Carriera Club Isidoro ha cominciato la propria carriera con la maglia del Betis. Ha esordito in Primera División il 17 febbraio 2007, subentrando a Branko Ilič nel pareggio per 0-0 arrivato in casa del Real Madrid. Nelle tre stagioni successive ha giocato per il Betis B, squadra riserve del club militante in Segunda División B, limitandosi a soltanto qualche apparizione in panchina in prima squadra.
Ha ottenuto maggiore spazio nel campionato 2010-2011, con il Betis nel frattempo retrocesso in Segunda División. L'11 maggio 2011 ha trovato il primo gol, nel 3-1 inflitto al Tenerife. Alla fine di quella stessa annata, il Betis ha conquistato la promozione.
Isidoro è rimasto in squadra per un'ulteriore stagione.
In vista della stagione 2012-2013, Isidoro si è trasferito al Polonia Varsavia, in Ekstraklasa. Ha debuttato con questa casacca il 31 agosto, subentrando ad Aleksandar Todorovski nella vittoria per 1-3 arrivata in casa del Wisla Cracovia. È rimasto in squadra fino al mese di novembre, quando ha rescisso il contratto che lo legava al club.
Isidoro ha fatto dunque ritorno in Spagna, per giocare nelle file del Numancia, in Segunda División. Ha giocato la prima partita con questa casacca il 13 aprile 2013, schierato titolare nella sconfitta casalinga per 0-1 contro il Barcellona B. È rimasto in squadra per due stagioni e mezzo, totalizzando 62 presenze tra campionato e coppa, senza mettere a referto alcuna rete.
Il 10 agosto 2015, l'Elche ha presentato Isidoro come suo nuovo calciatore. Ha giocato la prima partita in squadra il 23 agosto, impiegato da titolare nella sconfitta per 2-0 contro il Ponferradina. Rimasto in squadra per quest'unica annata, ha disputato 25 partite, senza mettere a segno alcuna rete.
Il 30 agosto 2016, Isidoro è stato ingaggiato dall'Almería. Ha esordito in squadra il 18 dicembre, nella sconfitta per 2-1 arrivata contro il Mirandés. Si è svincolato a fine stagione, congedandosi con 10 presenze tra campionato e coppa nazionale.
Libero da vincoli contrattuali, in data 16 gennaio 2018 è stato ingaggiato dal Bodø/Glimt, formazione norvegese militante in Eliteserien, a cui si è legato con un accordo annuale. Il 24 agosto successivo ha prolungato il contratto con il Bodø/Glimt, fino al 31 dicembre 2019.
Il 6 dicembre 2019 è stato reso noto il suo passaggio allo Junkeren, a partire dalla stagione 2020.
Statistiche Presenze e reti nei club Statistiche aggiornate al 1º gennaio 2020. StagioneClubCampionatoCoppe nazionaliCoppe continentaliSupercoppeTotaleCompPresRetiCompPresRetiCompPresRetiCompPresRetiPresReti 2004-2005 Betis PD 0 0 CR 0 0 - - - - - - 0 0 2005-2006 PD 0 0 CR 0 0 - - - - - - 0 0 2006-2007 PD 8 0 CR 1 0 - - - - - - 9 0 2007-2008 PD 0 0 CR 0 0 - - - - - - 0 0 2008-2009 PD 0 0 CR 0 0 - - - - - - 0 0 2009-2010 SD 0 0 CR 0 0 - - - - - - 0 0 2010-2011 SD 31 1 CR 7 0 - - - - - - 38 1 2011-2012 PD 11 0 CR 0 0 - - - - - - 11 0 Totale Betis 50 1 8 0 - - - - 58 1 2007-2008 Betis B SDB 27 2 - - - - - - - - - 27 2 2008-2009 SDB 33 1 - - - - - - - - - 33 1 2009-2010 SDB 31 0 - - - - - - - - - 31 0 Totale Betis B 91 3 - - - - - - 91 3 ago.-nov. 2012 Polonia Varsavia EK 4 0 CP 1 0 - - - - - - 5 0 gen.-giu. 2013 Numancia SD 8 0 CR - - - - - - - - 8 0 2013-2014 SD 17 0 CR 0 0 - - - - - - 17 0 2014-2015 SD 35 0 CR 2 0 - - - - - - 37 0 Totale Numancia 60 0 2 0 - - - - 62 0 2015-2016 Elche SD 24 0 CR 1 0 - - - - - - 25 0 2016-2017 Almería SD 9 0 CR 1 0 - - - - - - 10 0 2018 Bodø/Glimt ES 21 0 CN 3 0 - - - - - - 24 0 2019 ES 3 0 CN 2 1 - - - - - - 5 1 Totale Bodø/Glimt 24 0 5 1 - - - - 29 1 2020 Junkeren 3D 0 0 CN 0 0 - - - - - - 0 0 Totale 262 4 18 1 - - - - 280 5
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