La cronometro maschile Junior dei Campionati europei di ciclismo su strada 2009 si è svolta il 1º luglio 2009 in Belgio, nei dintorni di Hooglede, su un percorso di 28,1 km. La medaglia d'oro è stata vinta dal britannico Joseph Perrett con il tempo di 34'58" alla media di 48,21 km/h, argento al lussemburghese Bob Jungels e a completare il podio il francese Kevin Labèque.
Al traguardo 65 ciclisti completarono la gara.
Classifica (Top 10) CorridoreSquadraTempo1 Joseph PerrettRegno Unito34'58"2 Bob JungelsLussemburgoa 16"3 Kevin LabèqueFranciaa 18"4 Jasha SütterlinGermanias.t.5 Kevin De JongheBelgioa 31"6 Gui. Van KeirsbulckBelgioa 33"7 Dylan van BaarlePaesi Bassia 34"8 Alexander RandinNorvegiaa 44"9 Andreas HoferAustriaa 48"10 George AtkinsRegno Unitoa 53"
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Categoria:Campionati europei di ciclismo su strada 2009