O mangá Genshiken é escrito e ilustrado por Shimoku Kio, e é publicado pela editora Kodansha na revista Afternoon. O primeiro capítulo de Genshiken foi publicado em junho de 2002 e a publicação paralisou em junho de 2006 no capítulo 55, marcando o fim da primeira parte do mangá contando com 9 volumes. Posteriormente, começou a publicação da segunda parte do mangá, a partir do capítulo 56 em dezembro de 2010, já tendo ultrapassado mais de 100 capítulos lançados atualmente. Nesta página, os capítulos estão listados por volume, com seus respectivos títulos originais (títulos originais na coluna secundária, os volumes de Genshiken não são titulados). Alguns capítulos saíram apenas na Afternoon, não tendo sido lançados na forma de volumes, porém, eles também estarão listados aqui.
No Brasil, é licenciado e publicado pela editora JBC desde junho de 2013.
Volumes 1~9 - Genshiken
Volumes 10~Atual - Genshiken Nidaime
Capítulos ainda não compilados em volumes
104. Primeira Vez que te Vejo 初めて君を (Hajimete Kimi o) 105. Adeus, Querido Virgem さらば愛しきDT (Saraba Itoshiki DT) 106. O Rouxinol do Arbusto Permanece em Silêncio 春告げ鳥 未だ鳴かず (Harutsugedori Imada Nakazu) 107. De um Vagão da Linha Tobu 東武線の車窓から (Tōbu Sen no Shasō kara) 108. O Retorno de Yajima リターン・オブ・ヤジマ (Ritān obu Yajima)
Genshiken