Francisco de Miranda Henriques (Alcáçovas, Viana do Alentejo, circa 1565 – ?, 1634) foi um nobre, militar e administrador português, comandante de naus das Armadas da Índia, capitão-mor de Malaca e veterano de várias batalhas e confrontos no Oceano Índico, no contexto das Guerra Luso-Holandesa, e Guerra Luso-Achém.
Início de vida Francisco de Miranda Henriques nasceu por volta da década de 1560, na vila de Alcáçovas, na província do Alentejo. Filho de D. Jorge Henriques, 6.º Senhor das Alcáçovas e de sua mulher, D. Isabel de Miranda, era irmão mais novo de D. Henrique Henriques, futuro 7.º Senhor das Alcáçovas.
Serviço militar A sua primeira viagem de que há registo para a Índia, data de 11 de abril de 1601, indo na armada de D. António de Melo e Castro, enquanto capitão do galeão Salvador.
No ano de 1610, toma posse como governador de Malaca. Dois anos seguintes, aparece como um dos comandantes da frota de Nuno da Cunha durante a Batalha de Suvali. Em 1615, defende com sucesso a cidade de Malaca e derrota uma força expedicionária do Sultanato de Achém, com apenas quatro galeões e dezoito pequenas embarcações, provocando ao inimigo cinquenta embarcações. De seguida, ainda no mesmo ano, é um dos comandantes da Batalha do Rio Formoso, onde obtém novamente uma vitória significativa contra o Sultanato de Achém.
Por volta desta altura, instala-se em Baçaim, onde se casa com D. Francisca de Miranda, natural de Baçaim. Deste casamento, iria ter descendência, sendo um deles D. Jorge Henriques, futuro membro da Ordem de Cristo.
Em 1618, morre, juntamente com Luís de Brito de Melo, no Cerco de Mangalore.
Ver Miranda Henriques (sobrenome)
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