L'Aptos Challenger 2006, noto come Comerica Bank Challenger per motivi di sponsorizzazione, è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito delle ATP Challenger Series 2006. Il torneo si è giocato ad Aptos negli Stati Uniti dal 17 al 23 luglio 2006 su campi in cemento.
Vincitori Singolare
Alex Kuznetsov ha battuto in finale Gō Soeda con il punteggio di 6–1, 7–6(4)
Doppio
Prakash Amritraj / Rohan Bopanna hanno battuto in finale Rajeev Ram / Todd Widom con il punteggio di 3–6, 6–2, [10–6]
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