La Supercoppa italiana 1999 fu la 5ª supercoppa italiana di pallacanestro maschile. Fu vinta da contro .
Il trofeo è stato assegnato in una gara unica, disputata al PalaIgnis di Varese il 4 settembre 1999. Le squadre finaliste sono state quella dei campioni d'Italia in carica della Pallacanestro Varese, e della Virtus Bologna detentrice della Coppa Italia.
Per la prima volta nella propria storia Varese si aggiudica il trofeo, con il risultato finale di 68-61. Il titolo di MVP dell'incontro è stato assegnato ad Andrea Meneghin.
Tabellino
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