Biografia Fischer era figlio del botanico Ludwig Fischer, un professore e direttore dell'Orto botanico di Berna., studiò all'Università di Berna e si laureò nel 1883 a Strasburgo con il micologo Anton de Bary, con il quale studiò i gasteromiceti. Durante ulteriori studi a Berlino tra il 1884 e il 1885, egli lavorò insieme a Simon Schwendener (1829–1919), August Wilhelm Eichler (1839–1887) e Paul Friedrich August Ascherson (1834–1913). Nel 1885 fu nominato come docente presso l'Università di Berna, nel 1893, fu promosso a professore associato. Dal 1897 al 1933 fu professore di botanica e biologia generale presso l'Università, e succedette al padre come direttore dell'Orto Botanico e dell'Istituto di botanica di Berna.
Nel 1899, Fischer sposò Johanna Gruner. Egli fu padre del pianista Kurt von Fischer.
Fischer pubblicò importanti monografie relative ad ascomiceti e basidiomiceti, incluse le ruggini e incoraggiò il fitopatologo Arthur Jaczewski allo studio della micologia, nonché i suoi studenti universitari, incluso il medico lituano-americano Lydia Rabinowitsch-Kempner, e il micologo Ernst Albert Gäumann.
Fischer diventò membro della Linnean Society of London nel 1932.
Il 5 maggio 1937 divenne socio dell'Accademia delle scienze di Torino.
Onorificenze 1931: Dottorato onorario dell'Università di Ginevra 1939: Dottorato onorario della facoltà di medicina dell'Università di Basilea
Taxa descritti da E. Fischer
Si riportano di seguito i taxa di funghi descritti da E. Fischer, divisi per specie, generi, famiglie e ordini
Specie Aseroe arachnoidea E.Fisch. (1890) Onygena arietina E.Fisch. (1897) Pisolithus kisslingii E.Fisch. (1906) Pisolithus marmoratus (Berk.) E.Fisch. (1900) Puccinia actaeae-agropyri E.Fisch. (1901) Puccinia mayorii E.Fisch. 1904 Staheliomyces cinctus E.Fisch. (1921) Tuber malacodermum E.Fisch. (1923)
Generi Mattirolomyces E.Fisch. (1938) Petchiomyces E.Fisch. & Mattir. (1938) Pseudohydnotrya E.Fisch. (1897) Tremellogaster E.Fisch. (1924)
Famiglie Calostomataceae E.Fisch. (1900) Melanogastraceae E.Fisch. (1933) Terfeziaceae E.Fisch. 1897 Trichocomaceae E.Fisch. (1897)
Ordini Peronosporales E.Fisch. (1892) Phallales E.Fisch. (1898) Saprolegniales E.Fisch. (1892)
Taxa dedicati a E. Fischer Il genere di funghi Fischerula
Opere Berlese, A.N.; De-Toni, J.B.; Fischer, E. (1888). Sylloge Fungorum 7 (1): 1–498. Berlese, A.N.; De-Toni, J.B.; Fischer, E. (1888). Sylloge Fungorum 7 (2): 499. Fischer, E. (1886). "Zur Entwickelungsgeschichte der Fruchtkörper einiger Phalloideen. Annales du Jardin Botanique de Buitenzorg 6: 1–51. Fischer, E. (1888). "Zur Kenntniss der Pilzgattung Cyttaria". Botanische Zeitung 46: 813–831. Fischer, E. (1888). "Zur Kenntniss der Pilzgattung Cyttaria". Botanische Zeitung 48: 842–846. Fischer, E. (1897). "Beiträge zur Kenntnis der Schweizerischen Rostpilze". Bulletin de l'Herbier Boissier 5: 393–394. Fischer, E. (1909). "Studien zur Biologie von Gymnosporangium juniperinum". Zeitschrift für Botanik 1: 683–714. Fischer, E. (1920, publ. 1921). "Zur Kenntnis von Graphiola und Farysia". Annales Mycologici 18: 188–197. Eduard Fischer (1922) "Weitere Beiträge zur Kenntnis der Gattung Graphiola" (More contributions towards understanding of the genus Graphiola) in Annales Mycologici (Annals of Mycology) 20:3 pp. 228 – 237 Fischer, E.; Albert Gäumann E.A. (1929) Biologie der pflanzenbewohnenden parasitischen pilzeilze. (ed.Jena, G. Fischer) Fischer, E. (1933) Die natürlichen Pflanzenfamilien: Unterklasse Eubasidii. Reihe Gastromyceteae (ed. Engler and Prantl)
Note
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