Suo padre, Cristoforo Bathory, governava la Transilvania come voivoda per conto del monarca assente, Stefano I Báthory. Sigismondo era ancora un bambino quando la Dieta della Transilvania lo elesse voivoda su richiesta del padre morente nel 1581. Inizialmente, i consigli di reggenza amministrarono la Transilvania per suo conto, ma suo zio Stefano fece di János Ghyczy l'unico reggente nel 1585. Sigismondo adottò il titolo di principe dopo la morte dello zio.
La Dieta proclamò che Sigismondo maggiorenne nel 1588 ma solo dopo avergli imposto l'espulsione dei gesuiti dal paese. Papa Sisto V lo scomunicò ma revocò la misura nel 1590 e i gesuiti tornarono un anno dopo. Lo sfacciato favoritismo nei confronti dei cattolici di Sigismondo lo rese impopolare tra i suoi sudditi protestanti. Decise di aderire alla Lega Santa (1594) contro l'Impero ottomano. Non potendo convincere la Dieta a sostenere il suo piano, rinunciò al trono nel luglio 1594 ma i comandanti dell'esercito lo convinsero a revocare la sua abdicazione. Su loro proposta, epurò i nobili che si opponevano alla guerra contro gli ottomani. Entrò ufficialmente nella Lega Santa e sposò Maria Cristina d'Asburgo, una nipote di Rodolfo II del Sacro Romano Impero. Il matrimonio non fu mai consumato.
Michele il Coraggioso, Voivoda di Valacchia, e Ștefan Răzvan, Voivoda di Moldavia, riconobbero la suzerain di Sigismondo e lo appoggiarono nella lotta contro il Turco. Le loro forze unite sconfissero un esercito ottomano nella battaglia di Giurgiu. Il trionfo fu seguito da una serie di vittorie ottomane e Sigismondo abdicò a favore di Rodolfo II all'inizio del 1598, ricevendo i ducati di Racibórz e Opole come risarcimento. Suo zio materno, Stefano Bocskai, lo convinse a tornare in patria alla fine dell'estate ma non riuscì a fare pace con l'Impero ottomano. Rinunciò alla Transilvania in favore del cugino Andrea Báthory e si stabilì in Polonia nel 1599. Negli anni successivi, la Transilvania fu regolarmente saccheggiata da mercenari non pagati e predoni ottomani. Sigismondo tornò in patria a capo di un esercito polacco nel 1601 ma non poté rafforzare la sua posizione. Abdicò nuovamente a favore di Rodolfo e si stabilì in Boemia nel luglio 1602. Dopo essere stato accusato di cospirazione contro l'imperatore, trascorse quattordici mesi in prigione a Praga nel 1610 e 1611. Morì nella sua tenuta boema.
Biografia Origini Figlio di Cristoforo Bathory, voivoda di Transilvania, e nipote del re di Polonia Stefano I Báthory, Sigismondo apparteneva al ramo Somlyó della famiglia Báthory. Sua madre, Elizabeth Bocskai,. apparteneva ad un'antica famiglia aristocratica transilvana. Nacque a Várad (attuale Oradea in Romania) in 1573, secondo lo storico transilvano, István Szamosközy,. nel momento in cui la Transilvania era ancora retta dallo zio Stefano. che solo successivamente alla sua incoronazione polacca cedette il titolo di voivoda al fratello tenendo per sé quello di "Principe di Transilvania". ed organizzando una cancelleria autonoma a Cracovia tramite la quale sorvegliare l'operato di Cristoforo..
Il padre e lo zio di Sigismondo erano cattolici romani, ma sua madre era calvinista. Secondo il gesuita Antonio Possevino, Sigismondo dimostrò la sua devozione al cattolicesimo già all'età di sette anni. Sua madre lo prendeva in giro per la sua devozione, dicendo che voleva solo cattivarsi il benvolere dello zio. Sigismondo fu particolarmente ostile nei confronti degli antitrinitari durante la giovinezza. Sua madre morì all'inizio del 1581.
Principe di Transilvania
Cristoforo Báthory s'ammalò gravemente dopo la morte della moglie. Su sua richiesta, la Dieta della Transilvania elesse il voivoda il giovane Sigismondo a Kolozsvár (attuale Cluj-Napoca in Romania) intorno al 15 maggio 1581.. Poiché Sigismondo era ancora minorenne, suo padre morente creò una Reggenza composta da un consiglio di dodici nobili con il governo. Il cugino di Cristoforo, Dénes Csáky, e suo cognato, Stephen Bocskai, erano a capo del consiglio. Cristoforo morì poco dopo, il 27 maggio.
Il 3 luglio, sultano ottomano Murad III confermò l'incoronazione di Sigismondo rammentandogli il suo obbligo di tributo fissato a 15.000 fiorini annui. Pál Márkházy, un giovane nobile che viveva a Istanbul, si offrì allora di raddoppiare il tributo e di pagare una tassa aggiuntiva di 100.000 fiorini se fosse stato nominato sovrano della Transilvania in luogo del giovane Bathory e il Gran Visir Koca Sinan Pasha sostenne tale rivendicazione. Approfittando della situazione, Murad chiese gli stessi pagamenti a Sigismondo ma, dalla Polonia, s'intromise Stefano Báthory, supportato dal Unio Trium Nationum. Dopo aver ricevuto il consueto tributo dalla Transilvania, il sultano confermò nuovamente il governo di Sigismondo nel novembre 1581..
Stefano Báthory, responsabile dell'educazione di Sigismondo, confermò la posizione dei suoi tutori gesuiti, János Leleszi e Gergely Vásárhelyi. Secondo Szamosközy, il Re di Polonia ordinò anche ai compagni di Sigismondo di parlare di terre straniere, guerre e caccia con lui durante le loro cene insieme. Riorganizzò il governo il 3 maggio 1583, incaricando Sándor Kendi, Farkas Kovacsóczy e László Sombori dell'amministrazione della Transilvania durante la minor età di Sigismondo. La Dieta suggerì a Stefano di licenziarli ma sciolse il consiglio solo il 1º maggio 1585 e sostituì i tre consiglieri con il devoto calvinista János Ghyczy, facendone il reggente di Sigismondo....
Sigismondo adottò il titolo di Principe di Transilvania solo dopo la morte dello zio Stefano il 13 dicembre 1586. ma essendo ancora minorenne il potere rimase nelle mani di Ghyczy.. Per contro, la scomparsa di Stefano fece di Sigismondo uno dei candidati alla sua successione quale sovrano della Confederazione polacco-lituana.. I suoi consiglieri sapevano che aveva poche possibilità di vincere ma volevano dimostrare che i Báthory avevano una valida pretesa di governare la Confederazione.. Kovacsóczy annunciò ufficialmente la domanda di Sigismondo al Sejm il 14 agosto 1587.. Cinque giorni dopo, l'assemblea elesse re Sigismondo III Vasa.. Durante la conseguente guerra di successione, le truppe transilvane sostennero il Vasa contro Massimiliano II d'Asburgo che aveva rivendicato la Polonia e la Lituania a suo tempo soffiategli da Stefano Báthory..
Altra conseguenza della dipartita di Stefano Báthory fu che i cugini di Sigismondo, Baldassarre e Stefano, tornarono dalla Polonia in Transilvania. Baldassarre voleva farsi carico del governo e fece della sua corte a Fogaras (attuale Făgăraș in Romania) il centro di coloro che si opponevano al governo di Ghyczy. Kovacsóczy, il cancelliere della Transilvania, rimase neutrale nel conflitto. Nell'ottobre 1588, la Dieta propose di dichiarare il sedicenne Sigismondo maggiorenne se avesse bandito i gesuiti dalla Transilvania. Lui rifiutò l'offerta, soprattutto perché non voleva espellere il suo confessore, Alfonso Carillo. La Dieta fu sciolta ma i cugini di Sigismondo lo convinsero a non resistere alla Dieta, dominata dai delegati protestanti, e fu così nuovamente convocata alla fine dell'anno. L'8 dicembre, Sigismondo ordinò l'espulsione dei gesuiti dalla Transilvania e la Dieta lo dichiarò maggiorenne...
Sigismondo prestò il consueto giuramento dei monarchi transilvani il 23 dicembre 1588 e poco dopo Papa Sisto V lo scomunicò per l'espulsione dei Gesuiti. Il cugino di Sigismondo, il cardinale Andrea Báthory, esortò il papa a revocare la scomunica, incolpando i consiglieri protestanti del principe della cacciata dei gesuiti.. Il papa autorizzò allora Sigismondo ad assumere un confessore nel maggio 1589 e la scomunica fu revocata nella Pasqua del 1590.. Sigismondo fece diversi tentativi per rafforzare la posizione della Chiesa cattolica romana, in particolare nominando i cattolici alle più alte cariche dell'amministrazione statale.. Carillo e altri sacerdoti gesuiti tornarono alla corte di Sigismondo sotto mentite spoglie all'inizio del 1591. Sigismondo incontrò i cugini Andrea e Baldassarre in agosto per chiedere il loro sostegno per la legalizzazione della presenza dei gesuiti ma questi si rifiutarono di stare al fianco dei sacerdoti alla Dieta..
Sigismondo inviò il suo favorito, István Jósika, in Toscana per avviare i negoziati sul suo matrimonio con Eleonora Orsini, nipote del granduca Ferdinando I de' Medici, sebbene i suoi cugini si fossero opposti nettamente alla nomina di Jósika. Parimenti, invitò alla sua corte artisti e artigiani italiani, facendone i suoi consiglieri o maggiordomi. Szamosközy li ha descritti come "i rappresentanti più trash della nazione più nobile".. I delegati delle Unio Trium Nationum criticarono dunque Sigismondo per il suo modo di vivere prodigo alla Dieta di Gyulafehérvár, in novembre, e la Dieta gli prescrisse di prendere decisioni solo nel consiglio reale. Sigismondo privò nel contempo i cugini delle indennità che il tesoro reale aveva loro pagato..I pettegolezzi sulle cospirazioni si diffusero nei mesi successivi. Sándor Kendi accusò l'ex tutore di Sigismondo, János Gálffy, di aver deliberatamente suscitato dibattiti tra il principe e i suoi cugini. Altri cortigiani affermarono che Baldassarre Báthory stava progettando di detronizzare il cugino. Un prete gesuita fu invece informato a Vienna che Gálffy e i suoi alleati volevano uccidere sia Sigismondo sia i suoi cugini! Alla fine del 1591, Sigismondo dichiarò di essere disposto ad abdicare in favore di Baldassarre se i membri del consiglio reale avessero favorito suo cugino. L'offerta fu rifiutata ma durante il dibattito Kendi si riferì a Sigismondo e Baldassarre come i "due mostri e i più grandi disastri del regno della Transilvania".. Il legato di Papa Clemente VIII, Attilio Amalteo, mediò una riconciliazione tra Sigismondo e i suoi cugini nell'estate del 1592 ed il papa esortò anche Sigismondo a sposare una principessa cattolica del Casato di Lorena...Su richiesta del sultano Murad III, le truppe della Transilvania aiutarono Aron Tiranul, Voivoda di Moldavia. Il sultano ordinò anche a Sigismondo di pagare il doppio dell'importo del tributo annuale. Baldassarre Báthory nel frattempo uccise il segretario di Sigismondo, Pál Gyulai, il 10 dicembre 1592 e persuase il cugino ad ordinare l'esecuzione di Gálffy l'8 marzo 1593. Quell'estate, Sigismondo si recò a Cracovia sotto mentite spoglie per avviare negoziati sul suo matrimonio con Anna, la sorella di Sigismondo III di Polonia. La Santa Sede aveva proposto il matrimonio, che avrebbe potuto consentire a Sigismondo di governare la Polonia durante l'assenza del re, che era anche re di Svezia, ma il piano non andò a buon fine...
La "Lunga Guerra"
Nell'agosto del 1593, il sultano Murad III misconobbe la tregua con gli Asburgo e dichiarò guerra al Sacro Romano Imperatore Rodolfo II. Il Turco ordinò a questo punto a Sigismondo di inviare rinforzi per sostenere l'esercito ottomano nell'Ungheria Reale.