La stagione 1999-2000 degli Houston Rockets fu la 33ª nella NBA per la squadra del Texas.
Gli Houston Rockets arrivarono sesti nella Midwest Division della Western Conference con un record di 34-48, non qualificandosi per i play-off.
Roster
Staff tecnico Allenatore: Rudy Tomjanovich Vice-allenatori: Larry Smith, Jim Boylen, Mike Wells
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