As eleições estaduais em São Paulo em 1998 ocorreram em 4 de outubro, como parte das eleições gerais em 26 estados e no Distrito Federal. Assim foram eleitos o governador Mário Covas, o vice-governador Geraldo Alckmin, o senador Eduardo Suplicy, setenta deputados federais e 94 estaduais. Como nenhum candidato a governador recebeu a maioria dos votos válidos, houve um segundo turno em 25 de outubro entre Mário Covas e Paulo Maluf com vitória de Covas. Segundo a Constituição de 1988, o mandato do governador seria de quatro anos a se iniciar em 1º de janeiro de 1999 para quatro anos de mandato já sob a égide da reeleição.
Eleito governador em 1994, Mario Covas (PSDB) pôde candidatar-se graças a aprovação de uma emenda que permitiu a reeleição para ocupantes do Executivo. No primeiro turno, o ex-governador Paulo Maluf (PPB) recebeu a maior votação: 32,2% dos votos válidos. A disputa pela outra vaga no segundo turno contou com uma acirrada disputa entre Covas e a deputada federal Marta Suplicy (PT), a qual Covas prevaleceu por 0,44% dos votos válidos, ou 74.436 votos em um universo de 16,6 milhões de votos. Em 25 de outubro, Covas foi reeleito governador com 55,3% dos votos, obtendo 1,9 milhão de votos a mais que Maluf.
O senador de primeiro mandato Eduardo Suplicy (PT) reelegeu-se com 6,7 milhões de votos, ou 43,1%. Suplicy derrotou Oscar Schmidt (PPB), jogador de basquetebol, que conseguiu 36,9%. Na eleição para a Câmara dos Deputados, o PSDB elegeu quinze deputados federais, o PT quatorze, o PPB doze, o PMDB e o PTB cinco cada. Para a Assembleia Legislativa, 21 deputados estaduais eleitos eram filiados ao PSDB, quinze ao PT, onze ao PFL, dez ao PPB, oito ao PMDB, sete ao PDT, seis ao PTB e cinco ao PL.
Candidatos a governador Governador (a)Vice-governador (a)Coligação Partido(s)Candidato(a)PartidoCargos relevantesCandidato(a)PartidoCargos relevantes11semmoldura|130x130pxPaulo MalufPaulo Salim MalufPPB Prefeito de São Paulo (1969–1971, 1993–1997) Secretário Estadual de Transportes de São Paulo (1971–1975) Governador de São Paulo (1979–1982) Deputado Federal por São Paulo (1983–1987)semmoldura|130x130pxLuiz Carlos SantosLuiz Carlos dos SantosPFL Diretor administrativo da Companhia Agrícola de Imigração e Colonização do governo de São Paulo (1964–1968) Deputado Estadual por São Paulo (1979–1991) Deputado Federal por São Paulo (1991–1993, 1994–1995, 1998–1999) Secretário Estadual de Energia Elétrica e Saneamento de São Paulo (1993–1994) Ministro Extraordinário para a Coordenação Política do Brasil (1996–1998)Viva São Paulo(PPB, PFL, PL, PSL, PST e PRN)12semmoldura|148x148pxFrancisco RossiFrancisco Rossi de AlmeidaPDT Deputado Federal por São Paulo (1979–1983) Secretário Estadual de Educação e Turismo de São Paulo (1980–1981) Prefeito de Osasco (1973–1977, 1989–1992)semmoldura|130x130pxJosé PinottiJosé Aristodemo PinottiPSB Reitor da Unicamp (1982–1986) Secretário Estadual de Educação de São Paulo (1986–1987) Secretário Estadual de Saúde de São Paulo (1987–1991) Deputado Federal por São Paulo (1995–1999)São Paulo de Verdade(PDT, PSB, PAN, PTN e PSN)13semmoldura|130x130pxMarta SuplicyMarta Teresa Smith de Vasconcellos SuplicyPT Deputada Federal por São Paulo (1995–1999).semmoldura|130x130pxNewton LimaNewton Lima NetoPT Reitor da Universidade Federal de São Carlos (1992–1996)Pra Renovar São Paulo(PT, PCdoB, PCB, PPS e PMN)15semmoldura|130x130pxOrestes QuérciaOrestes QuérciaPMDB Vereador de Campinas (1964–1967) Deputado Estadual por São Paulo (1967–1969) Prefeito de Campinas (1969–1975) Senador por São Paulo (1975–1983) Vice-governador de São Paulo (1983–1987) Governador de São Paulo (1987–1991)semmoldura|130x130pxFernando MoraisFernando Gomes de MoraisPMDBLevanta São Paulo(PMDB, PGT, PRP e PTdoB)16semmoldura|130x130pxAntonio FerreiraAntônio Donizete FerreiraPSTUsemmoldura|130x130pxMaria ValériaMaria Valéria Carneiro PSTU20semmoldura|130x130pxFalangaEdson FalangaPSCsemmoldura|130x130pxLuís Antônio CamargoLuís Antônio CamargoPSC27semmoldura|136x136pxJoão ManuelJoão Manuel BaptistaPSDCsemmoldura|130x130pxInésio CarneiroInésio Domingues CarneiroPSDC28semmoldura|130x130pxLevy FidelixJosé Levy Fidelix da CruzPRTBsemmoldura|130x130pxRoberto BrunelloLuís Roberto BrunelloPRTB45centro|136x136pxMário CovasMário Covas JúniorPSDB Secretário Municipal de Obras de Santos (1956–1963) Deputado Federal por São Paulo (1963–1969, 1983) Secretário Estadual dos Transportes de São Paulo (1983) Prefeito de São Paulo (1983–1986) Senador por São Paulo (1987–1994) Governador de São Paulo (1995–2001)semmoldura|125x125pxGeraldo AlckminGeraldo José Rodrigues Alckmin FilhoPSDB Vereador de Pindamonhangaba (1973–1977) Prefeito de Pindamonhangaba (1977–1982) Deputado Estadual por São Paulo (1983–1987) Deputado Federal por São Paulo (1987–1994)São Paulo no Rumo Certo(PSDB, PTB e PSD)56semmoldura|130x130pxConstantino CuryConstantino Cury NetoPRONAsemmoldura|130x130pxFrancisco PaccesFrancisco PaccesPRONA
Candidatos ao Senado Federal Senador (a)SuplentesColigação Partido(s)Ref.Candidato (a)PartidoCargos relevantes11semmoldura|130x130pxOscar SchmidtOscar Daniel Bezerra SchmidtPPBHeitor Pinto Filho (PPBJorge Yunes (PPB)Viva São Paulo(PPB, PFL, PL, PSL, PST e PRN)13semmoldura|97x97pxEduardo SuplicyEduardo Matarazzo SuplicyPT Deputado Estadual por São Paulo (1979–1983) Deputado Federal por São Paulo (1983–1987) Senador por São Paulo (1991–2015)Vicente Paulo da Silva (PT)Walter Sorrentino (PCdoB)Pra Renovar São Paulo(PT, PCdoB, PCB, PPS e PMN)14semmoldura|130x130pxJoão Leite NetoJoão Leite NetoPTBFlávio Henrique Cuoghi (PTB)Oswaldo Marques Cera (PTB)São Paulo no Rumo Certo(PSDB, PTB e PSD)15semmoldura|130x130pxJooji HatoJooji HatoPMDB Vereador de São Paulo (1983–2001)Francisco Dias Alves (PMDB)Maria Aparecida Ferreira (PMDB)16semmoldura|130x130pxMauro PuerroMauro Ailton PuerroPSTUAry Blinder (PSTU)Ronaldo da Silva (PSTU)27semmoldura|130x130pxOsmar SimonattoOsmar Baldin SimonattoPSDCNão disponível28semmoldura|130x130pxAguiar FilhoNicanor Aguiar FilhoPRTBAldinéa Fidelix (PRTB)Ana Magali Brunello (PRTB)30semmoldura|130x130pxNapoleão AlvesNapoleon Miguel AlvesPGTArabela da Luz Coelho (PGT)Josué Lima Lins (PGT)40semmoldura|130x130pxAlmino AffonsoAlmino Monteiro Álvares AfonsoPSB Deputado Federal pelo Amazonas (1959–1964) Ministro do Trabalho do Brasil (1963) Deputado Federal por São Paulo (1995–1999)Augusto Toscano (PDT)José Cicote (PSB)43semmoldura|130x130pxDomingos FernandesDomingos FernandesPVClaudio Turtelli (PV)Vera Lúcia da Motta (PV)56semmoldura|130x130pxPaulo CorrêaPaulo César CorrêaPRONAAdalton Nimtz (PRONA)Antonio Graco Gomes (PRONA)70semmoldura|130x130pxLeônidas de OliveiraLeônidas Rodrigues de OliveiraPTdoBAdalberto Zompero (PTdoB)Rosa Maria Santos (PTdoB)
Candidatura substituída ou indeferida Senador (a)SuplentesColigação Partido(s)Ref.Candidato (a)PartidoCargos relevantes20semmoldura|130x130pxPedro de CamilloPedro de Camillo NettoPSCNão disponível20semmoldura|130x130pxKayo FukudaKayo FukudaPSCNão disponível
Eleição para o governo estadual Governador eleito thumb|Mario Covas no período em que era prefeito de São Paulo.
Nascido em Santos, o engenheiro civil Mário Covas formou-se na Universidade de São Paulo e seu primeiro cargo público foi o de secretário municipal de Obras em sua cidade natal. Em 1961 perdeu a eleição para a prefeitura santista via PST. Elegeu-se deputado federal em 1962 e reeleito pelo MDB em 1966. Adversário da Ditadura Militar de 1964, teve o mandato cassado e os direitos políticos suspensos por dez anos graças ao Ato Institucional Número Cinco em 1969 e assim foi trabalhar na iniciativa privada.As eleições em Santos (online). Folha de S. Paulo, 26/02/1961. Assuntos Diversos, p. 04. Página visitada em 26 de outubro de 2017. Eleito presidente do diretório estadual do MDB em 1979, migrou para o PMDB no ano seguinte e foi eleito deputado federal em 1982. Nomeado secretário de Transportes e depois prefeito de São Paulo pelo governador Franco Montoro em 1983,Covas assume e promete seguir lutando por diretas (online). Folha de S. Paulo, 11/05/1983. Nacional, p. 04. Página visitada em 26 de outubro de 2017. foi eleito senador em 1986, subscreveu a Constituição de 1988 e nesse mesmo ano esteve entre os fundadores do PSDB.Novo partido nasce sem nome (online). O Estado de S. Paulo, São Paulo (SP), 25/06/1988. Geral, p. 04. Página visitada em 26 de outubro de 2017. Quarto colocado no primeiro turno da eleição presidencial de 1989, perdeu o governo paulista em 1990, mas venceu a disputa pelo Palácio dos Bandeirantes em 1994.
Vice-governador eleito thumb|170px|Geraldo Alckmin em 2003.
Natural de Pindamonhangaba, Geraldo Alckmin graduou-se em medicina na Universidade de Taubaté e um ano após obter o diploma foi eleito vereador pelo MDB em 1972 e alcançou a presidência da Câmara Municipal. Paralelo à sua carreira política foi professor universitário e chefe do Departamento de Anestesiologia da Santa Casa de Misericórdia em Pindamonhangaba. Eleito prefeito de sua cidade natal em 1976, ingressou no PMDB durante o mandato. Eleito deputado estadual em 1982 e deputado federal em 1986, assinou a Constituição de 1988. Reeleito pelo PSDB em 1990, votou a favor do impeachment de Fernando Collor em 1992 e foi eleito vice-governador de São Paulo em 1994 e reeleito em 1998. Por causa do falecimento de Covas em 6 de março de 2001, foi efetivado governador.
Resultados Primeiro turno Segundo o Tribunal Superior Eleitoral houve 16.612.001 votos nominais.
Candidatos a governador do estado Candidatos a vice-governador Número Coligação Votação PercentualPaulo MalufPPB Luiz Carlos SantosPFL 11 Viva São Paulo(PPB, PFL, PL, PSL, PST, PRN) 5.351.026 32,21%Mário CovasPSDB Geraldo AlckminPSDB45 São Paulo no Rumo Certo(PSDB, PTB, PSD) 3.813.186 22,95%Marta SuplicyPT Newton LimaPT13 Pra Renovar São Paulo(PT, PCdoB, PCB, PPS, PMN) 3.738.750 22,51%Francisco RossiPDT José Aristodemo PinottiPSB 12 São Paulo de Verdade(PDT, PSB, PAN, PTN, PSN) 2.843.515 17,18%Orestes QuérciaPMDB Fernando MoraisPMDB15 Levanta São Paulo(PMDB, PGT, PRP, PTdoB) 714.097 4,30%Constantino CuryPRONA Francisco PaccesPRONA56 — 68.906 0,41%Antônio Donizete FerreiraPSTU Maria Valéria CarneiroPSTU16 — 29.033 0,18%João Manuel BatistaPSDC Inésio Domingues CarneiroPSDC27 — 24.229 0,15%Edson FalangaPSC Luís Antônio CamargoPSC20 — 14.853 0,09%Levy FidelixPRTB Luís Roberto BrunelloPRTB28 — 14.406 0,08%
Segundo turno De acordo com o Tribunal Superior Eleitoral houve 17.700.851 votos nominais.
Candidatos a governador do estado Candidatos a vice-governador Número Coligação Votação PercentualMário CovasPSDBGeraldo AlckminPSDB45 São Paulo no Rumo Certo(PSDB, PTB, PSD) 9.800.253 55,37%Paulo MalufPPBLuiz Carlos SantosPFL11 Viva São Paulo(PPB, PFL, PL, PSL, PST, PRN) 7.900.598 44,63%
Eleição para o Senado Federal Senador eleito thumb|Eduardo Suplicy discursando no Senado durante seu segundo mandato.