Ендемиксит е проект кој ги проучувал ефектите од намалената големина на популацијата кај пет италијански ендемски видови кои биле изложени на ризик од исчезнување. Конечната цел била да се проценел ризикот од исчезнување од геномските податоци и да се придонел за зачувување на овие видови. Проектот бил финансиран од MUR (италијанското Министерство за истражување) и координиран од Одделот за животни науки и биотехнологија на Универзитетот во Ферара со вклучување на уште пет италијански универзитети: Анкона, Фиренца, Падова, Рим Тор Вергата и Трст.
Вид што се проучувал Разгледаните видови биле класифицирани во опасност или во критична опасност од исчезнување во Црвената листа на МСЗП:
Podarcis raffonei (еолски ѕиден гуштер), гуштер со опсег на струја ограничен на три Липарски острови и поделен на изолирани и релативно далечни популации. Hipparchia sbordonii (Ponza grayling), моментално се наоѓал само на некои Понтинцијански острови. Acipenser naccarii (јадранска есетра), некогаш широко распространета во Северното Јадранско Море и во многу реки во Северна Италија, но денес речиси исчезнат по природа. Bombina pachypus (апенинска жолтопододена крастава жаба), ендемски и загрозен вид на Апенински полуостров тесно поврзан со најчестата европска жолтостомакна жаба (Огнена жаба). Апенинска кафеава мечка (марсиканска или апенинска, кафеава мечка), подвид на кафеава мечка (U. arctos), присутна исклучиво во мал регион на централните Апенини.
Апликации и иновативни аспекти Ендемиксит бил геномски проект кој се применувал за зачувување на биоразновидноста. Ќе се произвеле пет референтни геноми (по еден за секој ендемски вид/подвид) и ќе се ресеквенционирале 20 до 30 единки по вид (цели геноми со средно опфат). Популациските геномски анализи ќе се користеле за реконструкција на минатите демографски процеси и за проценка на генетското оптоварување што евентуално се акумулирало поради генетското поместување. Резултатите ќе биле теоретски важни за да се разберела динамиката на генетското оптоварување. Практично, тие ќе дале насоки и приоритети за зачувување на овие ендемии.
Ендемиксит бил партнер на Европскиот референтен геном атлас (ERGA), паневропски конзорциум кој имал за цел да произведел референтни геноми со висок квалитет за целата европска биоразновидност за да придонесе за заштита на истата. Ендемиксит бил исто така поврзан со Проект за биогеном на Земјата (EBP), меѓународен проект кој имал за цел да го секвенционирал целосниот геном на сите еукариотски живи суштества за 10 години.
Наводи
Категорија:Генетика Категорија:Биоинформатика