È il fratello minore di Ramón Morales, anch'egli calciatore nel suo stesso ruolo.
Carriera Club Carlos Adrián Morales debutta nella Primera División messicana nel 1998, nei Monarcas Morelia, successivamente è passato al Pachuca, al Tigres UANL, al Toluca, al Tecos de la UAG, al Santos Laguna e nuovamente ai Monarcas Morelia.
Nazionale Tra il 1999 e il 2005 ha giocato nella nazionale messicana.
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