Os Campeonatos da Estónia de Ciclismo Contrarrelógio são organizados anualmente para determinar o campeão ciclista da Estónia de cada ano, na modalidade.
O título é outorgado ao vencedor de uma única prova, na modalidade de contrarrelógio individual. O vencedor obtêm o direito de usar a maillot com as cores da bandeira da Estónia até ao campeonato do ano seguinte, unicamente quando disputa provas contrarrelógio.
O corredor mais laureado é Jaan Kirsipuu, com nove vitórias.
Palmares
Masculino 220px|thumb|right|Rein Taaramäe campeão em 2009, 2011 e 2012. Ano Vencedor Segundo Terceiro 1997 Urmo Fuchs Oskari Kargu Otsus Innirek 1998 Jaan Kirsipuu Lauri Aus Margus Salumets 1999 Jaan Kirsipuu Allan Oras Markku Ainsalu 2000 Lauri Aus Jaan Kirsipuu Allan Oras 2001 Jaan Kirsipuu Markku Ainsalu Andre Aduson 2002 Jaan Kirsipuu Margus Salumets Oskari Kargu 2003 Jaan Kirsipuu Lauri Aus Janek Tombak 2004 Jaan Kirsipuu Markku Ainsalu Tarmo Raudsepp 2005 Jaan Kirsipuu Tarmo Raudsepp Andre Aduson 2006 Jaan Kirsipuu Tarmo Raudsepp Andre Aduson 2007 Jaan Kirsipuu Rein Taaramäe Prlit Prous 2008 Tanel Kangert Allan Oras Andre Aduson 2009 Rein Taaramäe Ervin Korts Gert Jõeäär 2010 Tanel Kangert Ervin Korts-Laur Gert Jõeäär 2011 Rein Taaramäe Gert Jõeäär Mart Ojavee 2012 Rein Taaramäe Tanel Kangert Rene Mandri 2013 Tanel Kangert Rein Taaramäe Gert Jõeäär 2014 Gert Jõeäär Alo Jakin Oskar Nisu 2015 Gert Jõeäär Silver Mäoma Timmo Jeret 2016 Gert Jõeäär Silver Mäoma Ivo Suur 2017 Silver Mäoma Gert Jõeäär Norman Vahtra 2018 Tanel Kangert Alo Jakin Norman Vahtra 2019 Rein Taaramäe Karl Patrick Lauk Oskar Nisu 2020 Gleb Karpenko Rait Ärm Markus Pajur 2021 Rein Taaramäe Norman Vahtra Artjom Mirzojev 2022 Rein Taaramäe Tanel Kangert Norman Vahtra
Feminino
campeonato da Estónia CRI (sitiodeciclismo.net)
Estónia Contrarre Estonia