. Fino al n. 21 ad essi era allegato il Dizionario dei misteri, un libriccino di 64 pagine non a fumetti, di formato ridotto rispetto all'albo; dal n. 22 al n. 30 c'era invece Martin Mystère presenta, un fascicoletto spillato con le stesse dimensioni dello speciale, ma di sole 52 pagine. A partire dal n. 31 il volumetto non è più allegato e lo si può trovare rovesciando sottosopra l'albo, ottenendo così un flip-book. One shot (dal 1990), storie autoconclusive con periodicità irregolare, comprendenti team-up con personaggi Bonelli e altri racconti usciti in occasione di ricorrenze particolari. Libri (dal 2016), volumi cartonati contenenti romanzi in prosa inediti oppure ristampe (intere o parziali) di alcuni racconti usciti in tempistiche varie aventi il medesimo tema, più un dossier inedito sullo stesso tema. Ristampa IF Edizioni (dal 2023), ristampe mensili in ordine cronologico delle avventure a partire dal numero 1, contenenti due degli albi originali in ogni uscita. Raccolta IF Edizioni (dal 2024), collana semestrale con due numeri arretrati della ristampa IF Edizioni. Martin Mystère Pocket (dal 2026), volumi di formato "tascabile", con una maggiore foliazione e un prezzo più conveniente della media. Normalmente vi sono inserite ristampe di più episodi.
Pubblicazioni terminate Raccolta Martin Mystère (1987-2014), ripubblicazione di due numeri alla volta della serie regolare ottenuti tramite le rese dalle edicole. È iniziata a gennaio 1987 e terminata ad ottobre 2014 con il n. 161, che conteneva gli albi n. 327 e 328 della serie regolare. Almanacco del Mistero (1987-2014), albi annuali invernali della Collana Almanacchi. Oltre a contenere una storia completa di 92 pagine, includevano anche dossier su scrittori o luoghi misteriosi e recensioni di opere cinematografiche, letterarie, televisive ecc. a tema misterioso uscite nel corso dell'ultimo anno. Tutto Martin Mystère (1989-1999), pubblicazione mensile che ristampava in edizione "riveduta e corretta" gli albi della serie regolare, conclusa dopo 127 numeri. Per la lista delle storie vedere gli Albi di Martin Mystère. Zona X (1992-1999), spin-off di albi con due racconti di fantascienza, saltuariamente presentati e/o interpretati dallo stesso Martin Mystère, anche se ambientati in universi narrativi paralleli; fu quadrimestrale fino al numero 9, bimestrale dal 10 al 20, mensile dal 21 al 45. Martin Mystère Gigante (1995-2009), albi di grande formato ad uscita annuale e con una storia con più pagine del solito. Martin Mystère Extra (1996-2004), ristampa di racconti fuori collana di Martin Mystère usciti sui primi Speciali e Almanacchi, ma anche di alcune storie brevi pubblicate da altri editori (vedere anche Pubblicazioni extra di Martin Mystère). Storie da Altrove (1998-2020), altro spin-off a cadenza annuale ambientato nel passato della base di Altrove. Maxi Martin Mystère (2004-2023), volumi con una maggiore foliazione e nei quali normalmente sono inseriti più episodi. Dal numero 1 al 4 contenevano storie inedite, dal 5 sono iniziate le ristampe di alcuni racconti originariamente pubblicati nella collana Zona X; il numero 10 contiene il terzo team-up con Dylan Dog. Collezione storica a colori (2016-2017), venti volumi settimanali con 260/280 pagine a colori, usciti abbinati con La Repubblica e L'Espresso, contenenti la ristampa dei primi 50 numeri della serie regolare. Nuove avventure a colori (2016-2020), miniserie di albi mensili di 64 pagine a colori con storie con un Martin Mystère più giovane. La prima serie è stata un lungo racconto in 12 episodi, la seconda ha proposto dei remake di avventure classiche dei primi anni. Romanzi (2017-2023), libri non a fumetti editi annualmente. Martin Mystère Magazine (2022), albo facente parte della Collana Almanacchi, finora ne è uscito un solo numero nel quale sono stati celebrati i 40 anni di vita editoriale del personaggio.
Speciale Martin Mystère N. Titolo Pubblicato il Soggetto Sceneggiatura Disegni Copertina 1 Il cobra d'oro luglio 1984 Alfredo Castelli Franco Bignotti Giancarlo Alessandrini 2 Il tesoro di Loch Ness luglio 1985 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 3 Il segreto della Grande Piramide luglio 1986 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 4 La diabolica invenzione giugno 1987 Alfredo Castelli Giampiero Casertano Giancarlo Alessandrini 5 La città sotto i ghiacci luglio 1988 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 6 New Atlantis giugno 1989 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 7 Ultimatum a New York maggio 1990 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 8 Il segreto di Mozart giugno 1991 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 9 La Quarta Caravella giugno 1992 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 10 La città magica giugno 1993 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 11 Il cavaliere verde maggio 1994 Carlo Recagno Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 12 Contrappunto, scherzo e fuga giugno 1995 Alfredo Castelli Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 13 L'ultimo concerto maggio 1996 Marco Bertoli e Andrea Pasini Alfredo Castelli Lucio Filippucci e Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 14 Il cibo degli Dei giugno 1997 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 15 Il mondo di Escher giugno 1998 Enrico Lotti e Andrea Pasini Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 16 L'impareggiabile Reeves giugno 1999 Carlo Recagno Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 17 Mistero alle Olimpiadi giugno 2000 Alfredo Castelli Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 18 La ragazza nella torta luglio 2001 Alfredo Castelli e Andrea Pasini Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 19 La macchina della verità agosto 2002 Alfredo Castelli Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 20 Il mago della pioggia agosto 2003 Alfredo Castelli Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 21 Complotto a Wimbledon settembre 2004 Alfredo Castelli e Carlo Recagno Rodolfo Torti e Esposito Bros. Giancarlo Alessandrini 22 L'anno della cometa luglio 2005 Alfredo Castelli Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 23 Oggi, domani e ieri luglio 2006 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 24 Spade, sfide e magie luglio 2007 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 25 I misteri di Torrington luglio 2008 Alfredo Castelli Alfredo Castelli e Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 26 Trappola di celluloide luglio 2009 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 27 Le avventure del giovane Martin luglio 2010 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 28 I dolori del giovane Martin luglio 2011 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 29 Gli enigmi del giovane Martin luglio 2012 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 30 Il segno di venere luglio 2013 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 31 Martin contro Martin luglio 2014 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 32 Misteri a Blandings luglio 2015 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 33 Anni 30: troppi supereroi! luglio 2016 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini Giancarlo Alessandrini 34 Le molte vite di Martin Mystère luglio 2017 Carlo Recagno e Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini, Esposito Bros., Rodolfo Torti, Luigi Coppola, Paolo Ongaro Giancarlo Alessandrini 35 Le ombre di Camelot luglio 2018 Carlo Recagno Rodolfo Torti Giancarlo Alessandrini 36 L'uomo dal Rinascimento luglio 2019 Carlo Recagno Stefano Santoro e Giovanni Romanini Giancarlo Alessandrini 37 La vita è meravigliosa? luglio 2020 Alfredo Castelli Giancarlo Alessandrini e Fabio Grimaldi Giancarlo Alessandrini 38 Fiamme sulla laguna luglio 2021 Alberto Toso Fei Andrea Artusi e Mirco Zilio Paolo Ongaro Giancarlo Alessandrini 39 Il dado è tratto luglio 2022 Enrico Lotti e Alessandro Mainardi Walter Venturi Giancarlo Alessandrini 40 La Storia mysteriosa del mondo - Parte 1 luglio 2023 Alex Dante e Alfredo Castelli AA.VV. Giancarlo Alessandrini 41 La Storia mysteriosa del mondo - Parte 2 luglio 2024 Alex Dante e Alfredo Castelli AA.VV. Giancarlo Alessandrini 42 Il mistero di Martin Mystère - Parte uno luglio 2025 Alex Dante e Alfredo Castelli AA.VV. Giancarlo Alessandrini 43 Il mistero di Martin Mystère - Parte due dicembre 2025 Alex Dante e Alfredo Castelli AA.VV. Giancarlo Alessandrini 44 Brevi mysteri del XXI secolo luglio 2026 Alex Dante e Alfredo Castelli AA.VV. Giancarlo Alessandrini
Dizionari dei misteri allegati agli speciali Le copertine sono state tutte realizzate da Claudio Villa, tranne quella del numero 21, disegnata da Giancarlo Alessandrini.
N. Titolo A cura di 1 Luoghi e oggetti misteriosi Alfredo Castelli 2 Spettri, mostri e creature Mauro Boselli 3 Guida di Atlantide Alfredo Castelli 4 La scienza misteriosa Alfredo Castelli 5 Personaggi misteriosi Alfredo Castelli 6 Extraterrestri & UFO Alfredo Castelli 7 ESP Alfredo Castelli 8 I libri misteriosi Alfredo Castelli 9 Le dimore misteriose Alfredo Castelli 10 La cineteca mysteriosa Alfredo Castelli e Mario Gerosa 11 I segreti di re Artù Alfredo Castelli e Mario Gerosa 12 Le società segrete Alfredo Castelli 13 La musica mysteriosa Paolo Colombo e Alfredo Castelli 14 La cucina mysteriosa Giulio Cesare Cuccolini, Marco Bertoli, Elena Colombo, Giancarlo Malagutti 15 L'arte mysteriosa Alfredo Castelli e Giulio Cesare Cuccolini 16 I linguaggi mysteriosi Alfredo Castelli e Giulio Cesare Cuccolini 17 I detective dell'impossibile Alfredo Castelli e Giulio Cesare Cuccolini 18 Gli scienziati dell'incredibile Giulio Cesare Cuccolini 19 La vita segreta di Martin Mystère Stefano Priarone 20 I signori dei complotti Alfredo Castelli e Stefano Priarone 21 I mysteri dello sport Stefano Priarone
"Martin Mystère presenta" allegati o sul retro degli speciali