A Copa Intertoto da UEFA de 1999 foi a 5.ª edição da prova, ganha pelo Montpellier, Juventus e West Ham United. As três equipas qualificaram-se para a Copa da UEFA de 1999-00.
1.ª Eliminatória Os jogos realizaram-se a 19 e 20 de Junho para a primeira mão e 26 e 27 de Junho os da segunda mãouefa.com - 1ª Eliminatória.
Legenda: g.f. - equipa apurou-se pela Regra do gol fora de casa g.p. - equipa apurou-se após disputa de desempate por penalties
2.ª Eliminatória Os jogos realizaram-se a 3 e 4 de Julho para a primeira mão e 10 e 11 de Julho os da segunda mãouefa.com - 2ª Eliminatória.
Legenda: g.p. - equipa apurou-se após disputa de desempate por penalties
3.ª Eliminatória Os jogos realizaram-se a 17 e 18 de Julho para a primeira mão e 24 de Julho os da segunda mãouefa.com - 3ª Eliminatória.
Legenda: g.f. - equipa apurou-se pela Regra do gol fora de casa f.c. - jogo perdido por falta de comparência
Meias-finais Os jogos realizaram-se a 28 de Julho e 4 de Agostouefa.com - Meias-Finais.
Finais Os jogos realizaram-se a 10 e 24 de Agostouefa.com - Finais.
Legenda: g.p. - equipa apurou-se após disputa de desempate por penalties
Ligações externas Página da competição
Categoria:Copa Intertoto da UEFA