As Molucas foram colonizadas por portugueses, espanhóis, holandeses e ingleses. Finalmente, passaram a fazer parte da Indonésia, após a independência, em 1949.
Abaixo está uma lista de governadores, no período de colonização portuguesa.
Governadores portugueses
Número Nome Data Observações Ref. Jorge de Brito Não tomou posse Foi o primeiro capitão nomeado, morreu em Achém antes de chegar a Maluco, sucedeu-lhe seu irmão, António de Brito. 1 António de Brito 1522-1526 Nomeado por el-rei. Iniciou a construção do Forte de São João Baptista de Ternate. 2 Garcia Henriques 1526-1527 3 Jorge de Meneses 1527-1530 4 Gonçalo Pereira 1530-1531 5 Luís de Andrade 1531 6 Vicente da Fonseca 1531-1533 7 Tristão de Ataíde 1533-1536 8 António Galvão 1536-1539 9 Jorge de Castro 1539-1544 10 Jordão de Freitas 1544-1546 11 Bernardim de Sousa 1546-1549 Primeiro mandato 12 Baltazar Veloso 1549(?) 13 Cristóvão de Sá 1549-1550 Primeiro mandato 14 Bernardim de Sousa 1550-1552 Segundo mandato 15 Cristóvão de Sá 1552-1555(?) Segundo mandato 16 Francisco Lopes de Sousa 1553 17 Duarte de Eça 1555-1558 18 António Pereira Brandão 1558-1560 19 Manuel de Vasconcelos 1560-1561 20 Sebastião Machado 1561 21 Henrique de Sá 1562-1564 22 Álvaro de Mendonça 1564-1566 23 Diogo Lopes de Mesquita de Lima 1567-1570 24 Álvaro de Ataíde 1571-1574 25 Nuno Pereira (de Lacerda) 1574-1575 26 Diogo de Azambuja 1578-1583 Capital transferida para o Forte dos Reis Magos de Tidore 27 Álvaro de Castro 1583 28 Diogo de Azambuja 1583-1586 Segundo mandato 29 Duarte Pereira (de Sampaio) 1583-1588(?) 30 Rui Dias da Cunha 1588-1591(?) 31 Tristão de Sousa 1591-1595(?) 31 Julião de Noronha 1595-1598 32 Rui Gonçalves de Sequeira 1598-1601(?) 33 Manuel de Melo 1601-1603(?) 34 André Furtado de Mendonça 1603 35 Pedro Álvares (Pereira) de Abreu 1604-1605
Bibliografia
Fernão Lopes Castanheda (1553), Historia do descobrimento e conquista da India pelos Portugueses. Livros 4-5, pp. 160, 190, 255-260. Lisboa: Typographia Rollandiana (1833)
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