Il Kampioenschap van Vlaanderen 2006, novantunesima edizione della corsa, valido come evento dell'UCI Europe Tour 2006 categoria 1.1, si svolse il 15 settembre 2006 su un percorso di 182,5 km. Fu vinto dal belga Niko Eeckhout, che terminò la gara in 4h01'00" alla media di 45,43 km/h.
Furono 88 i ciclisti che portarono a termine il percorso.
Ordine d'arrivo (Top 10) CorridoreSquadraTempo1 Niko EeckhoutCh. Jacques4h01'00"2 Steven de JonghQuick Steps.t.3 Danilo HondoLamontas.t.4 Frédéric AmorisonLandbouwkrediets.t.5 Wouter WeylandtQuick Steps.t.6 Jeremy HuntUnibet.coms.t.7 James VanlandschootLandbouwkrediets.t.8 Joost van LeijenVan Vliet-EBHs.t.9 Kenny van HummelSkil-Shimanos.t.10 Maxime VantommeQuick Steps.t.
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Categoria:Kampioenschap van Vlaanderen Categoria:Ciclismo nel 2006