Il campionato italiano di calcio di Eccellenza regionale 1999-2000 è stato il nono organizzato in Italia. Rappresenta il sesto livello del calcio italiano.
Questo è il campionato organizzato dal Comitato Regionale Puglia.
Squadre partecipanti Squadra Città A.C. Ars et Labor GrottaglieGrottaglie (TA) A.C. Atletico ConversanoConversano (BA) U.S. Audax San CassianoSan Cassiano (LE) A.S. Bisceglie 1913Bisceglie (BT) Brindisi CalcioBrindisi (BR) A.S. CastellanetaCastellaneta (TA) A.S. GinosaGinosa (TA) U.S. LatianoLatiano (BR) U.S. LuceraLucera (FG) U.G. Manduria SportManduria (TA) A.C. MassafraMassafra (TA) A.S. Noicattaro CalcioNoicattaro (BA) Ostuni SportOstuni (BR) A.S. RuvoRuvo di Puglia (BA) U.S. SquinzanoSquinzano (LE) U.S.C. Virtus MartanoMartano (LE)
Classifica finale Squadra 1. 663019925418+36 2. 633018933712+25 3. Castellaneta623018844819+29 4. 483013985042+8 5. Ginosa4830146103328+5 6. 4730111453817+21 7. 403091384546-1 8. 3730910113837+1 9. 3230711122637-11 10. Latiano3230711122242-20 11. Ruvo31307101345450 12. 2930514112731-4 13. 2930611132240-18 14. 293085172547-22 15. Virtus Martano2830513122539-14 16. Audax San Cassiano193047193469-35
Legenda: Promosso in Serie D 2000-2001. Ammesso ai Play-Off nazionali. Retrocesso in Promozione Puglia 2000-2001. Promozione diretta. Retrocessione diretta.
Note: Tre punti a vittoria, uno a pareggio, zero a sconfitta.
Il Manduria non disputa lo spareggio salvezza perché dispone di una differenza reti maggiore di Bisceglie e Squinzano. Squinzano retrocesso dopo aver perso lo spareggio salvezza contro il Bisceglie.
Spareggio salvezza Risultato Luogo e data Bisceglie 1-0 Squinzano ?, ? 2000
Bibliografia L'Annuario F.I.G.C. 1999-00, Roma (2000) conservato presso: tutti i Comitati Regionali F.I.G.C.-L.N.D.; la Lega Nazionale Professionisti a Milano; la Biblioteca Nazionale Centrale di Firenze; la Biblioteca Nazionale Centrale di Roma. ANNOGOL 2001 di Carlo Fontanelli - GEO Edizioni
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