Ordinato prete nel 1938, divenne in seguito docente di Storia della Chiesa. Inizialmente ha svolto il ruolo di cappellano e poi, per molti anni, di parroco di una parrocchia nella diocesi di Ratisbona. Ha lavorato come insegnante di religione a tempo pieno nella scuola. In seguito ha insegnato fino al suo ritiro all'Albertus Magnus-Gymnasium di Ratisbona.
Giornalista e studioso, il suo lavoro più noto è uno studio accurato sulla mistica Teresa Neumann pubblicato nel 1967, dopo aver seguito per trent'anni la mistica, aver conosciuto a fondo i familiari, e aver osservato bene tutto il mondo e i personaggi che la circondavano. Ha scritto numerosi libri, che sono fondamentali per la comprensione del fenomeno dei cosiddetti miracoli, sul fenomeno delle apparizioni mariane e delle cristofanie.
Trovandosi spesso su posizioni scettiche e criticato per questo, Hanauer si è sempre difeso dicendo che il primo dovere di un credente è ricercare la verità, e non credere a tutto quanto si racconta.
Pubblicazioni (selezione) Der Exorzist Johann Joseph Gaßner 1727–1779. Eine Monographie, Bubach a. F. 1949 Die bayerischen Kurfürsten Maximilian I. und Ferdinand Maria und die katholische Restauration in der Oberpfalz, Verein für Regensburger Bistumsgeschichte, Regensburg 1993 Wahrhaftigkeit und Glaubwürdigkeit in der katholischen Kirche. Der Fall Konnersreuth, Fischer, Aachen 1999, ISBN 3-89514-224-7
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