Il campionato italiano di calcio di Eccellenza regionale 1998-1999 è stato l'ottavo organizzato in Italia. Rappresenta il sesto livello del calcio italiano.
Questo è il campionato regionale della regione Emilia-Romagna.
Girone A Squadre partecipanti SquadraCittà (provincia) G.S. BagnoleseBagnolo in Piano (RE) Pol. CastellaranoCastellarano (RE) Centese CalcioCento (FE) A.C. ColornoColorno (PR) U.S. CorreggeseCorreggio (RE) U.S. CorticellaBologna (BO) A.C. CrevalcoreCrevalcore (BO) G.S. Felino Real Sala Felino (PR) A.C. FioranoFiorano Modenese (MO) A.C. FormigineFormigine (MO) Maranello SportivaMaranello (MO) A.P.C. ScandianoScandiano (RE) A.S. Termolan BibbianoBibbiano (RE) A.C. TraversetoloTraversetolo (PR) U.C. ViadanaViadana (MN) U.S. VignoleseVignola (MO)
Classifica finale Squadra 1. Bagnolese593017855326+27 2. Fiorano533015873723+14 3. Corticella493014794332+11 4. Centese493014793929+10 5. Castellarano4430101464434+10 6. Termolan Bibbiano4430135123736+1 7. Colorno4330111094033+7 8. Correggese4230101283933+6 9. Viadana4230119104338+5 10. Crevalcore403010101035350 11. Maranello Sportiva3930109113641-5 12. Traversetolo3730107133542-7 13. Formigine343097142836-8 14. Scandiano3130613113246-14 15. Vignolese2230410162651-25 16. Felino Real Sala203048183769-32
Girone B Squadre partecipanti SquadraCittà (provincia) S.P. Argentana CapcaArgenta (FE) A.S.A.R. RiccioneRiccione (RN) A.C. Bellaria Igea MarinaBellaria (RN) A.C. Boca GranaroloBologna (BO) F.C. CasumaroCasumaro (FE) A.C. CerviaCervia (RA) Cocif LongianoLongiano (FC) A.C. MassalombardaMassa Lombarda (RA) S.C. MedicinaMedicina (BO) A.C. MezzolaraBudrio (BO) Pol. OzzaneseOzzano Emilia (BO) Pianorese CalcioPianoro (BO) A.S. Real MisanoMisano Adriatico (RN) S.S. SavignaneseSavignano sul Rubicone (FC) A.C. Sporting ForlìForlì (FC) A.C. Romplast VoltanaVoltana (RA)
Classifica finale Squadra 1. Bellaria Igea Marina603017944922+27 2. Bo.Ca. Granarolo5430141243724+13 3. Massalombarda483013983626+10 4. Casumaro4730145113127+4 5. Cocif Longiano4230101283836+2 6. Cervia4130101193428+6 7. Mezzolara4130101192724+3 8. Ozzanese3930109113740-3 9. Romplast Voltana3730910114339+4 10. A.S.A.R. Riccione363099123033-3 11. Argentana Capca363099122731-4 12. Pianorese3530811113046-16 13. 3430810123134-3 14. Savignanese333089133445-11 15. Medicina2330712113145-14 16. Sporting Forlì273076172439-15
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