Carriera
Javier López Vallejo è cresciuto nell'Osasuna, la squadra più importante della sua città natale, Pamplona. Nel 1993 è stato promosso in prima squadra ed ha giocato una partita nella stagione 1993-1994 che si è conclusa con la retrocessione dell'Osasuna. È rimasto anche in Segunda División e nel 1995 è diventato titolare.
Nel 1999 è passato al Villarreal, con cui ha ottenuto subito la promozione in massima serie. Con El submarino amarillo ha vinto due Coppe Intertoto consecutive, nel 2003 e nel 2004 e dopo aver collezionato più di 100 presenze ha lasciato il club nel 2006.
Nella stagione 2006-2007 ha giocato nel Recreativo Huelva come titolare, collezionando 30 presenze.
Nella stagione successiva è passato al . Ha giocato due partite nel primo campionato, che è finito con la retrocessione degli aragonesi. Nella stagione successiva ha giocato come titolare in Segunda División e ha ottenuto la promozione in massima serie per la stagione 2010-2011, durante la quale ha giocato solo 7 partite, essendo il sostituto di Juan Pablo Carrizo. A gennaio si è svincolato e si è trasferito in Grecia.
Ha giocato nel Levadiakos fino al termine della stagione 2009-2010, debuttando il 31 gennaio contro l'Asteras Tripolis. In totale ha giocato 10 partite ed ha subito 11 gol, non riuscendo ad evitare la retrocessione in seconda serie.
Nell'estate del 2010 è passato al Kavala, squadra che milita nella Souper Ligka Ellada, come sostituto di Fanīs Katergiannakīs. Ha esordito il 18 settembre, alla terza giornata di campionato, contro il . In totale in tutto il campionato ha giocato solo tre partite.
Palmarès Club Competizioni nazionali
Villarreal: 2003, 2004
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