Carriera Paulo Lopes è cresciuto calcisticamente nel Mirandela, club della sua città, per poi passare al più prestigioso con cui firma un contratto da professionista a partire dalla stagione 1997-1998.
Viene ceduto in prestito per due stagioni, a e , per poi venire relegato alla formazione B. Nonostante abbia disputato una buona annata viene ceduto, questa volta a titolo definitivo.
Dopo aver difeso le porte di , , e , fa ritorno al Benfica in qualità di terzo portiere. Si ritira dal calcio giocato il 2 agosto 2018, dopo dodici trofei vinti in sole 11 presenze con la maglia del Benfica.UFFICIALE: Benfica, si ritira Paulo Lopes. Ha più trofei che presenze tuttomercatoweb.com
Palmarès
Benfica: 2013-2014, 2014-2015, 2015-2016, 2016-2017
Benfica: 2013-2014
Benfica: 2013-2014, 2014-2015, 2015-2016
Benfica: 2014, 2016
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