Professionista dal 1988 al 1994, nel 1989 fu secondo alla Liegi-Bastogne-Liegi e miglior giovane al Tour de France. Fra il 1991 e il 1993 accompagnò come gregario Miguel Indurain nei suoi successi al Tour de France e al Giro d'Italia.
Carriera Messosi in luce da giovane come corridore adatto alle corse a tappe – vinse fra le altre il Giro della Valle d'Aosta – non riuscì a confermare le aspettative nel mondo dei professionisti. Passò professionista nel 1988 con la Toshiba-Look di Bernard Tapie: quell'anno vinse una breve corsa a tappe in Francia, fu decimo ai campionati nazionali e secondo al Trophée des Grimpeurs, storica classica del panorama francese. Prese parte anche al Giro d'Italia senza però particolari acuti.
Nel 1989 riuscì a conquistare il secondo posto alla Liegi-Bastogne-Liegi, venendo battuto solo dall'irlandese Sean Kelly; fu inoltre quarto nel Giro del Delfinato, ottavo al Giro del Mediterraneo, undicesimo nella Freccia Vallone, oltre a vincere una tappa al Grand Prix du Midi Libre. Nello stesso anno concluse ventiquattresimo al Tour de France, aggiudicandosi la classifica giovani. Questo successo fu comunque agevolato anche dal fatto che il colombiano Alberto Camargo, classificatosi ventesimo nella generale, non venne registrato come Under-25 dal suo direttore sportivo pur essendo coetaneo del francese.
Nel 1990 Philipot prese parte sia al Giro d'Italia che al Tour de France, concludendo entrambe le corse nei primi quindici della classifica generale. Nel 1991, dopo il trasferimento alla Banesto, vinse una tappa al Tour du Vaucluse, che chiuse al secondo posto generale, e fu decimo ai campionati nazionali; l'anno successivo non ottenne vittorie, ma fu terzo al Trofeo Calvia e nella classifica generale della Vuelta a Mallorca. Lasciò il professionismo al termine della stagione 1994.
Palmarès
1986 (dilettanti) Tour du Béarn
1987 (dilettanti) Classifica generale Giro della Valle d'Aosta Classifica generale Stuttgart-Strasbourg
1988 1ª tappa Tour du Lyonnais et des monts du Pilat Classifica generale Tour du Lyonnais et des monts du Pilat
1989 6ª tappa Grand Prix du Midi Libre
1991 3ª tappa Tour du Vaucluse
Altri successi 1988 Classifica giovani Tour de France Prologo Parigi-Nizza (cronosquadre)
1990 Criterium di Dole Criterium di Metabief Criterium di Monein
1991 Criterium di Riom
Piazzamenti Grandi Giri
Tour de France 1989: 24º 1990: 14º 1991: 24º 1992: ritirato
Giro d'Italia 1988: 37º 1990: 13º 1992: 22º 1993: ritirato
Vuelta a España 1991: ritirato 1992: ritirato
Classiche monumento
Milano-Sanremo 1989: 33º 1990: 18º 1991: 23º 1992: 50º
Liegi-Bastogne-Liegi: 1989: 2º 1990: 33º
Collegamenti esterni