Biografia Ordinato sacerdote nel 1892, si dedicò fin da giovane alle scienze bibliche sotto la guida di David Castelli (1836-1901) all'Istituto di Studi Pratici e Superiori di Firenze. Nel 1901 ottenne la cattedra di Lingua e letteratura ebraica all'Università di Firenze, dove rimase fino al 1909, anno in cui si trasferì all'Università di Pisa. Dal 1896 al 1899 fondò e diresse la Rivista bibliografica italiana. Nel 1901 fondò, e diresse fino al 1907, il periodico Studi religiosi, la cui nascita diede l'avvio al modernismo italiano. Nel 1908, chiusa Studi religiosi, fondò una nuova rivista, La vita religiosa, di fatto continuazione della precedente; quest'ultima rivista cessò tuttavia le pubblicazioni dopo l'uscita del terzo numero.
In realtà, più che modernista, Minocchi era un razionalista. Nel 1908, in seguito a una conferenza sulla Genesi tenuta a Firenze il 23 gennaio dello stesso anno, Minocchi fu sospeso a divinis; poco dopo lasciò l'abito ecclesiastico e abbandonò tutte le attività religiose, dedicandosi esclusivamente agli studi e all'insegnamento universitario di storia delle religioni. Nel 1912 si sposò col rito civile.
Muore nel 1943 a Travale.
Scritti Bellosguardo a Firenze: Memorie storiche e letterarie. Firenze: Tipografia di Enrico Ariani, 1902 Cresto e i crestani . Roma: Tipografia dell'Unione editrice, 1914 Crisi odierna del cattolicesimo in Germania . Firenze: Tipografia Enrico Ariani, 1907 Eva: Mistero drammatico. Firenze: Succ. B. Seeber, 1925 Gli inni di Mosè e di Debora, tradotti dall'ebraico e illustrati dal dott. S. Minocchi. Milano: Tipografia Serafino Ghezzi, 1896 Gli Italiani in Russia e in Siberia: lettere e documenti . Firenze, 1933 (Poggio Mirteto: Arti grafiche Sabine) I miti babilonesi e le origini della gnosi . Roma: Tipografia Unione Editrice, 1914 I Salmi, tradotti dal testo ebraico comparato colle antiche versioni, con introduzione e note del sac. Salvatore Minocchi. Firenze: Tipografia Minori corrigendi, 1895; Roma: Federico Pustet, 1905 I Vangeli, tradotti e annotati da Salvatore Minocchi; con una lettera del cardinale Capecelatro; in appendice: Frammento apocrifo secondo Pietro. Firenze: Biblioteca Scientifico-religiosa; Roma: Libreria Pontificia di F. Pustet, 1900 Il Cantico dei cantici, tradotto e commentato da Salvatore Minocchi; con uno studio sulla donna e l'amore nell'antico Oriente. Roma: E. Voghera, 1898 Il martirio di S. Sebastiano. Roma: Tipografia della Camera dei Deputati, 1911 Il Nome di Maria, saggio critico storico. Firenze: Libreria editrice S. Raffaele, 1897 Il Nuovo Testamento, tradotto e annotato da Salvatore Minocchi. Firenze: Biblioteca Scientifico-religiosa; Roma: Libreria Pontificia di F. Pustet Il Panteon: origini del Cristianesimo . Firenze: Succ. B. Seeber, 1914 Il poema sacro: guida storico-religiosa alla Divina Commedia . Bari: Laterza, 1937 Il salterio davidico: nuove ricerche di critica biblica . Firenze: Biblioteca scientifico-religiosa, 1905 L'enigma della genesi nel pensiero antico e moderno . Firenze: Tipografia Enrico Ariani, 1908 L' Ingegno e le opere di Luisa Anzoletti, Lettura fatta il 13 aprile 1896 al Circolo filologico di Firenze. Milano: L. Cogliati Edit., 1896 (Firenze, Scuola Tip. Salesiana) L'ombra di Dante. Firenze: F. Le Monnier, 1921 La "Legenda trium sociorum" : nuovi studi sulle fonti biografiche di San Francesco d'Assisi. Firenze: Tip. Galileiana, 1900 La Genesi con discussioni critiche. Firenze: Biblioteca scientifico-religiosa, 1908 La protezione degli animali e la pietà cristiana . Roma: Società romana per la protezione degli animali, 1906 La questione francescana . Torino: Ermanno Loescher, 1902 La religione come scienza storica : principii di una scienza della religione. Firenze, 1923 Le lamentazioni del profeta Geremia, tradotte e commentate da S. Minocchi con uno studio sulla poesia elegiaca nell'antico Oriente. Roma: Desclée, Lefebvre e c., 1897 Le mistiche nozze di San Francesco e Madonna povertà, allegoria francescana del secolo XIII edita in un testo del Trecento da Salvatore Minocchi. Firenze: Biblioteca scientifico-religiosa, 1901 Le profezie d'Isaia, tradotte e commentate da Salvatore Minocchi. Bologna: Libreria Matteuzzi, 1907 Manuale di Lingua araba, ad uso delle scuole. Firenze: R. Bemporad e Figlio, 1914 (E. Ariani) Memorie di un modernista. Firenze: Vallecchi, stampa 1974 Mosè e i libri mosaici. Modena: Formiggini, 1911 Per la Manciuria a Pechino: ottobre 1903 . Firenze: Libreria B. Seeber, 1904 Pia de' Tolomei : dramma romantico. Firenze: B. Seeber, 1926 Religione e filosofia. Modena: A. F. Formiggini, 1910 Storia dei salmi e dell'idea messianica, 5 letture fatte dal R. Istituto di Studi Superiori a Firenze durante la Quaresima dell'anno 1902. Firenze: Biblioteca scientifico-religiosa, 1904 Un disinganno della scienza biblica : i papiri aramaici Elefantina . Roma: Bilychnis, 1920 Un tramonto a Vallombrosa. Roma: Direzione della Nuova antologia, 1924
Bibliografia F. Malgeri, «MINOCCHI, Salvatore». In: Dizionario Biografico degli Italiani, Vol. LXXIV, Roma: Istituto della Enciclopedia Italiana, 2010
Giuseppe Martini (a cura di), Dalle "Memorie di un modernista" di Salvatore Minocchi, Genova, s. n., 1961.
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