L'Autorità di bacino interregionale della Puglia era una delle Autorità interregionali istituite a seguito dell'art. 13 della legge del 18 maggio 1989, n. 183.
Il territorio gestito comprendeva 297 comuni suddivisi fra i seguenti enti: Basilicata Provincia di Potenza 23 comuni Campania Provincia di Avellino 25 comuni Puglia Città metropolitana di Bari 47 comuni Provincia di Brindisi 20 comuni Provincia di Foggia 56 comuni Provincia di Lecce 97 comuni Provincia di Taranto 29 comuni
La sede amministrativa era a Valenzano.
Nel 2017 Autorità di bacino interregionale della Puglia è stata soppressa per confluire nella nuova Autorità di bacino distrettuale dell'Appennino meridionale, la cui sede è a Caserta.
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