Il Prague Open 1999 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 1999. Il torneo si è giocato a Praga in Repubblica Ceca dal 21 al 27 giugno 1999 su campi in terra rossa.
Vincitori Singolare
Michal Tabara ha battuto in finale Jean-René Lisnard con il punteggio di 6–4, 6–1
Doppio
Michal Tabara / Radomír Vašek hanno battuto in finale Tomáš Cibulec / Petr Pála con il punteggio di 6–2, 6–0
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